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抑瘤基因NGX6启动子的克隆及初步功能研究

一、中文摘要第1-8页
二、英文摘要第8-11页
三、目录第11-14页
四、英文缩略词表第14-16页
五、论文正文第16-58页
 前言第16-20页
  NGX6基因的克隆及生物信息学特征第16-17页
  NGX6基因在肿瘤组织及细胞中的表达和定位第17页
  NGX6基因对肿瘤细胞生物学行为的影响第17-18页
  NGX6基因的中游分子事件第18页
  NGX6基因的下游分子事件第18-20页
 技术路线第20-22页
 第一章 材料与方法第22-36页
  1 材料第22-25页
   ·细胞第22页
   ·菌株和载体第22-23页
   ·试剂第23-24页
   ·试剂盒第24页
   ·PCR引物第24页
   ·主要仪器第24-25页
  2 方法第25-36页
   ·生物信息学分析第25页
     ·NGX6基因候选启动子区的生物信息学分析第25页
     ·NGX6基因转录起始位点的生物信息学分析第25页
     ·NGX6基因调控区转录因子结合位点的生物信息学分析第25页
     ·NGX6基因5'上游调控区CpG岛的生物信息学分析第25页
   ·RT-PCR检测NGX6在各细胞系中的表达第25-27页
     ·细胞总RNA的抽提第25-26页
     ·差异RT-PCR第26-27页
   ·人外周血细胞gDNA提取及NGX6基因候选启动子区域的扩增第27-29页
     ·人外周血细胞gDNA提取第27-28页
     ·PCR扩增NGX6基因候选启动子区域第28页
     ·胶回收PCR产物第28-29页
   ·荧光素酶报告基因重组体构建第29-31页
     ·亚克隆目的片段至T-A载体第29页
     ·双酶切载体pGL3/Enhancer和目的片段第29页
     ·胶回收酶切产物第29页
     ·以T4 DINA ligase连接NGX6/I126及pGL3/enhancer载体第29-30页
     ·连接产物的转化第30页
     ·挑选克隆,提取质粒第30-31页
     ·双酶切鉴定及DNA测序鉴定第31页
   ·缺失突变体荧光素酶报告质粒的构建第31-32页
   ·绿色荧光蛋白报告质粒的构建第32页
     ·PCR扩增EGFP第32页
     ·pGL3/Enhancer/EGFP、pGL3/Control/EGFP以及pGL3/-159/+276/EGFP的构建第32页
   ·基因瞬时转染第32-33页
   ·荧光素酶报告基因分析法检测启动子活性第33-34页
     ·荧光素酶活性检测第33页
     ·β-半乳糖苷酶活性检测第33-34页
     ·荧光素酶活性相对值处理及其数据分析第34页
   ·统计学分析第34页
   ·Mithramycin A处理第34页
   ·RT-PCR以及灰度扫描第34-36页
 第二章 结果第36-52页
  1 RT-PCR检测NGX6基因在多种细胞中的表达第36-37页
  2 生物信息学方法分析NGX6基因调控区的结构特征第37-42页
   ·NGX6基因启动子区的生物信息学预测结果第37页
   ·NGX6基因启动子区的CpG岛预测结果第37-39页
   ·NGX6基因转录起始位点的生物信息学预测结果第39-40页
   ·NGX6基因调控区转录因子结合位点的生物信息学预测结果第40-42页
  3 PCR扩增NGX6基因调控序列并构建pGL3/Enhancer/1126重组体第42-45页
   ·NGX6基因调控区的扩增并亚克隆至pGEM-T easy第42-43页
   ·pGL3/Enhancer/1126重组报告基因载体的构建第43-45页
  4 NGX6基因调控序列(-357/+769)的启动子活性的确定第45-46页
  5 克隆和鉴定NGX6基因近距离启动子第46-47页
  6 绿色荧光蛋白报告质粒验证NGX6基因近距离启动子活性第47-49页
  7 光辉霉素A(Mithramycin A)抑制NGX6基因启动子活性和内源性表达第49-52页
 第三章 讨论第52-58页
六、结论第58-59页
七、参考文献第59-65页
八、综述第65-77页
九、致谢第77-78页
十、攻读学位期间主要的研究成果第78页

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