| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| ·生物信息学和基因组序列分析 | 第9-10页 |
| ·基因组特征提取 | 第10-11页 |
| ·序列特征在基因组分析中的应用 | 第11-15页 |
| ·基因组序列的局部特征 | 第11-13页 |
| ·基因组序列的全局特征 | 第13-15页 |
| ·本课题的任务及主要研究成果 | 第15-17页 |
| ·课题任务 | 第15页 |
| ·主要成果 | 第15-17页 |
| 第二章 序列统计特征的理论基础 | 第17-23页 |
| ·WF 特征 | 第17-18页 |
| ·DRA 特征 | 第18-19页 |
| ·BBC 特征 | 第19-21页 |
| ·特征的扩展 | 第21-23页 |
| 第三章 基因组序列特征数据库系统（GSFD）的设计 | 第23-36页 |
| ·GSFD 系统的需求分析 | 第23-24页 |
| ·GSFD 系统相关技术 | 第24-26页 |
| ·GSFD 系统的总体框架 | 第26-27页 |
| ·GSFD 系统模块设计 | 第27-34页 |
| ·基因组序列下载程序 | 第27-28页 |
| ·后台数据库管理程序 | 第28-31页 |
| ·用户查询的WEB 界面 | 第31-34页 |
| ·数据规模 | 第34页 |
| ·系统执行效率的评估 | 第34-36页 |
| 第四章 基于 BBC 特征的全基因组序列分析 | 第36-48页 |
| ·人类、小鼠、大鼠基因组序列比较分析 | 第36-40页 |
| ·人基因组各条染色体的特征分析 | 第40-48页 |
| ·人基因组个染色体BBC 特征分布图谱 | 第40-45页 |
| ·人基因组各染色体序列特征的稳定性分析 | 第45-47页 |
| ·人基因组上特征异常序列的研究 | 第47-48页 |
| 第五章 BBC 特征在水平基因转移（HGT）研究中的应用 | 第48-54页 |
| ·水平转移基因的理论基础 | 第48-49页 |
| ·寻找水平转移基因的方法学 | 第49-50页 |
| ·基于BBC 特征的水平转移基因的探测方法 | 第50-54页 |
| 第六章 总结与展望 | 第54-57页 |
| ·论文工作总结 | 第54-55页 |
| ·展望 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 致谢 | 第60页 |