| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-33页 |
| 第一节 DNA 分子遗传学标记概论 | 第11-23页 |
| ·限制性片段长度多态性（RFLP） | 第12-14页 |
| ·随机扩增多态性DNA（RAPD） | 第14-16页 |
| ·扩增片段长度多态性（AFLP） | 第16-18页 |
| ·简单序列重复间区的DNA 序列（ISSR） | 第18-19页 |
| ·单链构象多态性（SSCP） | 第19-20页 |
| ·单核苷酸多态性（SNP） | 第20-21页 |
| ·表达序列标签（EST） | 第21-23页 |
| 第二节 微卫星分子标记概述 | 第23-29页 |
| ·SSR 标记的原理 | 第23-24页 |
| ·SSR 标记的特点 | 第24页 |
| ·SSR 标记的应用 | 第24-26页 |
| ·国内外水产动物SSR 标记的开发现状 | 第26-28页 |
| ·SSR 标记的不足之处和发展前景 | 第28-29页 |
| 第三节 微卫星分子标记的开发方法 | 第29-32页 |
| ·经典法 | 第29页 |
| ·富集法 | 第29-30页 |
| ·杂交选择法 | 第29页 |
| ·引物延伸法 | 第29-30页 |
| ·FIASCO 法 | 第30页 |
| ·省略筛库法 | 第30页 |
| ·ISSR 片段扩增法 | 第30页 |
| ·数据库检索法 | 第30-32页 |
| 第四节 本研究的总体设计和研究策略 | 第32-33页 |
| 第二章 西施舌和魁蚶微卫星磁珠杂交筛选法的构建 | 第33-49页 |
| 前言 | 第33-35页 |
| 第一节 材料与方法 | 第35-40页 |
| ·实验材料 | 第35页 |
| ·实验方法 | 第35-40页 |
| ·样品处理 | 第35页 |
| ·DNA 提取 | 第35-36页 |
| ·磁珠杂交筛选 | 第36-38页 |
| ·DNA 酶切 | 第36页 |
| ·接头连接 | 第36页 |
| ·DNA 片段的胶回收 | 第36-37页 |
| ·磁珠杂交富集 | 第37页 |
| ·衔接头PCR 反应 | 第37-38页 |
| ·PCR 产物纯化 | 第38页 |
| ·TA 克隆及PCR 筛选 | 第38-39页 |
| ·制备大肠杆菌感受态细胞 | 第38页 |
| ·连接转化反应 | 第38-39页 |
| ·PCR 筛选 | 第39页 |
| ·测序 | 第39-40页 |
| 第二节 实验结果 | 第40-46页 |
| ·样品DNA 酶切和接头连接结果 | 第40-41页 |
| ·磁珠杂交结果 | 第41页 |
| ·蓝白斑筛选 | 第41-42页 |
| ·PCR 筛选结果 | 第42页 |
| ·测序结果 | 第42-46页 |
| 第三节 讨论 | 第46-49页 |
| ·限制性内切酶的选择 | 第46页 |
| ·杂交探针的选择 | 第46页 |
| ·杂交条件对筛选结果的影响 | 第46-47页 |
| ·磁珠杂交筛选法的富集效率 | 第47-49页 |
| 第三章 光棘球海胆 EST-SSR 的分离 | 第49-54页 |
| 前言 | 第49-51页 |
| 第一节 EST-SSR 筛选方法 | 第51页 |
| 第二节 EST-SSR 筛选结果 | 第51-53页 |
| 第三节 讨论 | 第53-54页 |
| 第四章 西施舌、魁蚶与光棘球海胆的微卫星多态性检测 | 第54-69页 |
| 前言 | 第54-55页 |
| 第一节 材料与方法 | 第55-60页 |
| ·实验材料 | 第55页 |
| ·实验方法 | 第55-60页 |
| ·样品处理 | 第55页 |
| ·西施舌和魁蚶样品处理 | 第55页 |
| ·光棘球海胆样品处理 | 第55页 |
| ·DNA 提取 | 第55-56页 |
| ·西施舌和魁蚶DNA 提取 | 第55-56页 |
| ·光棘球海胆DNA 提取 | 第56页 |
| ·设计引物 | 第56-57页 |
| ·引物筛选 | 第57页 |
| ·多态性检测 | 第57-59页 |
| ·群体样品PCR 扩增 | 第57-58页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶板的制备 | 第58页 |
| ·电泳 | 第58页 |
| ·银染显色 | 第58-59页 |
| ·结果记录及数据分析 | 第59-60页 |
| 第二节 实验结果 | 第60-66页 |
| ·引物琼脂糖凝胶检测 | 第60-61页 |
| ·引物多态性检测 | 第61页 |
| ·多态性微卫星引物的筛选结果 | 第61-66页 |
| ·西施舌多态性微卫星引物的筛选结果 | 第61-62页 |
| ·魁蚶多态性微卫星引物的筛选结果 | 第62页 |
| ·光棘球海胆多态性微卫星引物的筛选结果 | 第62-66页 |
| 第三节 讨论 | 第66-69页 |
| ·引物设计参数 | 第66页 |
| ·微卫星多态性检测选择非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第66-67页 |
| ·EST-SSR 的内含子 | 第67页 |
| ·来自基因组与来自ESTs 的微卫星标记比较 | 第67页 |
| ·无效等位基因 | 第67-68页 |
| ·“结巴”带 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 硕士就读期间已发表的文章 | 第81页 |