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棉花纤维发育的蛋白质组学研究

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-17页
缩略词符号单位第17-20页
第一部分 文献综述第20-65页
 第一章 棉花纤维发育研究进展第20-34页
  一、细胞壁与棉花纤维第20-23页
   (一) 细胞壁的化学第20-21页
    1. 单糖第20页
    2. 细胞壁的大分子第20-21页
   (二) 细胞壁的构架第21页
   (三) 细胞壁的生物合成和装配第21-22页
   (四) 细胞壁与生长第22-23页
   (五) 细胞壁可以成为食物、饲料和纤维第23页
  二、棉花纤维发育的研究进展第23-34页
   (一) 结构植物学研究第23-25页
    1. 纤维细胞的分化第23页
    2. 纤维细胞的起始发育第23-24页
    3. 纤维伸长第24页
    4. 次生壁的合成第24-25页
    5. 纤维的成熟第25页
   (二) 分子生物学研究第25-31页
    1. 纤维原始细胞分化和突起第25-26页
    2. 纤维伸长第26-30页
    3. 从初生壁合成向次生壁合成的转变第30页
    4. 棉花纤维次生壁形成的分子机制第30-31页
    5. 棉花纤维成熟的分子机制第31页
   (三) 基因组学研究第31-33页
    1. 棉花遗传图谱研究进展第31-32页
    2. 棉花纤维发育的功能基因组学研究第32-33页
   (四) 蛋白质组学研究第33-34页
 第二章 蛋白质组学第34-65页
  一、从功能基因组学到蛋白质组学第34-36页
   (一) 功能基因组学的研究内容第34-35页
    1. DNA水平第35页
    2. RNA水平第35页
    3. 蛋白质水平第35页
    4. 系统生物学第35页
   (二) 功能基因组学的研究方法第35-36页
    1. 表达序列标签与基因组测序分析第35-36页
    2. 功能基因表达谱第36页
    3. 反求遗传学研究第36页
    4. 蛋白组研究第36页
  二、蛋白质组学研究的内容与意义第36-38页
   (一) 蛋白质组学的概念第36-37页
   (二) 进行蛋白质组学研究必要性和意义第37页
   (三) 蛋白质组学研究的内容第37-38页
  三、蛋白质组学研究技术第38-57页
   (一) 蛋白质的分离第38-52页
    1. 样品制备和溶解第39-43页
    2. IEF第43-45页
    3. IPG胶条的平衡第45-46页
    4. 第二向电泳: SDS-PAGE第46页
    5. 蛋白质的检测和定量第46-50页
    6. 2-D图像的计算机分析和数据库建立第50-51页
    7. 自动化程序第51-52页
   (二) 蛋白质的质谱鉴定第52-54页
   (三) 生物信息学第54-57页
  四、植物蛋白质组学研究进展第57-64页
   (一) 植物蛋白质的表达谱研究第57-59页
   (二) 翻译后修饰第59-61页
   (三) 蛋白质-蛋白质相互作用第61-62页
   (四) 蛋白质生物信息学第62-64页
  本研究的目的与意义第64-65页
第二部分 研究报告第65-131页
 第三章 适用于蛋白质组学研究的聚丙烯酰胺胶中蛋白质染色方法的研究第65-75页
  1 材料与方法第65-66页
   ·电泳样品准备第65页
   ·电泳第65-66页
  2 结果与分析第66-73页
   ·16种染色-脱色方法的效果评价第66-68页
   ·胶体CBB G-250染色方法及其配方分析第68-70页
   ·影响胶体CBBG-250染色效果的其它实验因素第70-72页
   ·与银染效果的比较第72-73页
  3 讨论第73-74页
  4 结论第74-75页
 第四章 棉花纤维和胚珠蛋白质提取方法以及电泳技术的研究第75-85页
  1 材料与方法第75-77页
   ·植物材料第75页
   ·试验方法第75-77页
  2 结果和分析第77-82页
   ·两种方法提取的蛋白质重量的比较第77页
   ·两种方法提取的蛋白质的2D胶图谱的比较第77-79页
   ·从样品中去除酚类干扰物质第79-80页
   ·蛋白质裂解液对棉花蛋白质2-DE的影响第80-81页
   ·IEF不同上样方法对棉花蛋白质2-DE的影响第81-82页
  3 讨论第82-84页
  4 结论第84-85页
 第五章 蛋白质组学研究中的生物信息学分析第85-99页
  1 材料与方法第85-87页
   ·试验材料第85页
   ·试验方法第85-86页
   ·数据分析与生物信息学鉴定第86-87页
  2 结果和分析第87-95页
   ·不同发育阶段的棉花纤维蛋白质2-DE胶图谱比较第87-88页
   ·蛋白质胶内酶切后的质谱分析第88-89页
   ·用 PMF搜索蛋白质数据库第89-92页
   ·用MS/MS数据进行蛋白质数据库搜索第92-93页
   ·EST数据库的应用第93-95页
  3 讨论第95-97页
   ·几种 PMF搜索程序的评价第95-96页
   ·基于 PMF数据的蛋白质鉴定第96-97页
   ·串联质谱的应用第97页
  4 结论第97-99页
 第六章 陆地棉TM-1伸长发育阶段纤维的蛋白质组学研究第99-110页
  1 材料与方法第100-102页
   ·植物材料第100页
   ·试验方法第100-102页
  2 结果和分析第102-107页
   ·不同发育阶段的棉花纤维蛋白质2-DE胶图谱比较第102-103页
   ·差异表达蛋白质的鉴定第103-107页
  3 讨论第107-109页
  4 结论第109-110页
 第七章 棉花纤维分化和伸长发育机制的蛋白质组学研究第110-131页
  1 材料与方法第111页
   ·植物材料与取样第111页
   ·试验方法第111页
  2 结果和分析第111-123页
   ·无絮棉和李氏无纤维突变体的形状观察第112-113页
   ·棉花纤维细胞分化和起始发育相关蛋白质的分离第113-115页
   ·与棉花纤维起始和伸长发育相关蛋白质的分离第115-119页
   ·棉花纤维分化和膨胀发育相关蛋白质的鉴定第119-123页
  3 讨论第123-129页
   ·调控蛋白质第124-125页
   ·蛋白质合成、折叠、组装和分解有关蛋白质第125-127页
   ·防卫反应蛋白质第127页
   ·与糖代谢有关的酶第127-129页
   ·其它蛋白质第129页
  4 结论第129-131页
全文结论第131-133页
参考文献第133-151页
致谢第151-152页
发表论文第152页

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