| 中文摘要 | 第1-4页 |
| 英文摘要 | 第4-12页 |
| 第一章 综述部分 | 第12-38页 |
| 第一节 蛋白质复杂体系分级及鉴定方法的研究进展 | 第12-19页 |
| 摘要 | 第12页 |
| 关键词 | 第12页 |
| 引言 | 第12页 |
| 1 蛋白质复杂体系分级及鉴定方法研究的意义 | 第12-13页 |
| 2 蛋白质分级及鉴定方法研究的实验思路 | 第13-14页 |
| 3 蛋白质组学的分级及鉴定方法 | 第14-18页 |
| ·凝胶分级与质谱联用 | 第14-15页 |
| ·非凝胶分级与质谱联用 | 第15-18页 |
| 展望 | 第18-19页 |
| 第二节 疾病血浆蛋白质组学的研究进展 | 第19-32页 |
| 摘要 | 第19页 |
| 关键词 | 第19页 |
| 引言 | 第19页 |
| 1 疾病血浆蛋白质组学研究的意义 | 第19-20页 |
| 2 血浆蛋白质组学 | 第20-23页 |
| ·血浆蛋白质的定义和分类 | 第20页 |
| ·血浆蛋白质组学的特点 | 第20-21页 |
| ·人类血浆蛋白质组计划 | 第21页 |
| ·血浆蛋白质组学研究遇到的问题 | 第21-23页 |
| 3 疾病血浆蛋白质组学研究的实验思路和技术策略 | 第23-27页 |
| ·疾病血浆蛋白质组学研究的实验思路 | 第23页 |
| ·应用于疾病血浆蛋白质组学研究的技术策略 | 第23-27页 |
| 4 糖尿病研究现状 | 第27-30页 |
| ·糖尿病的病因 | 第28页 |
| ·糖尿病的分类 | 第28-30页 |
| ·糖尿病的并发症 | 第30页 |
| ·血浆蛋白质组与糖尿病 | 第30页 |
| 5 疾病血浆蛋白质组研究进展 | 第30-31页 |
| 展望 | 第31-32页 |
| 参考文献 | 第32-38页 |
| 第二章 蛋白质复杂体系分级及鉴定方法的研究 | 第38-64页 |
| 第一节 采用液相等电聚焦与二维液相色谱串联质谱联用方法进行大规模的蛋白质分级及鉴定 | 第38-52页 |
| 摘要 | 第38页 |
| 关键词 | 第38页 |
| 1 前言 | 第38-39页 |
| 2 实验部分 | 第39-42页 |
| ·样品制备 | 第39-40页 |
| ·液相等电聚焦预分级 | 第40页 |
| ·一维凝胶电泳分析 | 第40页 |
| ·双向凝胶电泳分析 | 第40-41页 |
| ·凝胶染色及图像分析 | 第41页 |
| ·去除两性电解质、盐类和溶液内酶解 | 第41页 |
| ·二维液相色谱串联质谱分析 | 第41-42页 |
| ·数据分析 | 第42页 |
| 3 结果和讨论 | 第42-50页 |
| ·液相等电聚焦的样品制备方法 | 第42页 |
| ·液相等电聚焦分级蛋白质混合物的效果 | 第42-45页 |
| ·溶液内酶解过程的优化 | 第45页 |
| ·采用二维液相色谱串联质谱进行蛋白质鉴定 | 第45-46页 |
| ·液相等电聚焦过程中蛋白质的分布模式 | 第46-47页 |
| ·蛋白质的特性概述 | 第47-50页 |
| ·蛋白质的功能分类 | 第50页 |
| 4 小结 | 第50-52页 |
| 第二节 采用多维液相色谱与二维液相色谱串联质谱联用方法对蛋白质复杂体系进行大规模的分级及鉴定 | 第52-59页 |
| 摘要 | 第52页 |
| 关键词 | 第52页 |
| 1 前言 | 第52-53页 |
| 2 实验部分 | 第53-55页 |
| ·仪器和实验材料 | 第53页 |
| ·试剂 | 第53页 |
| ·人血浆样品的制备 | 第53页 |
| ·多维液相色谱分级 | 第53-54页 |
| ·样品制备 | 第54页 |
| ·二维液相色谱串联质谱分析 | 第54-55页 |
| ·数据分析 | 第55页 |
| 3 结果和讨论 | 第55-58页 |
| ·实验流程及结果 | 第55-56页 |
| ·多维液相色谱分级对人类血浆蛋白质进行分离鉴定的优势 | 第56-57页 |
| ·人类血浆中的低丰度蛋白质和生物标志物 | 第57-58页 |
| 4 小结 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 第三章 采用凝胶分级与质谱联用的方法研究糖尿病大鼠发病过程中的血浆蛋白质组变化 | 第64-88页 |
| 摘要 | 第64页 |
| 关键词 | 第64-65页 |
| 1 前言 | 第65-66页 |
| 2 实验部分 | 第66-68页 |
| ·仪器和实验材料 | 第66页 |
| ·试剂 | 第66-67页 |
| ·实验动物 | 第67页 |
| ·常规生化指标的跟踪测定及生物信息学分析 | 第67页 |
| ·一维凝胶电泳分级及胶内酶解 | 第67-68页 |
| ·一维液相色谱串联质谱分析 | 第68页 |
| ·数据库搜索及生物信息学分析 | 第68页 |
| 3 结果 | 第68-79页 |
| ·实验设计 | 第68-69页 |
| ·GK大鼠和Wistar大鼠常规生化指标的跟踪测定及统计分析 | 第69-73页 |
| ·一维凝胶电泳图谱 | 第73-74页 |
| ·质谱鉴定结果 | 第74-75页 |
| ·生物信息学分析 | 第75-79页 |
| 4 讨论 | 第79-83页 |
| ·利用血浆蛋白质组学策略研究GK大鼠糖尿病发病过程的意义 | 第79-80页 |
| ·通过系统聚类分析选取GK大鼠和Wistar大鼠 | 第80-81页 |
| ·凝胶分级与质谱联用方法在血浆蛋白质分级及鉴定中的优势 | 第81页 |
| ·去除发育因素后GK大鼠的血浆蛋白质表达谱 | 第81-82页 |
| ·14 种映射到基因调控网络中的蛋白质的功能阐述 | 第82-83页 |
| 5 小结 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-88页 |
| 第四章 采用非标记定量策略利用大规模的蛋白质分级及鉴定方法在人类血清中寻找糖尿病相关的蛋白质标志物 | 第88-122页 |
| 摘要 | 第88页 |
| 关键词 | 第88-89页 |
| 1 前言 | 第89-90页 |
| 2 实验部分 | 第90-93页 |
| ·仪器和实验材料 | 第90-91页 |
| ·试剂 | 第91页 |
| ·人血清样品处理 | 第91页 |
| ·一维凝胶电泳、胶内酶解和一维液相色谱串联质谱分析 | 第91-92页 |
| ·乙醇沉淀法分级血清蛋白质、溶液内酶解和一体柱串联质谱分析 | 第92-93页 |
| ·数据库搜索和生物信息学分析 | 第93页 |
| 3 采用凝胶分级与质谱鉴定联用方法寻找糖尿病相关的蛋白质标志物 | 第93-108页 |
| ·结果 | 第93-101页 |
| ·实验设计 | 第93-94页 |
| ·血清样品的临床信息 | 第94页 |
| ·质谱鉴定结果 | 第94-95页 |
| ·自组织图分析 | 第95-96页 |
| ·亚细胞定位分析 | 第96-97页 |
| ·通路预测及定量偏好性分析 | 第97-98页 |
| ·特定通路的细胞组成和生物过程分析 | 第98-101页 |
| ·免疫印迹试验验证 | 第101页 |
| ·讨论 | 第101-106页 |
| ·采用自组织图分析非糖尿病人和糖尿病人的血清蛋白质组差异 | 第101-102页 |
| ·特定通路的定量偏好性分析及其在糖尿病人血清中的应用 | 第102-103页 |
| ·补体系统与糖尿病的关系 | 第103-106页 |
| ·小结 | 第106-108页 |
| 4 在个体水平上采用乙醇沉淀分级与一体柱串联质谱联用的方法从血清中寻找糖尿病相关的蛋白质标记物 | 第108-119页 |
| ·结果 | 第108-115页 |
| ·实验设计 | 第108页 |
| ·血清样本的临床信息 | 第108-109页 |
| ·乙醇沉淀法分级血清蛋白质的重复性和沉淀效率 | 第109-111页 |
| ·质谱鉴定结果 | 第111-112页 |
| ·30 例临床样本的系统聚类分析 | 第112-114页 |
| ·241 种具有显著性差异的蛋白质的系统聚类法分析 | 第114-115页 |
| ·讨论 | 第115-119页 |
| ·乙醇沉淀法分级血清蛋白质的优势 | 第115-116页 |
| ·结合临床性状对糖尿病人的血清蛋白质组数据进行分析 | 第116-119页 |
| 5 小结 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-122页 |
| 附录3-1 283 种具有统计意义的蛋白质 | 第122-129页 |
| 附录3-2 14 种具体对应到基因转录调控网络中的蛋白质 | 第129-130页 |
| 附录4-1a 只在糖尿病人血清中鉴定到的蛋白质 | 第130-136页 |
| 附录4-2b 补体系统鉴定到蛋白质进行细胞组成分类的结果 | 第136-138页 |
| 附录4-3 241种具有显著性差异的蛋白质 | 第138-145页 |
| 附录：论文缩写 | 第145-148页 |
| 已发表的文章目录 | 第148-150页 |
| 准备发表的文章目录 | 第150-151页 |
| 致谢 | 第151页 |
