预测RNA二级结构的快速计算方法的研究
摘要 | 第1-9页 |
ABSTRACT | 第9-12页 |
第一章 绪论 | 第12-18页 |
·研究背景 | 第12-13页 |
·RNA二级结构预测的研究方法 | 第13-15页 |
·序列对比方法 | 第13-14页 |
·以亲缘分析法预测 RNA结构的原理 | 第14-15页 |
·热动力学最小自由能量方法 | 第15-17页 |
·研究结果 | 第17-18页 |
第二章 RNA二级结构预测中 NPC问题的判定 | 第18-25页 |
·基本术语 | 第18-19页 |
·自由能量参数 | 第19-20页 |
·自由能量的表示 | 第20-21页 |
·NPC问题的判定 | 第21-25页 |
·NPC命题的证明 | 第21-25页 |
第三章 最小化自由能量方法的预测依据 | 第25-28页 |
·基本结构 | 第25页 |
·最小化自由能量预测 | 第25-26页 |
·自由能量最小化方法 | 第26-28页 |
第四章 RNA二级结构预测算法 | 第28-35页 |
·Mfold算法 | 第28-30页 |
·模型与图解表示 | 第28页 |
·动态规划 | 第28-29页 |
·Mfold算法改进 | 第29-30页 |
·Abrahams算法 | 第30-31页 |
·Rivals算法 | 第31-33页 |
·模型 | 第31-32页 |
·动态规划 | 第32-33页 |
·Lyngs算法 | 第33-35页 |
第五章 最大堆叠的 RNA二级结构快速预测算法 | 第35-44页 |
·算法设计 | 第35-36页 |
·算法思想 | 第36-38页 |
·算法分析 | 第38页 |
·试验结果 | 第38-42页 |
·试验对比分析 | 第42页 |
·结论 | 第42-44页 |
第六章 总结与展望 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-49页 |
致谢 | 第49-50页 |
攻读硕士学位期间发表论文 | 第50-51页 |
攻读硕士学位期间参与的工作 | 第51-52页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第52页 |