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甲状腺激素受体调节剂的计算机辅助研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
英文缩写一览表第10-11页
第一章 绪论第11-24页
    1.1 甲状腺激素受体概况第11-15页
        1.1.1 甲状腺激素受体的结构第11-12页
        1.1.2 甲状腺激素受体的分类第12页
        1.1.3 甲状腺激素受体的作用机制第12-13页
        1.1.4 甲状腺激素及甲状腺激素受体的功能第13-14页
        1.1.5 甲状腺激素受体调节剂第14-15页
    1.2 计算机辅助计算方法介绍第15-22页
        1.2.1 分类方法第15-16页
        1.2.2 二维定量构效关系模型第16-18页
        1.2.3 三维定量构效关系模型第18-19页
        1.2.4 分子对接第19-20页
        1.2.5 分子动力学模拟第20-21页
        1.2.6 药效团模型第21-22页
    1.3 论文研究目的,研究意义,研究内容和研究路线第22-24页
        1.3.1 研究目的第22页
        1.3.2 研究意义第22-23页
        1.3.3 研究内容第23页
        1.3.4 研究路线第23-24页
第二章 基于分类方法研究甲状腺激素受体调节剂第24-37页
    2.1 前言第24页
    2.2 材料与方法第24-33页
        2.2.1 数据集第24-31页
        2.2.2 计算分子描述参数第31页
        2.2.3 构建训练集和测试集第31-32页
        2.2.4 数学方法第32-33页
    2.3 结果与讨论第33-36页
        2.3.1 自组织映射第33页
        2.3.2 C4.5第33页
        2.3.3 随机森林第33-34页
        2.3.4 支持向量机第34-35页
        2.3.5 模型的比较第35-36页
    2.4 本章小结第36-37页
第三章 基于二维定量构效关系方法研究甲状腺激素受体调节剂第37-63页
    3.1 前言第37-38页
    3.2 甲状腺激素受体第一靶点抑制剂活性的预测第38-46页
        3.2.1 材料与方法第38-39页
        3.2.2 结果和讨论第39-45页
        3.2.3 结论第45-46页
    3.3 甲状腺激素受体第二靶点调节剂活性的预测第46-62页
        3.3.1 材料与方法第46-49页
        3.3.2 结果和讨论第49-62页
        3.3.3 结论第62页
    3.4 本章小结第62-63页
第四章 基于三维定量构效关系、分子对接和分子动力学研究甲状腺激素受体调节剂第63-148页
    4.1 前言第63页
    4.2 Sulfonylnitrophenylthiazoles (SNPTs) 作为TRs抑制剂的计算研究第63-77页
        4.2.1 材料与方法第63-67页
        4.2.2 结果和讨论第67-76页
        4.2.3 结论第76-77页
    4.3 二氢化茚衍生物作为TRs调节剂的计算研究第77-95页
        4.3.1 材料与方法第77-81页
        4.3.2 结果和讨论第81-94页
        4.3.3 结论第94-95页
    4.4 类拟甲状腺素衍生物作为TRs调节剂的计算研究第95-118页
        4.4.1 材料与方法第95-104页
        4.4.2 结果和讨论第104-118页
        4.4.3 结论第118页
    4.5 膦酸类衍生物作为TRs调节剂的计算研究第118-134页
        4.5.1 材料与方法第118-120页
        4.5.2 结果和讨论第120-133页
        4.5.3 结论第133-134页
    4.6 β-氨基酮类衍生物作为TRs调节剂的计算研究第134-147页
        4.6.1 材料与方法第134-140页
        4.6.2 结果和讨论第140-146页
        4.6.3 结论第146-147页
    4.7 本章小结第147-148页
第五章 基于反向筛选方法研究甲状腺激素受体调节剂第148-160页
    5.1 前言第148页
    5.2 实验材料和方法第148-150页
        5.2.1 双酪氨酸结构的准备第148-149页
        5.2.2 靶点结构的准备第149页
        5.2.3 反向筛选第149页
        5.2.4 优化实验第149页
        5.2.5 验证实验第149-150页
    5.3 结果和讨论第150-158页
        5.3.1 反向筛选(顺式-双酪氨酸)第150页
        5.3.2 反向筛选(反式-双酪氨酸)第150-151页
        5.3.3 优化实验(顺式-双酪氨酸)第151页
        5.3.4 优化实验(反式-双酪氨酸)第151-152页
        5.3.5 验证实验(顺式-双酪氨酸)第152页
        5.3.6 验证实验(反式-双酪氨酸)第152-153页
        5.3.7 构象分析(顺式-双酪氨酸)第153页
        5.3.8 构象分析(反式-双酪氨酸)第153-158页
    5.4 本章小结第158-160页
第六章 基于药效团模型研究甲状腺激素受体调节剂第160-172页
    6.1 前言第160页
    6.2 材料和方法第160-162页
        6.2.1 数据库介绍第160页
        6.2.2 药效团模型的建立第160-161页
        6.2.3 药效团模型的验证第161页
        6.2.4 虚拟筛选第161-162页
        6.2.5 分子对接第162页
    6.3 结果与讨论第162-171页
        6.3.1 药效团模型的构建第162-163页
        6.3.2 药效团模型的验证第163-165页
        6.3.3 虚拟筛选第165-171页
    6.4 本章小结第171-172页
主要结论与展望第172-174页
    论文主要结论第172-173页
    展望第173-174页
论文主要创新点第174-175页
参考文献第175-190页
附录: 作者在攻读博士学位期间发表的论文第190页

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