核小体定位对RNA剪接的影响及组蛋白变体的识别
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| ·课题研究背景 | 第10-11页 |
| ·核小体 | 第11-12页 |
| ·核小体结构 | 第11-12页 |
| ·核小体定位 | 第12页 |
| ·组蛋白 | 第12-15页 |
| ·组蛋白乙酰化 | 第13-14页 |
| ·组蛋白甲基化 | 第14页 |
| ·组蛋白修饰间的级联反应 | 第14-15页 |
| ·mRNA的剪接机制 | 第15-16页 |
| ·mRNA剪接体 | 第15-16页 |
| ·mRNA剪接的调控元件 | 第16页 |
| ·核小体定位的研究进展 | 第16-18页 |
| ·论文的研究内容与安排 | 第18-20页 |
| 第二章 理论方法 | 第20-28页 |
| ·多样性量与多样性增量 | 第20-21页 |
| ·多样性量 | 第20-21页 |
| ·多样性增量 | 第21页 |
| ·二次判别分析 | 第21-22页 |
| ·预测算法的评价与检验 | 第22-24页 |
| ·生物统计学方法 | 第24-27页 |
| ·非参数检验 | 第24-25页 |
| ·相关分析 | 第25-27页 |
| ·k-mer分布 | 第27-28页 |
| 第三章 序列柔性 | 第28-34页 |
| ·引言 | 第28页 |
| ·DNA柔性 | 第28-30页 |
| ·RNA柔性 | 第30-31页 |
| ·RNA柔性的检验 | 第31-34页 |
| 第四章 核小体定位序列的预测 | 第34-40页 |
| ·引言 | 第34页 |
| ·数据集 | 第34-35页 |
| ·核小体定位序列的芯片数据 | 第34-35页 |
| ·核小体定位序列的ChIP-Seq数据 | 第35页 |
| ·信息特征的选取 | 第35-36页 |
| ·预测结果 | 第36-37页 |
| ·基于芯片数据的预测结果 | 第36页 |
| ·基于ChIP-Seq数据的预测结果 | 第36-37页 |
| ·小结 | 第37-40页 |
| 第五章 核小体在剪接位点邻近的定位 | 第40-53页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·数据集 | 第40-41页 |
| ·剪接位点邻近的核小体分布 | 第41-47页 |
| ·人类基因组中组成性剪接位点邻近的核小体分布 | 第41-42页 |
| ·人类基因组中可变剪接位点邻近的核小体分布 | 第42-44页 |
| ·小鼠基因组中剪接位点邻近的核小体分布 | 第44-45页 |
| ·基于DNA柔性的核小体定位预测 | 第45-47页 |
| ·重复序列与核小体定位 | 第47-49页 |
| ·GC含量与核小体定位 | 第49-51页 |
| ·小结 | 第51-53页 |
| 第六章 核小体定位对剪接事件的影响 | 第53-59页 |
| ·引言 | 第53页 |
| ·核小体定位与RNA柔性 | 第53-57页 |
| ·剪接位点邻近RNA序列的柔性分析 | 第53-55页 |
| ·核小体形成能力与RNA柔性 | 第55-57页 |
| ·序列柔性对剪接影响的分析 | 第57-58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第七章 H2A.Z和H2A核小体的识别 | 第59-65页 |
| ·引言 | 第59-60页 |
| ·数据集 | 第60页 |
| ·信息特征的选取 | 第60-61页 |
| ·预测结果 | 第61-63页 |
| ·序列特征比较 | 第63页 |
| ·小结 | 第63-65页 |
| 第八章 总结与展望 | 第65-68页 |
| ·本文工作总结 | 第65-66页 |
| ·工作展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-82页 |
| 附录 | 第82-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 攻读博士学位期间发表和完成的学术论文 | 第93页 |
