| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-18页 |
| 符号说明及缩写词 | 第18-21页 |
| 第一章 文献综述 | 第21-55页 |
| ·粘细菌简介 | 第21-27页 |
| ·粘细菌的典型特征及分类 | 第21-24页 |
| ·粘细菌产生的次级代谢产物 | 第24-25页 |
| ·纤维堆囊菌的基本性质 | 第25-27页 |
| ·细菌接合的遗传学研究 | 第27-34页 |
| ·细菌接合转移机制 | 第27-28页 |
| ·细菌接合转移质粒 | 第28-30页 |
| ·抗生素分类及细菌的抗生素抗性 | 第30-31页 |
| ·细菌耐药性的传播 | 第31-34页 |
| ·蛋白质组学研究 | 第34-47页 |
| ·蛋白质组学内涵 | 第34-35页 |
| ·蛋白质组学的研究内容及分类 | 第35-36页 |
| ·双向电泳技术在蛋白质组学研究中的应用 | 第36-42页 |
| ·质谱技术在蛋白质组学研究中的应用 | 第42-46页 |
| ·蛋白质组学研究中面临的问题 | 第46-47页 |
| ·定量PCR技术 | 第47-53页 |
| ·定量PCR的含义 | 第47页 |
| ·定量PCR的可行性 | 第47-48页 |
| ·定量PCR方法 | 第48-53页 |
| ·本文工作开展思路及研究内容 | 第53-55页 |
| ·双选择性抗生素促进大肠杆菌间质粒接合转移部分 | 第53-54页 |
| ·Sorangium cellulosum So0157-2蛋白质组学研究部分 | 第54-55页 |
| 第二章 双选择性抗生素作用下的大肠杆菌间质粒接合转移 | 第55-79页 |
| ·引言 | 第55-56页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第56-60页 |
| ·菌株及质粒 | 第56-57页 |
| ·主要培养基 | 第57页 |
| ·主要实验试剂 | 第57-59页 |
| ·主要仪器设备与耗材 | 第59-60页 |
| ·分析网站 | 第60页 |
| ·实验方法 | 第60-65页 |
| ·大肠杆菌菌体培养 | 第60-61页 |
| ·接合质粒验证及转化 | 第61-62页 |
| ·抗性菌株MIC值测定 | 第62-63页 |
| ·大肠杆菌菌株间的接合转移 | 第63-65页 |
| ·实验结果及讨论 | 第65-78页 |
| ·质粒pRK2013、RP4、pSU2007转化及验证结果 | 第65-68页 |
| ·接合菌株MIC值测定结果 | 第68-70页 |
| ·供受体菌株及其抗生素抗性 | 第70页 |
| ·DH5α(pRK2013)/HB101接合转移 | 第70-75页 |
| ·DH5α(RP4)/HB101接合转移 | 第75-76页 |
| ·DH5α(pSU2007)/HB101接合转移 | 第76-78页 |
| 本章小结 | 第78-79页 |
| 第三章 DH5α(pRK2013)/HB101无抗及双选择性抗生素作用下差异蛋白质组学分析 | 第79-115页 |
| ·引言 | 第79-80页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第80-85页 |
| ·菌株及质粒 | 第80页 |
| ·主要培养基 | 第80页 |
| ·主要实验试剂 | 第80-84页 |
| ·主要仪器设备与耗材 | 第84页 |
| ·分析软件及网站 | 第84-85页 |
| ·实验方法 | 第85-92页 |
| ·大肠杆菌菌体培养 | 第85页 |
| ·大肠杆菌菌株间的接合转移 | 第85页 |
| ·接合供受体蛋白提取 | 第85页 |
| ·蛋白纯化(Bio-rad cleanup Kit) | 第85-87页 |
| ·蛋白浓度测定 | 第87页 |
| ·双向电泳操作方法 | 第87-90页 |
| ·染色 | 第90-91页 |
| ·考染蛋白胶内酶解 | 第91页 |
| ·蛋白质谱鉴定 | 第91-92页 |
| ·实验结果及讨论 | 第92-114页 |
| ·DH5α(pRK2013)/HB101双向电泳条件初探 | 第92-97页 |
| ·E.coli DH5α/DH5α(pRK2013)差异蛋白质组实验 | 第97-103页 |
| ·DH5α(pRK2013)/HB101在无抗生素及双选择抗生素作用下,差异蛋白质组实验 | 第103-114页 |
| 本章小结 | 第114-115页 |
| 第四章 oppA,rbsB基因在接合转移中的作用 | 第115-153页 |
| ·引言 | 第115-116页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第116-119页 |
| ·菌株、质粒及引物 | 第116-117页 |
| ·主要培养基 | 第117-118页 |
| ·主要实验试剂 | 第118页 |
| ·主要仪器设备与耗材 | 第118-119页 |
| ·分析软件及网站 | 第119页 |
| ·实验方法 | 第119-130页 |
| ·大肠杆菌菌体培养 | 第119页 |
| ·大肠杆菌菌株间的接合转移 | 第119页 |
| ·Real-Time PCR检测接合12h基因转录水平表达量的变化 | 第119-126页 |
| ·大肠杆菌接合差异蛋白编码基因敲除(λ-red敲除系统) | 第126-130页 |
| ·实验结果及讨论 | 第130-152页 |
| ·差异表达蛋白OppA和RbsB编码基因Real-Time PCR验证 | 第130-135页 |
| ·差异表达蛋白编码基因oppA、rbsB敲除实验 | 第135-138页 |
| ·差异表达蛋白OppA和RbsB编码基因受体敲除接合效率功能验证 | 第138-152页 |
| 本章小结 | 第152-153页 |
| 第五章 纤维堆囊菌So0157-2全蛋白质组数据库建立及其在不同培养条件下的蛋白表达差异 | 第153-185页 |
| ·引言 | 第153-154页 |
| ·实验材料及仪器试剂 | 第154-155页 |
| ·菌株 | 第154页 |
| ·主要培养基 | 第154-155页 |
| ·主要实验试剂 | 第155页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第155页 |
| ·数据库及分析软件 | 第155页 |
| ·实验方法 | 第155-156页 |
| ·菌株培养收集 | 第155-156页 |
| ·菌株蛋白提取纯化及定量 | 第156页 |
| ·双向电泳 | 第156页 |
| ·2D图谱分析 | 第156页 |
| ·胶内酶解及蛋白抽提 | 第156页 |
| ·MALDI-TOF质谱分析及数据库比对 | 第156页 |
| ·实验结果及讨论 | 第156-183页 |
| ·So0157-2双向电泳条件优化及电泳结果 | 第156-161页 |
| ·双向电泳2DE图谱及分析结果 | 第161-168页 |
| ·质谱鉴定结果及数据库比对 | 第168-169页 |
| ·质谱鉴定结果分析 | 第169-183页 |
| 本章小结 | 第183-185页 |
| 总结与展望 | 第185-190页 |
| 参考文献 | 第190-204页 |
| 致谢 | 第204-205页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第205-206页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第206-207页 |
| 英文论文一 | 第207-236页 |
| 英文论文二 | 第236-251页 |
