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长链非编码RNA-RMRP影响胃癌发生的机制及其临床诊断价值研究

摘要第1-8页
Abstract第8-16页
引言第16-19页
1 研究内容和技术路线第19-22页
   ·研究内容第19-21页
     ·建立多种样本lnc RNA提取与定量分析方法第19页
     ·组织RMRP表达水平检测第19页
     ·血浆RMRP水平检测第19页
     ·胃液RMRP水平检测第19-20页
     ·系统分析体液中RMRP来源,明确体液RMRP生物学特性第20页
     ·细胞转染与转染效率第20页
     ·沉默和上调RMRP水平对胃癌细胞生长的影响第20页
     ·建立裸鼠移植瘤动物模型,体内验证RMRP对胃癌细胞生长的影响第20页
     ·分析RMRP影响细胞周期的分子机制第20页
     ·其它lnc RNA与胃癌关系的研究第20-21页
   ·技术路线第21-22页
2 材料与方法第22-35页
   ·材料第22-24页
     ·主要仪器第22-23页
     ·主要试剂第23-24页
     ·实验标本第24页
     ·细胞株第24页
     ·实验动物第24页
     ·伦理批准及受试者知情权第24页
   ·方法第24-35页
     ·样本的采集与保存第24-25页
     ·样本总RNA提取第25-26页
     ·总RNA的定量与完整性检测第26页
     ·q RT-PCR检测第26-29页
     ·细胞培养第29-30页
     ·pc DNA3.1-RMRP表达质粒的构建与扩增第30-32页
     ·RMRP靶向si RNA设计与化学合成第32页
     ·RTCA检测细胞增殖第32页
     ·流式细胞术第32-33页
     ·细胞平板克隆形成试验第33页
     ·动物实验第33-34页
     ·血浆RMRP来源与稳定性实验第34页
     ·统计分析第34-35页
3 实验结果第35-74页
   ·多种样本RNA提取与定量分析方法的建立第35-39页
     ·利用Trizol提取组织总RNA,改良Trizol LS法提取血浆、胃液总RNA第35-36页
     ·非变性 1 %琼脂糖凝胶电泳检测总RNA完整性第36页
     ·实时荧光q RT-PCR测定样本RMRP第36-37页
     ·q RT-PCR产物进行克隆后测序证实样本RMRP存在性第37页
     ·确认血浆和胃液GAPDH水平恒定,是RT-PCR检测lnc RNA的理想参照物第37-39页
   ·q RT-PCR技术检测组织RMRP表达水平第39-44页
     ·分析胃癌组织和配对癌旁组织RMRP表达水平的差异第39-40页
     ·分析胃癌组织RMRP表达水平与患者临床病理因素之间的潜在关系第40-42页
     ·分析胃黏膜异型增生组织和配对正常组织RMRP表达水平的差异第42-43页
     ·横向比较正常胃黏膜组织、良性病变(胃溃疡、胃炎)、癌前病变(异型增生)、胃癌组织中RMRP表达情况第43-44页
   ·q RT-PCR技术检测血浆RMRP水平第44-50页
     ·分析胃癌患者术前、术后2周血浆RMRP水平差异第44页
     ·分析胃癌患者术前血浆RMRP水平与临床病理因素之间的潜在关系第44-46页
     ·分析胃癌患者术后血浆RMRP变化程度与临床病理因素之间的潜在关系第46-48页
     ·横向比较健康人、胃癌术前患者、胃癌术后2周患者血浆RMRP水平第48页
     ·构建ROC曲线确定血浆RMRP作为胃癌筛查标志物的灵敏度与特异度第48-50页
   ·q RT-PCR技术检测胃液RMRP水平第50-54页
     ·分析正常或轻度胃炎、胃溃疡、慢性萎缩性胃炎和胃癌患者胃液RMRP水平差异第50页
     ·分析胃癌患者胃液RMRP水平与临床病理因素之间的潜在关系第50-52页
     ·构建ROC曲线确定胃液RMRP作为胃癌筛查标志物的灵敏度与特异度第52-53页
     ·比较胃液RMRP、CEA和血清CEA在早期胃癌和进展期胃癌中的阳性检出率第53-54页
   ·系统分析体液RMRP来源,明确体液RMRP生物学特性第54-56页
     ·细胞上清试验初步探究RMRP的来源第54-55页
     ·血浆反复冻融试验探究体液RMRP稳定性第55页
     ·血浆不同放置时间和温度试验探究体液RMRP稳定性第55-56页
     ·构建裸鼠胃癌移植瘤动物模型,验证血浆RMRP水平变化第56页
   ·细胞转染与转染效率第56-61页
     ·构建pc DNA3.1-RMRP表达质粒,合成RMRP靶向si RNA第56-57页
     ·梯度转染,确认pc DNA3.1-RMRP表达质粒和靶向si RNA最佳转染浓度第57-58页
     ·验证pc DNA3.1-RMRP表达质粒和靶向si RNA转染效率第58-61页
   ·沉默和上调RMRP表达对胃癌细胞生长的影响第61-69页
     ·沉默和上调胃癌细胞RMRP表达后,实时细胞分析仪检测细胞增殖变化第61-63页
     ·沉默和上调胃癌细胞RMRP表达后,流式细胞仪检测细胞凋亡的变化第63-66页
     ·沉默和上调胃癌细胞RMRP表达后,流式细胞仪检测细胞周期的变化第66-68页
     ·细胞平板克隆形成试验(plate colony formation assay)第68-69页
   ·建立裸鼠移植瘤动物模型,体内验证RMRP对胃癌细胞生长的影响第69-70页
     ·沉默和上调胃癌细胞MGC-803的RMRP表达后,分析其对裸鼠肿瘤生长的影响第69-70页
     ·分析裸鼠接种肿瘤后,血浆RMRP水平的变化第70页
   ·分析RMRP影响细胞周期的分子机制第70-73页
     ·mi Rcode软件预测RMRP下游mi RNA靶标第70-71页
     ·构建RMRP - mi R206 Cyclin D2调控网络第71页
     ·沉默和上调RMRP后,检测Cyclin D2表达水平变化第71-73页
   ·其它长链非编码RNA AA174084、HMlinc RNA717与胃癌关系的研究第73-74页
讨论第74-79页
全文小结第79-80页
参考文献第80-84页
附录A 缩略词第84-86页
附录B 综述第86-103页
 参考文献第97-103页
附录C第103-104页
在学研究成果第104-106页
致谢第106页

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