| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-26页 |
| ·植物寄生线虫 | 第13-17页 |
| ·孢囊线虫简介 | 第13页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的发生危害 | 第13-15页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫生物学特性 | 第15-17页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫传播途径 | 第17页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫致病型研究进展 | 第17-20页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫致病型鉴定国际鉴别寄主 | 第17-18页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫群体致病型变异 | 第18-20页 |
| ·转录组学研究进展 | 第20-23页 |
| ·第一代测序技术的发展 | 第20页 |
| ·第二代测序技术的发展 | 第20-21页 |
| ·RNA 测序(RNA sequencing，RNAseq)技术的发展 | 第21-23页 |
| ·孢囊线虫转录组学的发展 | 第23页 |
| ·本地数据库的建立 | 第23-25页 |
| ·目的意义 | 第25-26页 |
| ·目的 | 第25页 |
| ·意义 | 第25-26页 |
| 第二章 小麦禾谷孢囊线虫（Heterodera avenae）的致病型测定 | 第26-38页 |
| ·实验材料 | 第26-27页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第26页 |
| ·主要试剂及培养基的配制方法 | 第26页 |
| ·供试材料来源 | 第26-27页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的分离检测 | 第27-29页 |
| ·土壤中孢囊的分离 | 第27页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的基因组 DNA 的提取方法 | 第27页 |
| ·孢囊线虫 rDNA-ITS 区域 PCR 扩增验证 | 第27-28页 |
| ·禾谷孢囊线虫的 SCAR 标记检测 | 第28-29页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的孵化收集 | 第29-30页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫致病型室内接种鉴定 | 第30-31页 |
| ·鉴别寄主的种植及 J2s 的接种 | 第30页 |
| ·致病型反应调查统计方法 | 第30页 |
| ·致病型反应鉴定标准 | 第30-31页 |
| ·结果与分析 | 第31-36页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫 rDNA-ITS 区域 PCR 扩增验证结果 | 第31-32页 |
| ·禾谷孢囊线虫 SCAR 标记检测结果 | 第32页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫致病型鉴定结果 | 第32-36页 |
| ·小结与讨论 | 第36-38页 |
| 第三章 小麦禾谷孢囊线虫（Heterodera avenae）转录组 DE NOVO 测序分析 | 第38-56页 |
| ·实验材料 | 第38页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的来源与分离 | 第38页 |
| ·小麦品种的选择 | 第38页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的基因组 DNA 的提取 | 第38页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫的 SCAR 标记检测 | 第38-39页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫 SCAR 标记检测引物 | 第38-39页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫 SCAR 标记引物的验证 PCR 反应 | 第39页 |
| ·禾谷孢囊线虫各龄期虫源的收集 | 第39-41页 |
| ·二龄幼虫的收集 | 第39-40页 |
| ·各龄期幼虫的准备 | 第40页 |
| ·各龄期幼虫的收集 | 第40-41页 |
| ·禾谷孢囊线虫 RNA 的制备 | 第41-42页 |
| ·各龄期禾谷孢囊线虫 RNA 的提取 | 第41-42页 |
| ·提取总 RNA 的纯化 | 第42页 |
| ·RNA 的提取质量检测 | 第42页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫转录组拼接组装及功能注释 | 第42-43页 |
| ·结果与分析 | 第43-54页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫 SCAR 标记检测 | 第43-44页 |
| ·各龄期小麦禾谷孢囊线虫 RNA 的提取 | 第44-45页 |
| ·小麦禾谷孢囊线虫转录组的拼接组装 | 第45页 |
| ·对 3 个转录组分别进行 KEGG、GO、和 Swiss-Prot 数据库功能注释 | 第45-49页 |
| ·禾谷孢囊线虫不同龄期差异表达基因筛选 | 第49-50页 |
| ·效应蛋白鉴定 | 第50-52页 |
| ·RNAi 致死表型基因筛选 | 第52-54页 |
| ·小结与讨论 | 第54-56页 |
| 第四章 全文结论 | 第56-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 附表 1 小麦禾谷孢囊线虫各龄期差异表达基因 | 第66-72页 |
| 附表 1-1 禾谷孢囊线虫转录组侵染前 J2 VS 雌成虫上调表达的基因（24/2905） | 第66-67页 |
| 附表 1-2 禾谷孢囊线虫转录组侵染前 J2 VS 雌成虫下调表达的基因（24/1684） | 第67-68页 |
| 附表 1-3 禾谷孢囊线虫转录组侵染前 J2 VS 侵染后 J4 上调表达的基因（24/1101） | 第68-69页 |
| 附表 1-4 禾谷孢囊线虫转录组侵染前 J2 VS 侵染后 J4 下调表达的基因（24/1894） | 第69-70页 |
| 附表 1-5 禾谷孢囊线虫转录组侵染后 J4 VS 雌成虫上调表达的基因（24/285） | 第70-71页 |
| 附表 1-6 禾谷孢囊线虫转录组侵染后 J4 VS 雌成虫下调表达的基因（24/123） | 第71-72页 |
| 附表 2 小麦禾谷孢囊线虫转录组中 471 个已报道的植物寄生线虫效应因子 | 第72-88页 |
| 附表 3 小麦禾谷孢囊线虫转录组中 117 个未见报道注释（22 个）的效应因子 | 第88-92页 |
| 附表 4 小麦禾谷孢囊线虫转录组中具有 RNAI表型的基因序列（50/376） | 第92-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 作者简历 | 第97页 |
