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空肠弯曲杆菌基因诊断方法的建立及其应用

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-9页
第一部分 文献综述第9-31页
 第一章 空肠弯曲杆菌感染流行病学研究进展第9-14页
  1 病原学第9-10页
  2 传染源第10页
  3 传播途径第10-11页
  4 感染范围第11页
  5 致病性第11-12页
   ·空肠弯曲杆菌肠炎第11-12页
   ·格林-巴利综合征第12页
   ·对动物的致病性第12页
  6 治疗方法第12-14页
 第二章 空肠弯曲杆菌检测与基因分型的研究进展第14-21页
  1 空肠弯曲杆菌检测方法的研究进展第14-17页
   ·常规生化检测方法第14-15页
   ·ELISA(酶联免疫吸附试验)方法第15页
   ·核酸探针杂交检测方法第15页
   ·PCR方法第15-17页
     ·定性PCR方法第16页
     ·PCR-ELISA方法第16页
     ·套式PCR(nested-PCR)方法第16-17页
     ·荧光定量PCR方法第17页
  2 空肠弯曲杆菌基因分型方法的研究进展第17-20页
   ·RFLP分型第18页
   ·RAPD分型第18页
   ·PFGE分型第18-19页
   ·PCR-RFLP分型第19页
   ·核糖体分型第19页
   ·鞭毛蛋白基因(flaA和flaB)分型第19-20页
   ·AFLP分型第20页
  3 小结第20-21页
 第三章 实时荧光定量PCR研究进展及其应用第21-31页
  1 实时定量RT-PCR的定量原理第21页
  2 常用的Real-time PCR仪第21-24页
   ·PE公司生产的Applied Biosystem系列第22-23页
   ·Roche公司生产的Lightcycler热循环仪第23页
   ·Bio-rad公司生产的iCycler iQ第23页
   ·Strategene公司的MX4000 Multiplex第23页
   ·Cepheid公司的Smart Cycler System第23-24页
   ·Corbert Research公司的Rotor-Gene第24页
  3 常用的探针种类第24-25页
   ·水解探针或Taqman探针第24页
   ·杂交探针第24页
   ·SYBR Green I第24-25页
   ·分子信标(Molecular Beacons)第25页
   ·scorpions第25页
  4 实时荧光定量PCR在病原微生物检测上的应用第25-31页
第二部分 实验研究第31-55页
 试验一 应用PCR法和培养法调查食品和水中的空肠弯曲杆菌第31-39页
  1 材料与方法第31-35页
   ·菌株第31页
   ·培养基第31-32页
   ·主要试剂及仪器第32页
   ·PCR引物第32页
   ·模板DNA的提取第32-33页
   ·PCR扩增第33页
   ·PCR扩增产物的鉴定第33页
     ·电泳鉴定第33页
     ·PCR产物的测序鉴定第33页
   ·敏感性实验第33页
   ·食品中人工布菌进行检测第33-35页
     ·细菌的分离与增菌第33-34页
     ·分离菌株的鉴定第34-35页
   ·市场样品的调查第35页
  2 结果第35-36页
   ·PCR方法的特异性第35页
   ·PCR方法的敏感性第35页
   ·人工布菌食品和水检测结果第35-36页
   ·市场样品中空肠弯曲杆菌的调查结果第36页
  3 讨论第36-37页
  4 结论第37-39页
 试验二 基于SYBR Green I的Real-timePCR定量检测空肠弯曲杆菌方法的建立第39-47页
  1 材料与方法第39-42页
   ·菌株第39页
   ·培养基第39-40页
   ·主要试剂及仪器第40页
   ·引物选择与合成第40页
   ·模板DNA的提取第40-41页
   ·定量PCR扩增第41页
   ·标准样品的制备第41-42页
   ·细菌定量第42页
  2 结果第42-43页
   ·定量PCR的特异性第42页
   ·定量结果第42页
     ·标准曲线第42页
     ·定量PCR定量与细菌记数结果比较第42页
   ·定量PCR的敏感性第42-43页
  3 讨论第43-47页
 试验三 基于TaqMan探针的Real-time PCR定量检测食品和水中的空肠弯曲杆的建立与应用第47-55页
  1 材料与方法第47-50页
   ·菌株第47-48页
   ·培养基第48页
   ·主要试剂及仪器第48页
   ·引物和TaqMan探针的设计与合成第48-49页
   ·模板DNA的提取第49页
   ·定量PCR扩增第49-50页
   ·标准样品的制备第50页
   ·食品样品中空肠弯曲杆菌的定量检测第50页
  2 结果第50-51页
   ·定量PCR的特异性第50页
   ·定量结果第50-51页
     ·标准曲线第50-51页
   ·定量PCR的敏感性第51页
   ·食品样品中空肠弯曲杆菌定量检测结果第51页
  3 讨论第51-55页
全文结论第55-56页
参考文献第56-62页
发表论文第62-63页
致谢第63页

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