| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 前言 | 第13-24页 |
| 1.1 黄单胞菌 | 第13-15页 |
| 1.1.1 水稻条斑病菌 | 第13页 |
| 1.1.2 水稻条斑病菌分离株Xoc GX01 | 第13-14页 |
| 1.1.3 水稻条斑病菌致病因子 | 第14-15页 |
| 1.2 黄单胞菌中质粒研究进展 | 第15-21页 |
| 1.2.1 细菌质粒 | 第15-16页 |
| 1.2.2 黄单胞菌属细菌内源质粒的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.3 水稻条斑病菌内源质粒pXOCgx01的发现 | 第17-18页 |
| 1.2.4 水稻条斑病菌内源质粒pXOCgx01上的功能基因 | 第18-21页 |
| 1.3 质粒载体 | 第21-22页 |
| 1.3.1 质粒载体研究进展 | 第21页 |
| 1.3.2 质粒载体的基本特性 | 第21页 |
| 1.3.3 表达载体 | 第21-22页 |
| 1.3.4 实验室常用质粒载体 | 第22页 |
| 1.4 本研究的主要内容、目的和意义 | 第22-24页 |
| 1.4.1 本研究的主要内容 | 第22-23页 |
| 1.4.2 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 材料与方法 | 第24-54页 |
| 2.1 材料 | 第24-36页 |
| 2.1.1 研究所用菌株 | 第24-25页 |
| 2.1.2 研究所用质粒 | 第25-27页 |
| 2.1.3 研究所用引物 | 第27-29页 |
| 2.1.4 研究所用抗生素及配制 | 第29-30页 |
| 2.1.5 研究所用培养基及配制 | 第30-32页 |
| 2.1.6 研究所用酶制剂、药品试剂及耗材 | 第32页 |
| 2.1.7 研究所用试剂及配置方法 | 第32-35页 |
| 2.1.8 研究所用植株 | 第35-36页 |
| 2.2 常规微生物学操作 | 第36-43页 |
| 2.2.1 菌株的活化、培养及保存 | 第36-37页 |
| 2.2.2 生理生化表型检测 | 第37-38页 |
| 2.2.3 感受态细胞的制备 | 第38-41页 |
| 2.2.4 感受态细胞的转化实验 | 第41-42页 |
| 2.2.5 菌株构建实验 | 第42-43页 |
| 2.3 常规分子生物学操作 | 第43-50页 |
| 2.3.1 细菌基因组总DNA的提取 | 第43-45页 |
| 2.3.2 质粒DNA的提取 | 第45-46页 |
| 2.3.3 DNA的纯化 | 第46页 |
| 2.3.4 酶切与连接 | 第46-47页 |
| 2.3.5 PCR | 第47-49页 |
| 2.3.6 质粒载体末端去磷酸化 | 第49-50页 |
| 2.3.7 琼脂糖凝胶电泳 | 第50页 |
| 2.4 Tn5插入与克隆质粒拯救 | 第50-54页 |
| 2.4.1 Tn5插入反应 | 第50-52页 |
| 2.4.2 转化阳性克隆子筛选 | 第52页 |
| 2.4.3 插入位点定位 | 第52-54页 |
| 第三章 结果与分析 | 第54-81页 |
| 3.1 水稻条斑病菌中国分离株内源质粒分析 | 第54-61页 |
| 3.1.1 含内源质粒的Xoc中国分离株普查 | 第54-57页 |
| 3.1.2 重金属抗逆性相关基因的分析 | 第57-58页 |
| 3.1.3 转座相关基因的分析 | 第58-59页 |
| 3.1.4 T4SS相关基因的分析 | 第59-60页 |
| 3.1.5 Xoc中国分离株内源质粒普查与功能基因分析结果汇总 | 第60-61页 |
| 3.2 质粒载体的构建 | 第61-70页 |
| 3.2.1 pXOCgx01插入Tn5 | 第61页 |
| 3.2.2 获得重组质粒pXTR14k | 第61-62页 |
| 3.2.3 初步验证pXTR14k的表达能力 | 第62-63页 |
| 3.2.4 构建质粒载体pXUC2 | 第63-67页 |
| 3.2.5 质粒载体中间体pXUC2表达能力验证 | 第67页 |
| 3.2.6 替换抗性筛选标记,得到最终质粒载体pXUG、pXUK | 第67-70页 |
| 3.3 穿梭质粒载体的应用 | 第70-81页 |
| 3.3.1 穿梭质粒载体pXUG在黄单胞菌中的应用 | 第71-75页 |
| 3.3.2 穿梭质粒载体pXUK在黄单胞菌中的应用 | 第75-79页 |
| 3.3.3 质粒载体稳定性验证 | 第79-81页 |
| 第四章 总结与讨论 | 第81-86页 |
| 4.1 研究总结 | 第81-83页 |
| 4.1.1 Xoc中国分离株中内源质粒的普查 | 第81页 |
| 4.1.2 其它水稻条斑病菌内源质粒的功能基因 | 第81页 |
| 4.1.3 质粒载体的构建和功能特点 | 第81-82页 |
| 4.1.4 质粒载体的表达能力 | 第82-83页 |
| 4.2 讨论与展望 | 第83-86页 |
| 4.2.1 质粒及其功能基因的普查 | 第83-84页 |
| 4.2.2 质粒载体的构建 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第96页 |
