| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-37页 |
| 1 微卫星标记开发方法研究进展 | 第13-20页 |
| ·微卫星标记概述 | 第13-17页 |
| ·微卫星的分类及其分布 | 第13-14页 |
| ·微卫星的特点 | 第14页 |
| ·微卫星多态性产生的机理 | 第14-15页 |
| ·微卫星的应用 | 第15-16页 |
| ·微卫星标记的不足之处 | 第16-17页 |
| ·微卫星标记的开发方法 | 第17-20页 |
| ·经典法 | 第17-18页 |
| ·富集法 | 第18页 |
| ·省略筛库法 | 第18页 |
| ·ISSR 片段扩增法 | 第18-19页 |
| ·数据库检索法 | 第19-20页 |
| 2 微卫星标记在海洋贝类群体遗传多样性研究中的应用 | 第20-26页 |
| ·遗传多样性的概念及其产生 | 第20-21页 |
| ·遗传多样性的概念 | 第20页 |
| ·遗传多样性的产生 | 第20-21页 |
| ·遗传多样性检测方法的发展 | 第21-23页 |
| ·形态学标记 | 第21页 |
| ·细胞学标记 | 第21-22页 |
| ·生化标记 | 第22页 |
| ·分子标记 | 第22-23页 |
| ·遗传多样性的研究意义 | 第23页 |
| ·基于微卫星标记的海洋贝类群体遗传多样性的研究 | 第23-26页 |
| ·利用微卫星分析群体的遗传结构 | 第24页 |
| ·养殖群体的遗传多样性的监测 | 第24-26页 |
| 3 分子系统发生学研究进展及其在贝类中的应用 | 第26-34页 |
| ·分子系统学的发展及研究意义 | 第26-27页 |
| ·分子系统学的概念 | 第26页 |
| ·分子系统学发展简史 | 第26-27页 |
| ·分子系统学的研究意义 | 第27页 |
| ·分子系统学的研究方法 | 第27-29页 |
| ·分子系统树的构建 | 第29-32页 |
| ·分子系统发生学在贝类中的应用 | 第32-34页 |
| 4 中国蛤蜊的生物学特性及养殖现状 | 第34-36页 |
| ·中国蛤蜊的分类学地位及其生物学特征 | 第34页 |
| ·中国蛤蜊的分布及养殖现状 | 第34-36页 |
| 5 本研究的总体设计和研究策略 | 第36-37页 |
| 第二章 中国蛤蜊微卫星分子标记的开发 | 第37-54页 |
| 0 引言 | 第37页 |
| 1 材料与方法 | 第37-46页 |
| ·实验材料 | 第37页 |
| ·实验方法 | 第37-46页 |
| ·样品处理 | 第37页 |
| ·DNA 提取 | 第37-39页 |
| ·富集文库的构建 | 第39-42页 |
| ·TA 克隆与PCR 筛选 | 第42-43页 |
| ·序列的测定、分析及引物设计 | 第43-44页 |
| ·引物的筛选 | 第44页 |
| ·群体多态性的检测 | 第44-45页 |
| ·结果记录及数据分析 | 第45-46页 |
| 2 结果 | 第46-52页 |
| ·DNA 酶切结果 | 第46页 |
| ·蓝白斑筛选 | 第46-47页 |
| ·PCR 筛选结果 | 第47-48页 |
| ·测序结果 | 第48-49页 |
| ·多态性微卫星引物的筛选结果 | 第49-52页 |
| 3 讨论 | 第52-54页 |
| ·杂交选择法与FIASCO 法的比较 | 第52页 |
| ·磁珠杂交探针的选取 | 第52-53页 |
| ·引物的设计 | 第53页 |
| ·无效等位基因 | 第53-54页 |
| 第三章 中国蛤蜊群体的微卫星分析 | 第54-65页 |
| 0 引言 | 第54-55页 |
| 1 材料与方法 | 第55-57页 |
| ·实验材料 | 第55-56页 |
| ·实验方法 | 第56-57页 |
| ·模板DNA 的提取 | 第56页 |
| ·PCR 扩增与多态性检测 | 第56页 |
| ·数据的统计与分析 | 第56-57页 |
| 2 结果 | 第57-62页 |
| ·群体内遗传多样性 | 第57-59页 |
| ·群体间的遗传分化 | 第59-61页 |
| ·距离产生分化（Isolation by Distance，IBD）模式 | 第61页 |
| ·地理阻隔预测 | 第61-62页 |
| 3 讨论 | 第62-65页 |
| ·遗传多样性 | 第62页 |
| ·哈迪—温伯格平衡 | 第62-63页 |
| ·群体遗传结构 | 第63-64页 |
| ·与海流和半岛相关的地理分化 | 第64-65页 |
| 第四章 蛤蜊科贝类 DNA 条形码及系统发育研究 | 第65-78页 |
| 0 引言 | 第65页 |
| 1 材料与方法 | 第65-69页 |
| ·实验材料 | 第65-67页 |
| ·实验方法 | 第67-69页 |
| ·模板DNA 的提取 | 第67页 |
| ·PCR 扩增与测序 | 第67页 |
| ·序列的处理与分析 | 第67-69页 |
| 2 结果 | 第69-75页 |
| ·序列特征 | 第69页 |
| ·条形码间隙 | 第69-71页 |
| ·分子系统发生树 | 第71-75页 |
| 3 讨论 | 第75-78页 |
| ·DNA 条形码 | 第75-76页 |
| ·条形码间隙 | 第76页 |
| ·基于邻接关系的条形码分析 | 第76-77页 |
| ·系统发育关系 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 个人简历 | 第87页 |
| 硕士期间学术成果 | 第87页 |