基于同源建模的蛋白质结构预测方法的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-16页 |
| ·课题背景 | 第9-10页 |
| ·生物信息学 | 第10-12页 |
| ·国内外在该方向的研究现状 | 第12-13页 |
| ·本课题的主要研究内容及组织结构 | 第13-16页 |
| 第2章 蛋白质结构预测过程 | 第16-29页 |
| ·生物信息学中的重要概念 | 第16-22页 |
| ·蛋白质序列的相似性 | 第16页 |
| ·序列的两两比对 | 第16-19页 |
| ·常用分数矩阵 | 第19-21页 |
| ·蛋白质的结构 | 第21-22页 |
| ·同源建模的蛋白质结构预测过程 | 第22-27页 |
| ·实现方案框图 | 第27页 |
| ·本章小结 | 第27-29页 |
| 第3章 目标模板的识别 | 第29-35页 |
| ·NRDB数据库 | 第29页 |
| ·局部对比排列搜索工具BLAST | 第29-34页 |
| ·BLAST的基本介绍 | 第29-31页 |
| ·BLAST的工作原理 | 第31-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第4章 查询序列和目标序列的排列 | 第35-48页 |
| ·排列过程概述 | 第35页 |
| ·Profile-profile比对方法 | 第35-37页 |
| ·数据平滑技术 | 第37-39页 |
| ·加法平滑 | 第38页 |
| ·Good-Turing估计平滑 | 第38-39页 |
| ·数据平滑的具体应用 | 第39页 |
| ·动态规划技术 | 第39-42页 |
| ·实验结果 | 第42-45页 |
| ·HOMSTRAD数据库 | 第43-44页 |
| ·实验数据分析比较 | 第44-45页 |
| ·本章小结 | 第45-48页 |
| 第5章 构建模型与结构合理性评估 | 第48-58页 |
| ·构建模型 | 第48页 |
| ·结构建模工具MODELLER软件包 | 第48-51页 |
| ·MODELLER软件包的概述 | 第48-49页 |
| ·MODELLER的输入文件格式 | 第49页 |
| ·MODELLER的运行与输出 | 第49-51页 |
| ·结构合理性评估 | 第51-52页 |
| ·参加CASP7 对目标序列的评估 | 第52-57页 |
| ·参加的本次CASP7 的介绍 | 第52-53页 |
| ·评估步骤和结果 | 第53-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-62页 |
| 哈尔滨工业大学硕士学位论文原创性声明 | 第62页 |
| 哈尔滨工业大学硕士学位论文使用授权书 | 第62页 |
| 哈尔滨工业大学硕士学位涉密论文管理 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
