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特征提取及分类算法在膜蛋白分类预测问题中的应用

摘要第1-10页
Abstract第10-16页
第1章 绪论第16-25页
   ·课题的研究背景与意义第16-19页
   ·膜蛋白类型概述第19-21页
   ·国内外研究现状第21-22页
   ·论文的主要研究内容和贡献第22-24页
   ·论文的结构安排第24-25页
第2章 膜蛋白的特征提取和分类算法及论文涉及理论方法第25-37页
   ·引言第25页
   ·膜蛋白序列的特征提取算法第25-31页
     ·基于氨基酸组成和位置的特征提取方法第26-27页
     ·基于氨基酸物理化学特性的特征提取方法第27-30页
     ·其它特征提取方法第30-31页
   ·膜蛋白分类算法第31-33页
     ·基于统计的分类算法第31-33页
     ·基于机器学习的算法第33页
   ·分类模型构建的相关技术第33-36页
     ·数据集构建第33-34页
     ·模型检验第34-35页
     ·模型评估第35-36页
   ·本章小结第36-37页
第3章 基于降维的组合特征提取算法在膜蛋白分类问题中的研究第37-66页
   ·引言第37页
   ·数据集第37-38页
   ·二肽组成(Dipeptide Composition:DC)第38-39页
   ·最近邻居算法(KNN)第39-40页
     ·最近邻居算法第39-40页
     ·最近邻居算法中近邻数目K 的取值第40页
   ·基于二肽组成和主成分分析的组合特征提取算法的分类第40-44页
     ·引言第40页
     ·PCA 算法第40-41页
     ·最近邻居算法中近邻数目K 的取值第41-42页
     ·结果与讨论第42-44页
   ·基于二肽组成和线性判别分析的组合特征提取算法的分类第44-48页
     ·引言第44-45页
     ·LDA 算法第45页
     ·最近邻居算法中近邻数目K 的取值第45-46页
     ·结果与讨论第46-48页
   ·基于二肽组成和核心主成分分析的组合特征提取算法的分类第48-53页
     ·引言第48-49页
     ·KPCA 算法第49-50页
     ·最近邻居算法中近邻数目K 的取值第50-51页
     ·结果与讨论第51-53页
   ·基于二肽组成和核心线性判别分析的组合特征提取算法的分类第53-60页
     ·引言第53-54页
     ·KLDA 算法第54-56页
     ·最近邻居算法中近邻数目K 的取值第56-57页
     ·结果与讨论第57-60页
   ·基于二肽组成和邻域保护嵌入的组合特征提取算法的分类第60-65页
     ·引言第60页
     ·NPE 算法第60-62页
     ·最近邻居算法中近邻数目K 的取值第62页
     ·结果与讨论第62-65页
   ·本章小结第65-66页
第4章 基于降维近似支持向量机的基因芯片数据分类器第66-76页
   ·引言第66-67页
   ·对分类模型的评价第67-68页
   ·DRPSVM 基因芯片数据分类器第68-73页
     ·近似支持向量机第68-69页
     ·降维二次规划算法第69-72页
     ·DRPSVM 学习算法第72-73页
   ·实验与分析第73-75页
     ·在UCI 数据集上的分类精度比较第74页
     ·在CAMDA2000 上的基因芯片数据分类性能比较第74页
     ·在colon 1,2 datasets 上的基因芯片数据分类性能比较第74-75页
   ·结论第75-76页
总结及工作展望第76-79页
参考文献第79-91页
致谢第91-93页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第93页

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