| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-32页 |
| ·关于MIRNA 基因 | 第12-23页 |
| ·miRNA 的发现 | 第12-13页 |
| ·siRNA 及其与miRNA 之间的关系 | 第13页 |
| ·miRNA 的加工调控 | 第13-18页 |
| ·miRNA 的特点 | 第18页 |
| ·miRNA 的作用机制 | 第18-20页 |
| ·miRNA 的功能 | 第20-23页 |
| ·数据挖掘与支持向量机 | 第23-29页 |
| ·生物信息与数据挖掘 | 第23-24页 |
| ·统计学习理论与支持向量机 | 第24-26页 |
| ·SVM 的基本原理及其应用 | 第26-28页 |
| ·SVM 与神经网络的对比 | 第28-29页 |
| ·MIRNA 的实验克隆及计算识别 | 第29-30页 |
| ·miRNA 的克隆 | 第29页 |
| ·生物信息学分析 | 第29-30页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第30-32页 |
| 第二章 基于支持向量机识别MIRNA 基因 | 第32-44页 |
| ·基于支持向量机识别MIRNA 的前体 | 第32-38页 |
| ·材料和方法 | 第32-34页 |
| ·结果 | 第34-37页 |
| ·讨论 | 第37-38页 |
| ·资源共享 | 第38页 |
| ·基于支持向量机方法分类5’和3’PRE-MIRNA | 第38-43页 |
| ·材料和方法 | 第38-39页 |
| ·结果 | 第39-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| ·资源共享 | 第43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第三章 植物MIRNA 的预测及其靶标分析 | 第44-78页 |
| ·水稻MIRNA 及其靶标的预测 | 第44-60页 |
| ·材料与方法 | 第44-47页 |
| ·结果与分析 | 第47-59页 |
| ·讨论 | 第59-60页 |
| ·mature_SVM 资源 | 第60页 |
| ·拟南芥MIRNA 的预测 | 第60-66页 |
| ·材料与方法 | 第60-61页 |
| ·结果 | 第61-66页 |
| ·讨论 | 第66页 |
| ·资源共享 | 第66页 |
| ·小麦MIRNA 及其靶标的预测 | 第66-76页 |
| ·材料与方法 | 第67-68页 |
| ·结果与分析 | 第68-75页 |
| ·讨论 | 第75-76页 |
| ·本章小结 | 第76-78页 |
| 第四章 小麦 MIRNA 的克隆及分析 | 第78-92页 |
| ·材料与方法 | 第78-83页 |
| ·小麦 | 第78页 |
| ·引物 | 第78页 |
| ·克隆载体及菌株 | 第78页 |
| ·培养基及其他溶液的配制 | 第78页 |
| ·小麦总 RNA 的提取 | 第78-79页 |
| ·小麦小分子量 RNA 的粗提 | 第79页 |
| ·小分子 RNA 的分离纯化 | 第79-80页 |
| ·3’端多聚腺苷化反应 | 第80-81页 |
| ·逆转录反应 | 第81页 |
| ·cDNA 链3'端的多聚鸟苷酸化反应 | 第81页 |
| ·PCR 扩增 | 第81-82页 |
| ·序列分析 | 第82页 |
| ·Northen Blot 杂交 | 第82页 |
| ·小 RNA 文库构建策略 | 第82-83页 |
| ·结果与分析 | 第83-91页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第83-84页 |
| ·小分子量 RNA 的分离 | 第84页 |
| ·小分子量 RNA 的扩增 | 第84-86页 |
| ·小分子量 RNA 的克隆及筛选 | 第86页 |
| ·序列分析 | 第86-90页 |
| ·MiRNA 在小麦中的表达分析 | 第90-91页 |
| ·讨论 | 第91-92页 |
| 第五章 结论与创新点 | 第92-95页 |
| ·结论 | 第92-93页 |
| ·创新点 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-103页 |
| 附录1：RP-SVM 及 FS-SVM 的应用 | 第103-107页 |
| 附录2：17 个单一小分子RNA 的测序结果 | 第107-110页 |
| 附录3：缩略词中英文对照 | 第110-113页 |
| 致谢 | 第113-114页 |
| 作者简介 | 第114页 |