| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-27页 |
| 1 前言 | 第14页 |
| 2 比较基因组学研究进展 | 第14-17页 |
| ·种间比较基因组学研究 | 第14-16页 |
| ·全基因组的比较研究 | 第14-15页 |
| ·系统发生的进化关系分析 | 第15页 |
| ·基因的预测 | 第15页 |
| ·基因组中非编码区域的结构与功能研究 | 第15-16页 |
| ·种内比较基因组学研究 | 第16-17页 |
| ·单核苷酸多态性的发现 | 第16页 |
| ·拷贝数多态性的发现 | 第16-17页 |
| 3 单核苷酸多态性研究进展 | 第17-19页 |
| ·单核苷酸多态性的概念 | 第17页 |
| ·单核苷酸多态性在猪遗传育种中的应用 | 第17-19页 |
| ·标记辅助选择 | 第17页 |
| ·评估遗传多样性 | 第17-18页 |
| ·种质资源鉴定和管理 | 第18页 |
| ·分子遗传图谱构建和基因定位 | 第18页 |
| ·群体起源及群体亲缘关系分析 | 第18-19页 |
| 4 启动子研究进展 | 第19-22页 |
| ·真核生物启动子结构 | 第19-20页 |
| ·启动子克隆方法 | 第20-22页 |
| ·T-DNA标签技术 | 第20-21页 |
| ·基因组文库筛选 | 第21页 |
| ·利用PCR技术克隆启动子 | 第21-22页 |
| ·启动子结构与功能的研究策略 | 第22页 |
| 5 拟研究基因的研究现状 | 第22-27页 |
| ·DGAT基因的种类 | 第23页 |
| ·不同物种DGAT基因的定位及结构 | 第23-24页 |
| ·DGAT基因的功能研究 | 第24-25页 |
| ·与瘦素和胰岛素的关系 | 第24-25页 |
| ·DGAT基因在脂类代谢中的功能和作用 | 第25页 |
| ·DGAT基因多态性与生产性状相关性研究 | 第25-27页 |
| ·DGAT1基因SNPs与生产性状相关性研究 | 第25页 |
| ·DGAT2基因SNPs与生产性状相关性研究 | 第25-27页 |
| 第二章 本研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 第三章 材料与方法 | 第28-45页 |
| 1 试验材料 | 第28-30页 |
| ·试验样品和性状测定 | 第28页 |
| ·DNA样品 | 第28页 |
| ·组织样品 | 第28页 |
| ·性状测定 | 第28页 |
| ·主要仪器和设备 | 第28-29页 |
| ·主要药品及试剂 | 第29页 |
| ·缓冲液和常用试剂的配制 | 第29-30页 |
| 2 试验方法 | 第30-45页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第30-31页 |
| ·猪基因组DNA的浓度测定和质量检测 | 第31页 |
| ·总RNA的提取和浓度测定、质量检测及cDNA第一链的合成 | 第31-32页 |
| ·总RNA的提取 | 第31-32页 |
| ·总RNA浓度的测定和质量检测 | 第32页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第32页 |
| ·猪DGAT1基因启动子区的序列分离、鉴定 | 第32-37页 |
| ·基因组步移库的构建 | 第32-35页 |
| ·基因组PCR步移 | 第35页 |
| ·步移产物的回收和克隆 | 第35-37页 |
| ·猪DGAT1基因启动子区真核表达载体的构建 | 第37-39页 |
| ·引物设计 | 第37页 |
| ·目的片段的双酶切 | 第37页 |
| ·连接 | 第37-38页 |
| ·重组质粒的原核表达及鉴定 | 第38页 |
| ·质粒抽提及双酶切鉴定 | 第38-39页 |
| ·猪DGAT2基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第39-41页 |
| ·DGAT2基因cDNA扩增的引物设计 | 第39页 |
| ·利用RT-PCR方法扩增DGAT2基因cDNA片度 | 第39-40页 |
| ·PCR产物的回收纯化、克隆和测序 | 第40页 |
| ·所获DNA序列的生物信息学分析 | 第40-41页 |
| ·猪DGAT2基因基因组序列的克隆、测序 | 第41-42页 |
| ·引物设计 | 第41页 |
| ·PCR扩增及序列测定 | 第41-42页 |
| ·猪DGAT基因的表达分析 | 第42页 |
| ·DGAT1基因RT-PCR组织表达谱分析 | 第42页 |
| ·DGAT2基因荧光定量PCR表达分析 | 第42页 |
| ·猪DGAT基因的多态性分析 | 第42-45页 |
| ·引物设计 | 第42-43页 |
| ·酶切条件 | 第43页 |
| ·基因分型 | 第43页 |
| ·多态标记与生产性状的关联分析方法 | 第43-45页 |
| 第四章 结果与分析 | 第45-65页 |
| 1 猪基因组DNA以及总RNA的提取与质量检测结果 | 第45页 |
| 2 猪DGAT1基因启动子的克隆及生物信息学分析 | 第45-50页 |
| ·猪DGAT1基因启动子的获得 | 第45-48页 |
| ·生物信息学预测DGAT1基因核心启动子区及转录因子结合位点 | 第48-50页 |
| 3 猪DGAT1基因启动子区真核表达载体的构建 | 第50-51页 |
| 4 猪DGAT2基因cDNA及部分基因组克隆测序及序列分析 | 第51-56页 |
| ·猪DGAT2基因编码序列RT-PCR结果 | 第51-52页 |
| ·猪DGAT2基因部分基因组PCR结果 | 第52页 |
| ·猪DGAT2基因序列的生物信息学分析 | 第52-56页 |
| 5 猪DGAT基因的表达分析 | 第56-57页 |
| ·DGAT1基因的组织表达谱分析 | 第56页 |
| ·DGAT2基因荧光定量PCR表达分析 | 第56-57页 |
| 6 猪DGAT基因的SNP检测及其与生产性状的关联分析 | 第57-65页 |
| ·猪DGAT1基因多态性检测及其与生产性状的关联分析 | 第57-61页 |
| ·DGAT2基因多态性检测及其与生产性状的关联分析 | 第61-65页 |
| 第五章 讨论 | 第65-71页 |
| 1 启动子的克隆方法 | 第65-66页 |
| 2 DGAT1启动子分析 | 第66页 |
| 3 关于猪DGAT1启动子区真核表达载体的构建 | 第66-67页 |
| 4 利用电子克隆策略分离猪新基因 | 第67-68页 |
| 5 关于DGAT基因的表达分析 | 第68-69页 |
| ·DGAT1基因RT-PCR组织表达谱分析 | 第68页 |
| ·DGAT2基因Real-time PCR表达分析 | 第68-69页 |
| 6 分子标记的遗传效应分析 | 第69-70页 |
| ·DGAT1基因启动子区PvuⅡ-RFLP的遗传效应分析 | 第69页 |
| ·DGAT2基因第七外显子BssNAⅠ-RFLP的遗传效应分析 | 第69-70页 |
| 7 下一步工作 | 第70-71页 |
| 小结 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 致谢 | 第77页 |
