| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-7页 |
| 缩略语表 | 第16-17页 |
| 1 引言 | 第17-33页 |
| 1.1 布病疫情形势 | 第17-18页 |
| 1.2 布病病原学 | 第18-19页 |
| 1.2.1 病原学特点 | 第18页 |
| 1.2.2 布鲁氏菌分离培养 | 第18-19页 |
| 1.2.3 病原检测的意义 | 第19页 |
| 1.3 流行病学 | 第19-20页 |
| 1.3.1 传染源 | 第19页 |
| 1.3.2 传播途径 | 第19页 |
| 1.3.3 易感动物 | 第19-20页 |
| 1.3.4 流行特点 | 第20页 |
| 1.4 布鲁氏菌致病性及生物学特征 | 第20-21页 |
| 1.5 布病的自然疫源性 | 第21页 |
| 1.6 布病血清学检测方法 | 第21-23页 |
| 1.6.1 平板凝集试验(PAT) | 第21页 |
| 1.6.2 琥红平板凝集试验(RBPT) | 第21-22页 |
| 1.6.3 试管凝集试验(SAT) | 第22页 |
| 1.6.4 补体结合试验(CFT) | 第22页 |
| 1.6.5 酶联免疫吸附试验(ELISA) | 第22页 |
| 1.6.6 荧光偏振试验(FPA) | 第22页 |
| 1.6.7 免疫胶体金技术(GICA) | 第22-23页 |
| 1.7 布鲁氏菌分子分型方法 | 第23-26页 |
| 1.7.1 常规PCR鉴定 | 第23页 |
| 1.7.2 16Sr DNA鉴定 | 第23页 |
| 1.7.3 实时定量PCR(real-timePCR) | 第23-24页 |
| 1.7.4 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP) | 第24页 |
| 1.7.5 单核苷酸多态性分析(SNP) | 第24页 |
| 1.7.6 脉冲场凝胶电泳(PFGE) | 第24-25页 |
| 1.7.7 多位点序列分型(MLST) | 第25页 |
| 1.7.8 多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA) | 第25-26页 |
| 1.8 布鲁氏菌基因组提取方法学 | 第26页 |
| 1.9 基因组学研究进展 | 第26-29页 |
| 1.9.1 布鲁氏菌基因组构成 | 第26页 |
| 1.9.2 布鲁氏菌基因组特征 | 第26-27页 |
| 1.9.3 主要致病布鲁氏菌全基因组测序分析 | 第27页 |
| 1.9.4 非主要致病布鲁氏菌的全基因组测序分析 | 第27页 |
| 1.9.5 布鲁氏菌野毒株比较基因组学 | 第27-28页 |
| 1.9.6 布鲁氏菌疫苗株S19比较基因组学 | 第28页 |
| 1.9.7 布鲁氏菌进化基因组学 | 第28页 |
| 1.9.8 结语 | 第28-29页 |
| 1.10 布病的临床表现 | 第29-30页 |
| 1.10.1 人布病的临床表现 | 第29页 |
| 1.10.2 临床生理生化特征 | 第29页 |
| 1.10.3 布病的鉴别诊断 | 第29-30页 |
| 1.10.4 家畜布病的临床特征 | 第30页 |
| 1.11 布病的治疗及药物敏感性研究 | 第30页 |
| 1.12 布病的公共卫生及实验室生物安全 | 第30-31页 |
| 1.13 人畜间布病防控策略 | 第31-32页 |
| 1.13.1 人间布病防控措施 | 第31页 |
| 1.13.2 动物布病防控措施 | 第31-32页 |
| 1.14 选题目的和意义 | 第32-33页 |
| 2 研究一内蒙古乌兰察布布鲁氏菌分离株种型鉴定及流行病学特征分析 | 第33-42页 |
| 2.1 材料和方法 | 第33-34页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第33页 |
| 2.1.2 主要仪器与试剂 | 第33-34页 |
| 2.2 实验方法 | 第34-35页 |
| 2.2.1 布鲁氏菌分离培养 | 第34页 |
| 2.2.2 布鲁氏菌基因组DNA提取 | 第34页 |
| 2.2.3 布鲁氏菌常规鉴定 | 第34页 |
| 2.2.4 全自动细菌生化鉴定分析 | 第34页 |
| 2.2.5 AMOS-PCR鉴定 | 第34-35页 |
| 2.2.6 流行病学调查 | 第35页 |
| 2.3 结果 | 第35-39页 |
| 2.3.1 布鲁氏菌形态及染色结果 | 第35-36页 |
| 2.3.2 常规鉴定结果 | 第36-37页 |
| 2.3.3 全自动生化实验结果 | 第37页 |
| 2.3.4 AMOS-PCR鉴定结果 | 第37-38页 |
| 2.3.5 种型及地理分布 | 第38页 |
| 2.3.6 病例特征分析 | 第38-39页 |
| 2.3.6.1 性别、民族和职业分布 | 第38-39页 |
| 2.3.6.2 年龄分布 | 第39页 |
| 2.3.6.3 接触史和发病时间 | 第39页 |
| 2.3.7 临床表现 | 第39页 |
| 2.3.8 就诊前是否用药及用药情况 | 第39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-41页 |
| 2.5 小结 | 第41-42页 |
| 3 研究二布鲁氏菌分离株16Sr DNA基因遗传进化分析 | 第42-49页 |
| 3.1 材料与方法 | 第42页 |
| 3.1.1 菌株来源 | 第42页 |
| 3.1.2 仪器与试剂 | 第42页 |
| 3.2 实验方法 | 第42-43页 |
| 3.2.1 引物设计与合成 | 第42页 |
| 3.2.2 16Sr DNA-PCR扩增 | 第42-43页 |
| 3.2.3 序列比对及进化树构建 | 第43页 |
| 3.2.4 人苍白杆菌的PCR鉴定 | 第43页 |
| 3.3 结果 | 第43-46页 |
| 3.3.1 布鲁氏菌16Sr DNA扩增结果 | 第43-44页 |
| 3.3.2 布鲁氏菌16Sr DNA测序比对结果 | 第44页 |
| 3.3.3 试验菌株16Sr DNA序列比对结果 | 第44-45页 |
| 3.3.4 人苍白杆菌与布鲁氏菌16Sr DNA序列相似性比对结果 | 第45页 |
| 3.3.5 人苍白杆菌的PCR鉴定 | 第45-46页 |
| 3.3.6 遗传进化树构建结果 | 第46页 |
| 3.4 讨论 | 第46-48页 |
| 3.5 小结 | 第48-49页 |
| 4 研究三内蒙古布鲁氏菌临床分离株多位点序列分型研究 | 第49-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第49页 |
| 4.1.1 菌株来源 | 第49页 |
| 4.1.2 仪器与试剂 | 第49页 |
| 4.2 实验方法 | 第49-51页 |
| 4.2.1 MLST位点选择及引物 | 第49页 |
| 4.2.2 PCR扩增及测序 | 第49页 |
| 4.2.3 数据分析 | 第49-51页 |
| 4.3 结果 | 第51-53页 |
| 4.3.1 MLST-PCR扩增结果 | 第51页 |
| 4.3.2 等位基因及ST型分析结果 | 第51-52页 |
| 4.3.3 内蒙古布病流行三阶段菌株与乌兰察布菌株ST的比较 | 第52页 |
| 4.3.4 最小生成树分析结果 | 第52-53页 |
| 4.4 讨论 | 第53-54页 |
| 4.5 小结 | 第54-55页 |
| 5 研究四内蒙古乌兰察布羊种布鲁氏菌MLVA基因分型研究 | 第55-72页 |
| 5.1 材料与方法 | 第55页 |
| 5.1.1 菌株来源 | 第55页 |
| 5.1.2 主要仪器与试剂 | 第55页 |
| 5.2 实验方法 | 第55-57页 |
| 5.2.1 MLVA-16引物 | 第55页 |
| 5.2.2 MLVA基因分型实验 | 第55-57页 |
| 5.3 实验结果 | 第57-69页 |
| 5.3.1 MLVA-16PCR扩增结果 | 第57页 |
| 5.3.2 试验菌株的MLVA-16特征值 | 第57-61页 |
| 5.3.3 MLVA数据分析 | 第61-62页 |
| 5.3.4 MLVA-16多态性指数分析结果 | 第62-64页 |
| 5.3.5 羊种布鲁氏菌MLVA-16聚类分析结果 | 第64-65页 |
| 5.3.6 羊种布鲁氏菌MLVA-11遗传进化分析 | 第65页 |
| 5.3.7 羊种布鲁氏菌基因型聚类分析结果 | 第65页 |
| 5.3.8 羊种布鲁氏菌溯源调查及临床相关性分析 | 第65-68页 |
| 5.3.9 羊种布鲁氏菌分子流行病学调查 | 第68-69页 |
| 5.4 讨论 | 第69-70页 |
| 5.5 小结 | 第70-72页 |
| 6 研究五内蒙古羊种布鲁氏菌传播模式调查 | 第72-76页 |
| 6.1 材料与方法 | 第72页 |
| 6.1.1 菌株来源 | 第72页 |
| 6.1.2 仪器与试剂 | 第72页 |
| 6.2 实验方法 | 第72页 |
| 6.2.1 AMOS-PCR扩增 | 第72页 |
| 6.2.2 MLVA基因分型实验 | 第72页 |
| 6.2.3 MLVA数据分析 | 第72页 |
| 6.3 结果 | 第72-73页 |
| 6.3.1 AMOS-PCR复核结果 | 第72-73页 |
| 6.3.2 MLVA聚类分析结果 | 第73页 |
| 6.4 讨论 | 第73-75页 |
| 6.5 小结 | 第75-76页 |
| 7 研究六羊种布鲁氏菌鉴别研究 | 第76-81页 |
| 7.1 材料与方法 | 第76页 |
| 7.1.1 菌株来源 | 第76页 |
| 7.1.2 主要仪器与试剂 | 第76页 |
| 7.2 方法 | 第76-78页 |
| 7.2.1 引物序列及产物片段 | 第76-77页 |
| 7.2.2 RpoB-PCR扩增及测序 | 第77页 |
| 7.2.3 Bru42-PCR扩增 | 第77-78页 |
| 7.3 结果 | 第78-79页 |
| 7.3.1 RpoB-PCR分析结果 | 第78页 |
| 7.3.2 Bru42-PCR扩增结果 | 第78-79页 |
| 7.4 讨论 | 第79-80页 |
| 7.5 小结 | 第80-81页 |
| 8 研究七临床分离布鲁氏菌体外药物敏感性分析 | 第81-91页 |
| 8.1 材料与方法 | 第81页 |
| 8.1.1 菌株来源 | 第81页 |
| 8.1.2 主要仪器与试剂 | 第81页 |
| 8.2 方法 | 第81-83页 |
| 8.2.1 药敏实验方法 | 第81-82页 |
| 8.2.2 耐药基因检测引物 | 第82页 |
| 8.2.3 利福平耐药基因检测 | 第82页 |
| 8.2.4 阿奇霉素耐药基因检测 | 第82-83页 |
| 8.2.5 测序结果分析 | 第83页 |
| 8.3 实验结果 | 第83-87页 |
| 8.3.1 药敏实验结果 | 第83-84页 |
| 8.3.2 耐药菌株K-B法检测结果 | 第84-85页 |
| 8.3.3 耐药基因检测结果 | 第85-87页 |
| 8.3.3.1 利福平耐药基因扩增结果 | 第85页 |
| 8.3.3.2 利福平耐药基因分析结果 | 第85-86页 |
| 8.3.3.3 阿奇霉素耐药基因扩增结果 | 第86页 |
| 8.3.3.4 阿奇霉素耐药基因分析结果 | 第86-87页 |
| 8.3.4 羊种布鲁氏菌对利福平和复方新诺明敏感性筛查结果 | 第87页 |
| 8.3.4.1 利福平和复方新诺明敏感性筛查结果 | 第87页 |
| 8.3.4.2 复方新诺明耐药布鲁氏菌的地区分布 | 第87页 |
| 8.4 讨论 | 第87-90页 |
| 8.5 小结 | 第90-91页 |
| 9 总体讨论 | 第91-94页 |
| 10 结论 | 第94-95页 |
| 11 创新点 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96-98页 |
| 参考文献 | 第98-114页 |
| 附录 | 第114-139页 |
| 作者简介 | 第139-140页 |
