| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-10页 |
| 第一章 综述 | 第10-12页 |
| ·绪论 | 第10页 |
| ·本文结构 | 第10-12页 |
| 第二章 多粒子体系的量子化学理论 | 第12-24页 |
| ·量子化学采用的近似 | 第12-16页 |
| ·密度泛函理论 | 第16-24页 |
| 第三章 基本原理 | 第24-28页 |
| ·研究生物大分子体系结合自由能的方法 | 第24-25页 |
| ·自由能微扰（PEP）方法 | 第24页 |
| ·热力学积分（PI）方法 | 第24-25页 |
| ·基于MM—PBSA 方法的自由能计算方法 | 第25页 |
| ·分子力学和分子动力学的基本原理 | 第25-28页 |
| ·分子力学的基本原理 | 第25-26页 |
| ·分子动力学的基本原理 | 第26-28页 |
| 第四章 蛋白质的组成和结构 | 第28-34页 |
| ·蛋白质的组成与结构 | 第28-32页 |
| ·蛋白质的结构 | 第32-34页 |
| 第五章 MDM2 蛋白和抑制剂 IMZ 结合自由能的计算 | 第34-42页 |
| ·MDM2 蛋白和抑制剂 IMZ 复合物体系介绍 | 第34-35页 |
| ·基于MM—PBSA 方法的结合自由能计算 | 第35-39页 |
| ·计算过程 | 第35-36页 |
| ·结果分析及讨论 | 第36-39页 |
| ·小结 | 第39-42页 |
| 第六章 结论 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 攻读硕士学位期间完成的论文 | 第48-50页 |
| 致谢 | 第50页 |