| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.PRRS的流行病学与临床症状 | 第11-12页 |
| 1.1 PRRS的流行特点 | 第11页 |
| 1.2 临床症状 | 第11-12页 |
| 2.感染PRRSV公猪精液带毒 | 第12-17页 |
| 2.1 精液中PRRSV的来源与生殖道感染 | 第13-15页 |
| 2.2 PRRSV对精液质量的影响 | 第15-16页 |
| 2.3 精液中PRRSV的检测 | 第16-17页 |
| 3.PRRSV的基因组结构 | 第17-21页 |
| 3.1 PRRSV的非结构蛋白和功能 | 第17-19页 |
| 3.2 PRRSV的结构蛋白和功能 | 第19-21页 |
| 4.PRRSV基因组的遗传变异 | 第21-23页 |
| 4.1 5 ’UTR和3’UTR的遗传变异 | 第21页 |
| 4.2 非结构蛋白的遗传变异 | 第21-22页 |
| 4.3 结构蛋白的遗传变异 | 第22-23页 |
| 第2章 引言 | 第23-25页 |
| 第3章 重庆公猪精液品质及PRRSV带毒分析 | 第25-51页 |
| 1.材料和方法 | 第25-31页 |
| 1.1 样品来源 | 第25-26页 |
| 1.2 主要试剂 | 第26页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第26-27页 |
| 1.4 主要溶液和试剂配置 | 第27页 |
| 1.5 精液样本质量检测 | 第27-28页 |
| 1.6 精液样本PRRSV检测 | 第28-30页 |
| 1.7 病毒株荧光RT-PCR鉴定 | 第30-31页 |
| 2.结果 | 第31-46页 |
| 2.1 精液质量分析 | 第31-44页 |
| 2.2 RT-PCR扩增结果 | 第44-45页 |
| 2.3 病毒株荧光RT-PCR鉴定 | 第45-46页 |
| 3.讨论 | 第46-48页 |
| 本章小结 | 第48-51页 |
| 第4章 重庆市PRRSV变异株nsp2高变区和ORF5基因的遗传变异分析 | 第51-69页 |
| 1.材料和方法 | 第51-56页 |
| 1.1 病料来源 | 第51页 |
| 1.2 主要试剂 | 第51页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第51-52页 |
| 1.4 主要试剂和溶液的配置 | 第52页 |
| 1.5 参考毒株 | 第52-53页 |
| 1.6 目的基因的扩增 | 第53-55页 |
| 1.7 PCR产物的克隆与序列测定 | 第55-56页 |
| 2.结果 | 第56-66页 |
| 2.1 目的基因的扩增结果 | 第56-57页 |
| 2.2 NSP2高变区的序列分析 | 第57-62页 |
| 2.3 ORF5基因的序列分析 | 第62-66页 |
| 3 讨论 | 第66-68页 |
| 本章小结 | 第68-69页 |
| 第5章 两株与疫苗株高同源的PRRSV毒株的全基因组测序及遗传变异分析 | 第69-87页 |
| 1.材料和方法 | 第69-76页 |
| 1.1 病料来源 | 第69页 |
| 1.2 主要试剂 | 第69-70页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第70页 |
| 1.4 主要试剂和溶液的配置 | 第70页 |
| 1.5 参考毒株表 | 第70-72页 |
| 1.6 目的基因的扩增 | 第72-75页 |
| 1.7 PCR产物的克隆与序列测定 | 第75-76页 |
| 2.结果 | 第76-83页 |
| 2.1 全基因组各基因片段的RT-PCR扩增 | 第76页 |
| 2.2 全基因组序列拼接及序列同源性比对 | 第76-77页 |
| 2.3 非结构蛋白的序列分析 | 第77页 |
| 2.4 结构蛋白序列分析 | 第77-78页 |
| 2.5 5 ’UTR和3’UTR分析 | 第78-79页 |
| 2.6 CQ1701、CQ1702株特殊的氨基酸突变点 | 第79-80页 |
| 2.7 与毒力相关的氨基酸的比较 | 第80-81页 |
| 2.8 CQ1701、CQ1702株与JXA1P45编码区序列比对分析 | 第81-83页 |
| 2.9 全基因组的遗传演化分析 | 第83页 |
| 3.讨论 | 第83-86页 |
| 本章小结 | 第86-87页 |
| 第6章 结论 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
