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基因表达数据的相似性度量和特征提取研究

摘要第1-7页
Abstract第7-11页
第一章 绪论第11-25页
   ·基因表达数据及其信息挖掘的意义第11-17页
     ·基因表达数据简介第11-15页
     ·基因表达数据信息挖掘的意义第15-17页
   ·基因表达数据聚类分类的研究现状第17-20页
     ·基因聚类第17-19页
     ·样本分类第19-20页
   ·基因表达数据聚类分类任务中的关键问题第20-23页
     ·基因聚类任务中的相似性度量问题第20-21页
     ·样本分类任务中的特征提取问题第21-23页
   ·论文的主要内容及章节安排第23-25页
第二章 基于最短路的基因相似性度量第25-39页
   ·共表达基因网络的构建第25页
   ·共表达基因网络中最短路计算第25-27页
   ·实验结果与分析第27-38页
     ·数据简介第27-29页
     ·yeast 数据的聚类分析第29-38页
   ·本章小结第38-39页
第三章 基于网络拓扑结构的基因相似性度量第39-49页
   ·基因关系网络的构建第40页
   ·网络拓扑特征的表征第40-46页
     ·邻域结构特征第40-44页
     ·关于网络拓扑特征表征问题的讨论第44-46页
   ·yeast 数据的聚类分析第46-47页
   ·本章小结第47-49页
第四章 基于样本空间的特征提取第49-63页
   ·经典特征提取方法简介第49-54页
     ·主分量分析(PCA)第49-51页
     ·Fisher 线性鉴别分析(LDA)第51-54页
   ·基于样本空间的 PCA 和 LDA第54-57页
     ·基于样本空间的特征提取思想第55-56页
     ·基于样本空间的特征提取步骤第56-57页
   ·实验结果与分析第57-61页
     ·数据简介第57-58页
     ·特征提取结果与分析第58-61页
   ·本章小结第61-63页
第五章 基于类别保留投影的特征提取第63-83页
   ·类别保留投影(CPP)第64-67页
     ·CPP 的思想第64-66页
     ·CPP 的算法第66-67页
   ·核类别保留投影(KCPP)第67-70页
     ·KCPP 的思想第67-69页
     ·KCPP 的算法第69-70页
   ·实验结果与分析第70-81页
     ·分类方法和性能评价方法第70-73页
     ·CPP 的性能分析第73-80页
     ·KCPP 的性能分析第80-81页
   ·本章小结第81-83页
第六章 总结与展望第83-87页
   ·总结第83-84页
   ·展望第84-87页
致谢第87-89页
参考文献第89-97页
作者攻读博士期间的研究成果和参加的科研项目第97-98页

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