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基于多组学技术稻水象甲低温适应分子机制

中文摘要第4-6页
abstract第6-7页
第一章 前言第11-25页
    1.1 稻水象甲第11-15页
        1.1.1 稻水象甲生活习性及形态特征第11-14页
        1.1.2 稻水象甲的危害及入侵史第14-15页
    1.2 昆虫耐寒性分类第15-17页
    1.3 昆虫低温适应机制第17-22页
        1.3.1 昆虫的行为适应第17页
        1.3.2 昆虫季节性冷驯化适应性机制第17-20页
        1.3.3 昆虫快速冷驯化适应机制第20-22页
    1.4 研究目的与意义第22-25页
第二章 稻水象甲越冬成虫差异转录组学研究第25-45页
    2.1 材料与方法第26-31页
        2.1.1 供试昆虫第26页
        2.1.2 转录组测序样品处理第26-27页
        2.1.3 总RNA提取第27-28页
        2.1.4 测序文库构建及测序第28-29页
        2.1.5 数据分析处理第29-31页
    2.2 结果与分析第31-42页
        2.2.1 测序数据拼接第31-34页
        2.2.2 稻水象甲转录组的功能注释第34页
        2.2.3 稻水象甲转录组表达量分析第34-36页
        2.2.4 差异表达基因GO富集分析第36-38页
        2.2.5 差异基因KEGGpathway富集分析第38-42页
    2.3 讨论第42-43页
    2.4 小结第43-45页
第三章 稻水象甲越冬与非越冬成虫miRNA分析第45-85页
    3.1 材料与方法第46-48页
        3.1.1 供试昆虫第46页
        3.1.2 RNA文库构建及测序第46-47页
        3.1.3 信息分析流程第47页
        3.1.4 miRNA表达量分析第47页
        3.1.5 差异miRNA靶基因预测及富集分析第47页
        3.1.6 miRNAs的荧光定量PCR验证第47-48页
    3.2 结果第48-65页
        3.2.1 sRNA序列结果分析第48-49页
        3.2.2 基因组比对和小RNA注释第49-52页
        3.2.3 保守及新miRNA鉴定第52-57页
        3.2.4 miRNA特征分析第57-60页
        3.2.5 越冬与非越冬miRNA表达量分析第60页
        3.2.6 差异miRNA靶基因GO及KEGG富集分析第60-65页
        3.2.8 qPCR验证第65页
    3.3 讨论第65-83页
    3.4 小结第83-85页
第四章 基于TMT技术的越冬与非越冬稻水象甲成虫差异蛋白质组学研究第85-113页
    4.1 材料与方法第88-90页
        4.1.1 供试昆虫第88页
        4.1.2 TMT试验流程第88页
        4.1.3 蛋白提取第88-89页
        4.1.4 酶解、TMT标记第89页
        4.1.5 色谱分级第89页
        4.1.6 LC-MS/MS蛋白鉴定与定量第89-90页
        4.1.7 蛋白质GO、KEGG分析第90页
    4.2 结果第90-109页
        4.2.1 TMT蛋白鉴定第90-91页
        4.2.2 差异蛋白GO分析第91-102页
        4.2.3 差异表达蛋白的通路分析第102-103页
        4.2.4 能量代谢通路相关蛋白分析第103-106页
        4.2.5 mRNA、miRNA差异转录组学和差异蛋白质组学整合分析第106-109页
    4.3 讨论第109-112页
    4.4 小结第112-113页
第五章 稻水象甲快速冷驯化蛋白质组学研究第113-133页
    5.1 材料与方法第114-120页
        5.1.1 供试昆虫第114页
        5.1.2 稻水象甲快速冷驯化条件第114页
        5.1.3 稻水象甲蛋白提取方法第114-115页
        5.1.4 SDS-PAGE分析第115页
        5.1.5 双向电泳第115-119页
        5.1.6 质谱蛋白鉴定第119页
        5.1.7 蛋白互作网络第119页
        5.1.8 qPCR验证第119-120页
    5.2 结果第120-130页
        5.2.1 不同蛋白提取方法的产率分析第120-121页
        5.2.2 不同方法提取蛋白的SDS-PAGE分析第121-122页
        5.2.3 两种提取法总蛋白双向凝胶电泳分析第122-124页
        5.2.4 快速冷驯化对稻水象甲存活率的影响第124页
        5.2.5 快速冷驯化条件下的稻水象甲双向电泳第124页
        5.2.6 上调表达蛋白的质谱鉴定第124-126页
        5.2.7 差异表达蛋白的功能分类第126-128页
        5.2.8 差异表达蛋白的互作网络的构建第128-129页
        5.2.9 差异上调表达蛋白qPCR验证第129-130页
    5.3 讨论第130-132页
    5.4 小结第132-133页
第六章 全文结论第133-135页
参考文献第135-151页
博士期间发表论文第151-153页
致谢第153-154页

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