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基于细胞识别和事件探测算法对钙成像数据的自动化分析研究及应用

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第9-17页
    1.1 研究背景及意义第9-11页
    1.2 国内外研究现状第11-14页
        1.2.1 细胞识别与分割研究现状第11-13页
        1.2.2 钙事件探测研究现状第13-14页
    1.3 论文的主要工作及创新点第14-16页
        1.3.1 本文主要工作内容第14-15页
        1.3.2 本文主要创新点第15-16页
    1.4 论文的组织结构第16-17页
第2章 相关理论研究第17-33页
    2.1 双光子钙成像第17-19页
    2.2 细胞识别与分割相关方法研究第19-30页
        2.2.1 拉普拉斯高斯算子第19-22页
        2.2.2 卷积神经网络第22-27页
        2.2.3 TWANG算法第27-30页
    2.3 钙事件探测相关方法研究第30-31页
        2.3.1 钙离子浓度与荧光亮度的转换第30页
        2.3.2 钙事件的数学模型构建第30-31页
        2.3.3 钙事件模板提取第31页
    2.4 结果评价方法第31-32页
    2.5 本章小结第32-33页
第3章 细胞识别与分割方法第33-49页
    3.1 数据的获取与预处理第34-36页
        3.1.1 开源细胞图像获取第34页
        3.1.2 真实钙成像细胞图像获取第34-35页
        3.1.3 数据预处理第35-36页
    3.2 细胞识别与分割方法第36-43页
        3.2.1 利用Multi_LoG进行种子点探测第36-37页
        3.2.2 利用CNN模型进行细胞识别第37-42页
        3.2.3 利用TWANG算法进行边缘检测第42-43页
    3.3 实验结果与分析第43-47页
        3.3.1 应用于开源细胞图像的实验结果与分析第43-44页
        3.3.2 应用于真实钙成像细胞图像的实验结果与分析第44-47页
    3.4 本章小结第47-49页
第4章 钙事件探测方法第49-67页
    4.1 数据的获取及预处理第49-54页
        4.1.1 仿真钙事件曲线获取第49-50页
        4.1.2 真实钙成像荧光曲线获取第50-51页
        4.1.3 数据的预处理第51-54页
    4.2 钙事件探测方法第54-59页
        4.2.1 利用特征提取滑动地探测钙事件第54-56页
        4.2.2 利用特征匹配检测钙事件相关位点第56-59页
    4.3 实验结果与分析第59-65页
        4.3.1 应用于仿真钙事件曲线实验结果与分析第59-60页
        4.3.2 应用于真实钙荧光曲线实验结果与分析第60-65页
    4.4 本章小结第65-67页
第5章 总结与展望第67-69页
    5.1 论文工作总结第67-68页
    5.2 未来工作展望第68-69页
参考文献第69-73页
致谢第73-75页
研究生期间发表学术论文第75页

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