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苏云金芽胞杆菌菌株CT-43中苏云金素合成基因簇thuABCDEFG的克隆与合成途径分析

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
缩略语表第13-14页
1 前言第14-39页
   ·苏云金素概况第14-24页
     ·苏云金芽胞杆菌简介第14-16页
     ·苏云金素的特性与结构第16-17页
     ·苏云金素的杀虫机理第17-18页
     ·苏云金素的分离与纯化第18-19页
     ·苏云金素的安全性鉴定第19-21页
     ·苏云金素合成基因的研究现状第21-24页
       ·苏云金素的发现第21-22页
       ·苏云金素的合成与质粒间的关系第22-23页
       ·苏云金素的合成及分泌途径的研究第23-24页
       ·苏云金素蛋白质组水平的研究第24页
   ·抗生素的合成途径第24-30页
     ·抗生素的分类第24-25页
     ·抗生素的作用方式第25页
     ·抗生素的合成方式第25-30页
       ·非核糖体肽合成途径第25-27页
       ·聚酮合成途径第27-29页
       ·聚酮合成酶-非核糖体肽合成酶杂合合成途径第29-30页
   ·细菌素第30-36页
     ·细菌素的定义第30页
     ·细菌素的分类第30-31页
     ·细菌素的生物合成途径第31-33页
     ·细菌素的转录后修饰、激活和运输第33-35页
     ·细菌素生物合成的调控第35页
     ·细菌素操纵子的免疫性第35-36页
     ·细菌素与抗生素的区别第36页
   ·苏云金芽胞杆菌菌株CT-43简介第36-37页
   ·本课题的研究意义第37-39页
2 材料与方法第39-57页
   ·实验材料第39-46页
     ·菌株、质粒第39-45页
     ·培养基第45页
     ·试剂和仪器第45-46页
       ·试剂第45-46页
       ·仪器第46页
   ·实验方法第46-57页
     ·DNA常规操作第46-49页
       ·苏云金芽胞杆菌质粒的制备第46-47页
       ·大肠杆菌质粒DNA的提取第47页
       ·DNA的体外重组操作第47页
       ·大肠杆菌的常规转化第47-48页
       ·苏云金芽胞杆菌的电转化第48页
       ·大肠杆菌转化子的筛选第48-49页
       ·苏云金芽胞杆菌重组菌的筛选第49页
       ·PCR扩增第49页
     ·穿梭载体pEMB0557的构建第49-50页
       ·复制子ori60和红霉素基因的克隆第49页
       ·多余酶切位点的定点突变第49页
       ·重组质粒pEMB0557的构建第49-50页
     ·菌株CT-43基因组大肠杆菌人工染色体文库(BAC文库)的构建第50-52页
       ·基因组DNA片段的制备第50页
       ·细菌人工染色体载体的制备第50-51页
       ·大肠杆菌DH10B电转化感受态细胞的制备第51页
       ·连接与转化第51-52页
       ·文库的筛选与保存第52页
     ·菌株CT-43质粒BAC文库的构建第52页
     ·菌株CT-43基因组苏云金芽胞杆菌BAC文库的构建第52页
     ·Southern杂交第52-53页
     ·含有cry1B基因的苏云金芽胞杆菌大质粒pBMB0558的克隆第53-54页
       ·含有cry1B基因的BAC克隆子的筛选第53页
       ·大质粒pBMB0558重叠连锁群图谱的绘制第53页
       ·可以覆盖整个pBMB0558质粒的BAC克隆子的亚克隆文库的构建第53页
       ·亚克隆文库的测序及序列拼接第53-54页
     ·苏云金素合成基因簇thuABCDEFG的异源表达第54页
     ·苏云金芽胞杆菌CT-43菌株基因中断突变株的筛选第54页
     ·苏云金素的分离纯化第54-55页
       ·有机溶剂萃取法(用于高效液相色谱-HPLC检测)第54-55页
       ·直接过滤法第55页
       ·胞内物质的提取第55页
     ·苏云金素和胞内代谢物的检测第55-56页
       ·苏云金素的高效液相色谱检测第55页
       ·苏云金素和胞内代谢物的飞行质谱检测第55-56页
     ·序列测定和序列分析第56-57页
3 结果与分析第57-90页
   ·苏云金素合成基因所在的大质粒的定位第57-60页
     ·苏云金芽胞杆菌菌株CT-43质粒消除突变株的筛选第57-58页
     ·苏云金芽胞杆菌菌株CT-43及其突变株与cry1B基因之间的关系第58-59页
     ·cry1B基因所在的大质粒的定位第59-60页
   ·含有cry1B基因的大质粒pBMB0558的克隆第60-72页
     ·穿梭载体pEMB0557的构建第60-64页
     ·苏云金芽胞杆菌菌株CT-43大肠杆菌BAC文库的构建第64-66页
       ·菌株CT-43基因组穿梭BAC文库的构建第64-65页
       ·菌株CT-43质粒穿梭BAC文库的构建第65-66页
     ·含有cry1B基因的大质粒pBMB0558重叠连锁群图谱的绘制第66-69页
       ·含有cry1B基因的BAC克隆子的筛选第66页
       ·大质粒pBMB0558重叠连锁群图谱的绘制第66-69页
     ·质粒pBMB0558的序列测定第69-72页
       ·能够覆盖质粒pBMB0558的BAC克隆子的亚克隆文库的构建第69-70页
       ·质粒pBMB0558序列的拼接第70-71页
       ·质粒pBMB0558的序列分析第71-72页
   ·菌株CT-43苏云金芽胞杆菌BAC文库第72-73页
   ·苏云金素表达子的筛选第73-76页
     ·大肠杆菌BAC文库的HPLC筛选第73页
     ·苏云金芽胞杆菌BAC文库的HPLC-MS筛选第73页
     ·功能域的缩短第73-76页
   ·苏云金素合成基因簇thuABCDEFG的生物信息学分析第76-78页
   ·苏云金素合成途径的推导第78-80页
   ·苏云金素合成途径的初步验证第80-90页
     ·基因簇中的thuE基因的中断实验第80-84页
       ·中断载体的构建第81-82页
       ·thuE基因中断突变株的筛选第82-84页
     ·thuE基因中断突变株的飞行质谱(TOF-MS)检测第84-86页
       ·thuE基因中断突变株的胞外检测第84-86页
       ·thuE基因中断突变株的胞内检测第86页
     ·苏云金素生物合成途径的验证第86-90页
4 讨论第90-98页
   ·与苏云金素合成相关的基因第90-94页
     ·thuA基因第90-91页
     ·与组装相关的蛋白第91-92页
     ·苏云金素的产量调控因子第92页
     ·苏云金素的分泌第92-93页
     ·苏云金素的免疫机制第93-94页
   ·苏云金素合成基因簇所在大质粒的功能分析第94-98页
5 总结和创新点第98-99页
参考文献第99-108页
致谢第108-109页
附录 已发表和待发表论文及专利第109页

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