| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 前言 | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-24页 |
| ·硫酯酶概述 | 第8-15页 |
| ·硫酯酶的定义 | 第8页 |
| ·硫酯酶的分类及功能 | 第8页 |
| ·Acyl-CoA TE的功能及催化机理 | 第8-15页 |
| ·Acyl-CoA TE在脂肪酸合成中的作用 | 第8-10页 |
| ·Acyl-CoA TE在脂肪酸氧化中的作用 | 第10-12页 |
| ·Ⅱ型硫酯酶的功能及作用机理 | 第12-15页 |
| ·分子进化与系统发育概述 | 第15-19页 |
| ·系统发育树的构建方法 | 第17-18页 |
| ·系统发育树的评价方法 | 第18-19页 |
| ·本课题所使用的系统发育分析软件 | 第19页 |
| ·计算机辅助药物设计方法 | 第19-22页 |
| ·概述 | 第19-20页 |
| ·CADD方法分类 | 第20-22页 |
| ·基于配体的药物设计方法 | 第20-21页 |
| ·基于受体的药物设计方法 | 第21页 |
| ·与组合化学相结合的药物设计方法 | 第21-22页 |
| ·本课题的研究方法 | 第22页 |
| ·本课题研究意义及内容 | 第22-24页 |
| 第二章 基于序列的硫酯酶系统发育分析 | 第24-38页 |
| ·概述 | 第24-25页 |
| ·材料与方法 | 第25-28页 |
| ·氨基酸序列的获得与筛选 | 第25-27页 |
| ·系统发育分析法 | 第27-28页 |
| ·结果与讨论 | 第28-36页 |
| ·链霉菌acyl-CoA thioesteraseⅡ系统发育分析 | 第28-35页 |
| ·简介 | 第28-29页 |
| ·基于序列的acyl-CoA TEⅡ系统发育及功能分析 | 第29-31页 |
| ·基于结构的acyl-CoA TEⅡ系统发育及功能分析 | 第31-35页 |
| ·链霉菌acyl-CoA thioesteraseⅡ功能推测 | 第35-36页 |
| ·小结 | 第36-38页 |
| 第三章 硫酯酶同底物相互作用的分子模拟研究 | 第38-54页 |
| ·概述 | 第38-43页 |
| ·硫酯酶结构分析 | 第38-43页 |
| ·实验蛋白来源、计算软件及方法 | 第43-46页 |
| ·蛋白分子及结构文件来源 | 第43页 |
| ·计算平台及软件 | 第43-44页 |
| ·计算所用软件、方法及评价打分函数 | 第44-46页 |
| ·计算软件 | 第44页 |
| ·对接方法 | 第44-45页 |
| ·评价打分函数 | 第45-46页 |
| ·受体蛋白和配体分子的优化 | 第46-47页 |
| ·受体蛋白的准备 | 第46页 |
| ·配体分子的准备及优化 | 第46-47页 |
| ·分子对接计算及结果 | 第47-51页 |
| ·实验结果分析 | 第51-52页 |
| ·小结 | 第52-54页 |
| 第四章 结论与展望 | 第54-56页 |
| ·结论 | 第54页 |
| ·前景与展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
