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脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus sp.A4)部分糖基水解酶研究及其基因组序列初步分析

摘要第1-8页
Abstract第8-19页
第一章 绪论第19-43页
 1 脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus)的研究进展第19-25页
   ·脂环酸芽孢杆菌的分离第19-22页
   ·脂环酸芽孢杆菌的命名和分类第22-23页
   ·脂环酸芽孢杆菌的鉴定第23-25页
     ·形态学鉴定第23页
     ·细胞膜脂肪酸组分分析第23页
     ·甲基萘醌分析第23页
     ·16S rRNA分析第23-24页
     ·生理生化鉴定第24-25页
     ·生长条件试验第25页
 2 脂环酸芽孢杆菌的防控技术第25-28页
   ·脂环酸芽孢杆菌属快速检测方法第25-26页
   ·脂环酸芽孢杆菌属的防控技术研究第26-28页
 3 木聚糖酶第28-31页
   ·木聚糖酶的理化性质第28-29页
   ·木聚糖酶的分类第29页
   ·木聚糖酶的应用第29-31页
     ·木聚糖酶在造纸工业中的应用第29-30页
     ·木聚糖酶在饲料工业中的应用第30页
     ·木聚糖酶在酿造工业中的应用第30页
     ·木聚糖酶在其他方面的应用第30-31页
   ·脂环酸芽孢杆菌属木聚糖酶的研究进展第31页
 4 β-葡聚糖酶第31-33页
   ·β-葡聚糖酶的研究进展第31-32页
   ·β-葡聚糖酶的应用第32页
     ·β-葡聚糖酶在啤酒生产中的应用第32页
     ·β-葡聚糖酶在饲料生产中的应用第32页
   ·脂环酸芽孢杆菌属β-葡聚糖酶的研究进展第32-33页
 5 α-淀粉酶(α-amylase)第33-37页
   ·α-淀粉酶的种类第34页
   ·α-淀粉酶的分子结构第34页
   ·α-淀粉酶的应用与展望第34-35页
     ·α-淀粉酶在面包焙烤中的应用第34-35页
     ·淀粉的液化和糖化作用第35页
     ·纤维脱浆第35页
     ·造纸工业第35页
     ·α-淀粉酶在洗涤行业中的应用第35页
   ·双酶法制糖工艺第35-36页
     ·淀粉的糊化第36页
     ·液化第36页
     ·糖化第36页
   ·现状第36-37页
 6 脂环酸芽孢杆菌属基因组测序进展第37-38页
   ·核酸测序技术的进展第37页
   ·脂环酸芽孢杆菌属基因组测序进展第37-38页
 7 分子克隆研究技术概述第38页
   ·Tail-PCR技术第38页
   ·简并PCR引物设计(Degenerate PCR)第38页
 8 外源表达系统的介绍第38-42页
   ·大肠杆菌表达系统概述第38-39页
     ·对表达载体的优化第39页
     ·对宿主细胞的改造第39页
     ·提高mRNA的稳定性第39页
     ·发酵条件第39页
   ·毕赤酵母表达系统概述第39-42页
     ·外源蛋白自身的影响第40页
     ·启动子的选择第40页
     ·信号肽的选择第40-41页
     ·转录后翻译水平第41页
     ·培养条件的影响第41页
     ·阻止外源蛋白降解第41-42页
 9 研究目的与意义第42-43页
第二章 脂环酸芽孢杆菌的筛选与产酶分析第43-51页
 1 实验材料第43-44页
   ·土样、菌株和质粒第43页
   ·引物合成和核酸序列测序第43页
   ·试剂盒、工具酶与生化试剂第43页
   ·仪器第43页
   ·培养基第43页
   ·常用溶液第43-44页
 2 实验方法第44-45页
   ·脂环酸芽孢杆菌的筛选及分离第44页
   ·菌株的鉴定第44-45页
     ·菌落形态及生长条件的测定第44页
     ·基因组DNA的提取第44页
     ·16S rDNA的PCR扩增第44-45页
     ·DNA凝胶回收第45页
     ·DNA片段的连接、转化第45页
     ·重组子的筛选第45页
   ·产酶分析第45页
     ·产酶培养第45页
     ·酶活力测定第45页
 3 结果与分析第45-48页
   ·菌株的鉴定第45-47页
     ·菌株的16S rDNA鉴定结果第45-47页
     ·菌落形态及孢子形态观察第47页
     ·菌株在不同温度及pH下的生长情况第47页
   ·菌株A4 和A15 产酶分析第47-48页
 4 讨论第48-50页
 本章小结第50-51页
第三章 Alicyclobacillus sp.A4 酸性淀粉酶的分离纯化及其酶学性质研究第51-61页
 1 实验材料第51页
   ·菌株第51页
   ·生化试剂第51页
   ·仪器第51页
   ·培养基第51页
 2 实验方法第51-54页
   ·α-淀粉酶(AmyA4)粗酶液的获得第51页
   ·原酶AmyA4 的纯化第51-52页
   ·淀粉酶活性测定第52页
   ·分子量的测定第52页
   ·纯化蛋白的质谱鉴定与内肽序列的测定第52页
   ·淀粉水分测定第52页
   ·淀粉的转化率第52页
   ·酶学性质第52-53页
     ·最适pH和pH稳定性第52-53页
     ·最适温度及热稳定性第53页
     ·不同金属离子及相关化学试剂对淀粉酶的影响第53页
   ·不同来源生淀粉的水解实验第53页
   ·不同浓度土豆生淀粉水解实验第53页
   ·双酶法制糖工艺研究第53-54页
     ·土豆淀粉液化第53页
     ·土豆淀粉糖化第53页
     ·双酶法制糖工艺第53-54页
 3 结果与分析第54-58页
   ·来源于脂环酸芽孢杆菌的酸性淀粉酶AmyA4 的纯化第54-55页
   ·淀粉酶的内肽质谱鉴定第55页
   ·淀粉酶的酶学性质第55-58页
     ·淀粉酶AmyA4 的最适作用pH及pH稳定性和最适作用温度及热稳定性第55-56页
     ·金属离子及其它化学试剂对淀粉酶AmyA4 活性的影响第56-57页
     ·不同来源生淀粉的水解实验第57页
     ·不同浓度土豆生淀粉水解实验第57页
     ·双酶法制糖工艺第57-58页
 4 讨论第58-60页
 本章小结第60-61页
第四章 Alicyclobacillus sp.A4 酸性葡聚糖酶的纯化和基因克隆研究第61-83页
 1 实验材料第61页
   ·菌株第61页
   ·生化试剂第61页
   ·仪器第61页
   ·培养基第61页
 2 实验方法第61-69页
   ·原酶CelA4 粗酶液的获得第61页
   ·原酶CelA4 的纯化第61-62页
   ·分子量的测定第62页
   ·葡聚糖酶转PVDF膜第62页
   ·纯化蛋白的质谱鉴定与内肽序列的测定第62页
   ·葡聚糖酶基因CelA4 的基因序列获得与分析第62页
   ·葡聚糖酶基因成熟蛋白CelA4F和截短蛋白CelA4T的基因序列的克隆第62-63页
   ·酶切与连接第63-64页
   ·葡聚糖酶基因CelA4F和CelA4T在毕赤酵母中的表达第64-65页
     ·重组表达载体的线性化第64页
     ·毕赤酵母感受态细胞的制备第64-65页
     ·电转化第65页
     ·摇瓶中目的基因在毕赤酵母中的表达第65页
     ·发酵罐水平重组酵母的高细胞密度发酵第65页
   ·重组酶CelA4 的分离纯化及鉴定第65-66页
   ·重组酶的脱糖基化实验第66页
   ·酶学性质第66-69页
     ·酶活单位定义第66页
     ·葡萄糖标准曲线的制定第66-67页
     ·蛋白含量的测定第67页
     ·葡聚糖酶K_m值和V_(max)的测定第67-68页
     ·葡聚糖酶的最适pH和pH稳定性的测定第68页
     ·葡聚糖酶的反应最适温度及热稳定性的测定第68页
     ·不同金属离子及相关化学试剂对葡聚糖酶的影响第68页
     ·葡聚糖酶比活性测定第68页
     ·底物特异性的测定第68页
     ·抗蛋白酶能力测定第68-69页
     ·葡聚糖酶在人工胃液中稳定性的测定第69页
     ·葡聚糖酶在人工胃液中对大麦葡聚糖中还原糖的水解能力的测定第69页
     ·葡聚糖酶在人工胃液中对大麦豆粕型日粮粘度的影响第69页
     ·粘度的测定第69页
 3 结果与分析第69-78页
   ·来源于脂环酸芽孢杆菌的葡聚糖酶CelA4 的纯化第69-70页
   ·葡聚糖酶的N端测序和内肽质谱鉴定第70-71页
   ·葡聚糖酶的基因序列分析第71-74页
   ·重组酶CelA4F和CelA4T在毕赤酵母中的表达第74-75页
     ·具有葡聚糖酶活性的转化子的筛选第74页
     ·发酵罐水平表达CelA4F和CelA4T第74-75页
   ·重组酶CelA4F和CelA4T的分离纯化及鉴定第75页
   ·葡聚糖酶的酶学性质第75-78页
     ·葡聚糖酶CelA4 的pH及温度适用性和稳定性第75-76页
     ·金属离子及其它化学试剂对葡聚糖酶CelA4 活性的影响第76-77页
     ·葡聚糖酶CelA4 的反应动力学第77页
     ·葡聚糖酶CelA4 的底物特异性第77页
     ·葡聚糖酶CelA4 的抗蛋白酶能力测定第77-78页
     ·葡聚糖酶CelA4 在人工胃液中的稳定性第78页
     ·葡聚糖酶CelA4 在人工胃液中水解大麦葡聚糖能力第78页
 4 讨论第78-82页
 本章小结第82-83页
第五章 Alicyclobacillus sp.A4 第九家族葡聚糖酶的克隆,表达及性质分析第83-96页
 1 实验材料第83页
   ·菌株和质粒第83页
   ·引物合成第83页
   ·试剂盒、工具酶和生化试剂第83页
   ·仪器第83页
   ·培养基第83页
   ·常用溶液第83页
 2 实验方法第83-87页
   ·葡聚糖酶基因Agl9A序列的获得第83-84页
   ·葡聚糖酶基因Agl9A序列的克隆第84页
   ·酶切与连接第84页
   ·重组表达载体的线性化第84页
   ·毕赤酵母感受态细胞的制备第84页
   ·电转化第84页
   ·目的基因在毕赤酵母中摇瓶水平的表达第84-85页
   ·重组酶Agl9A的分离纯化及性质测定第85-87页
     ·酶活单位定义第85页
     ·葡萄糖标准曲线的制定第85页
     ·蛋白含量测定第85页
     ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第85页
     ·发酵罐水平重组酵母的高细胞密度发酵第85页
     ·重组酶Agl9A的分离纯化第85页
     ·重组酶Agl9A酶反应最适pH及pH稳定性测定第85页
     ·重组酶Agl9A酶反应最适温度及热稳定性测定第85页
     ·不同金属离子及相关化学试剂对重组酶Agl9A酶活影响的测定第85页
     ·重组酶Agl9A对Ca~(2+)依赖性的测定第85-86页
     ·重组酶Agl9A抗蛋白酶能力测定第86页
     ·重组酶Agl9A比活的测定第86页
     ·重组酶Agl9A的 Km和Vmax值的测定第86页
     ·重组酶Agl9A对麦芽汁的水解实验第86页
     ·过滤速率和粘度的测定第86-87页
 3 结果与分析第87-95页
   ·Agl9A基因序列的获得与分析第87页
   ·重组酶Agl9A的纯化第87页
   ·重组酶Agl9A的酶学性质研究第87-93页
     ·pH与温度对重组酶Agl9A酶反应的影响第87页
     ·不同金属离子及相关化学试剂对重组酶Agl9A酶活的影响第87页
     ·重组酶Agl9A对Ca~(2+)依赖性的测定第87-91页
     ·重组酶Agl9A抗蛋白酶能力测定第91-92页
     ·重组酶Agl9A的K_m值和V_(max)测定第92-93页
     ·重组酶Agl9A降低麦芽汁过滤速率和粘度的测定第93页
  4 讨论第93-95页
 本章小结第95-96页
第六章 Alicyclobacillus sp.A4 的木聚糖酶基因的克隆,表达及性质分析第96-107页
 1 实验材料第96页
   ·菌株和质粒第96页
   ·生化试剂第96页
   ·仪器第96页
   ·培养基第96页
   ·常用溶液第96页
 2 实验方法第96-100页
   ·原核表达载体pET-226(+)-XynA4 的构建第96-99页
     ·木聚糖酶基因XynA4 的克隆第96-97页
     ·DNA片段的回收和连接第97页
     ·两步Tail-PCR方法获得基因XynA4 上下游序列第97-98页
     ·pET-226(+)-XynA4 表达载体的构建第98-99页
     ·酶切与连接第99页
     ·重组质粒pET-226(+)-XynA4 转化大肠杆菌BL21(DE3)第99页
     ·重组酶XynA4 在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达第99页
   ·重组酶XynA4 的分离纯化及性质测定第99-100页
     ·酶活单位定义第99页
     ·木糖标准曲线的制定第99页
     ·蛋白含量测定第99-100页
     ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第100页
     ·重组酶XynA4 的分离纯化第100页
     ·最适pH及pH稳定性第100页
     ·最适温度及热稳定性第100页
     ·金属离子和相关化学试剂的影响第100页
     ·重组酶XynA4 比活的测定第100页
 3 结果与分析第100-104页
   ·XynA4 基因的克隆与序列分析第100-101页
   ·重组酶XynA4 在大肠杆菌中的表达第101-102页
   ·重组酶XynA4 的纯化第102-103页
   ·重组酶XynA4 的酶学性质研究第103-104页
     ·pH与温度对重组酶XynA4 酶活的影响第103页
     ·金属离子及化学试剂对XynA4 酶活的影响第103-104页
     ·重组酶XynA4 的K_m值和V_(max)第104页
 4 讨论第104-106页
 本章小结第106-107页
第七章 Alicyclobacillus sp.A4 全基因组序列初步分析第107-124页
 1 实验材料第107页
   ·菌株第107页
   ·培养基第107页
 2 实验方法第107-108页
   ·脂环酸芽孢杆菌A4 基因组DNA的提取第107页
   ·脂环酸芽孢杆菌A4 全基因组测序第107页
   ·基因组以及质粒ORF的预测和注释第107-108页
   ·代谢途径第108页
 3 结果第108-121页
   ·菌株Alicyclobacillus sp.A4 的总基因组提取第108页
   ·测序与组装第108-109页
   ·染色体基因组序列的基本特征第109页
   ·染色体基因组序列的代谢调控第109-112页
   ·质粒基因组序列的基本特征第112-114页
   ·质粒基因组序列的代谢调控图第114-115页
   ·Alicyclobacillus sp.A4 全基因组共线性分析第115页
   ·Alicyclobacillus sp.A4 分泌组蛋白分析第115-120页
   ·Alicyclobacillus sp.A4 糖基水解酶分析第120-121页
 4 讨论第121-123页
 本章小结第123-124页
第八章 结论第124-126页
参考文献第126-139页
致谢第139-140页
作者简历第140页

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