| 论文创新点 | 第5-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第13-17页 |
| 技术路线图 | 第16-17页 |
| 第一部分：肝细胞性肝癌中ACP1、BMP4和TSPYL5基因的高甲基化及其临床意义 | 第17-50页 |
| 2 材料和方法 | 第20-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-23页 |
| 2.2 实验对象 | 第23-26页 |
| 2.3 实验方法 | 第26-36页 |
| 3 实验结果 | 第36-47页 |
| 3.1 肝癌组织中ACP1、BMP4和TSPYL5高甲基化 | 第36-37页 |
| 3.2 亚硫酸氢钠克隆测序验证MSRE-qPCR结果 | 第37-39页 |
| 3.3 DNA甲基化指标与临床病理资料的相关性分析 | 第39页 |
| 3.4 DNA甲基化指标的ROC曲线分析 | 第39-44页 |
| 3.5 DNA甲基化预测HCC患者的无瘤生存期 | 第44页 |
| 3.6 HCC血浆样本中ACP1、BMP4、TSPYL5甲基化的检测 | 第44-47页 |
| 4 讨论 | 第47-50页 |
| 第二部分：肝细胞性肝癌中TRIM58基因异常甲基化与mRNA表达及临床病理相关性研究 | 第50-71页 |
| 5 材料和方法 | 第51-61页 |
| 5.1 实验材料 | 第51-54页 |
| 5.2 实验对象 | 第54-56页 |
| 5.3 实验方法 | 第56-61页 |
| 6 实验结果 | 第61-69页 |
| 6.1 TRIM58基因在肝癌组织中呈现高甲基化 | 第61-63页 |
| 6.2 TRIM58基因甲基化与临床病理资料的相关性分析 | 第63-65页 |
| 6.3 TRIM58基因高甲基化预测HCC患者无瘤生存期 | 第65-66页 |
| 6.4 TRIM58基因和ACTB基因标准曲线 | 第66-67页 |
| 6.5 肝癌中TRIM58基因mRNA表达水平下调并与甲基化水平负相关 | 第67-69页 |
| 7 讨论 | 第69-71页 |
| 第三部分：基于二代测序技术(RRBS)的肝细胞性肝癌全基因组甲基化研究及验证 | 第71-109页 |
| 8 材料和方法 | 第72-85页 |
| 8.1 实验材料 | 第72-74页 |
| 8.2 实验对象 | 第74-76页 |
| 8.3 实验方法 | 第76-85页 |
| 9 实验结果 | 第85-105页 |
| 9.1 RRBS数据产生情况及覆盖度分析 | 第85页 |
| 9.2 Promoter区和CGI区甲基化分析 | 第85-94页 |
| 9.3 差异性甲基化区域(DMR)分析 | 第94-95页 |
| 9.4 两个样本间差异甲基化基因的GO功能富集分析 | 第95-97页 |
| 9.5 两个样本间差异甲基化基因的Pathway功能分析 | 第97页 |
| 9.6 Miseq-BSP小样本中验证RRBS结果 | 第97-100页 |
| 9.7 MSRE-qPCR扩大样本检测ARHGAP6基因的甲基化 | 第100-105页 |
| 10 讨论 | 第105-108页 |
| 11 结论 | 第108-109页 |
| 参考文献 | 第109-118页 |
| 综述 DNA甲基化在肝细胞性肝癌中的临床应用价值 | 第118-129页 |
| 参考文献 | 第124-129页 |
| 博士期间发表的科研成果 | 第129-130页 |
| 致谢 | 第130页 |
