巴鲵属谱系地理学研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第1章 前言 | 第10-20页 |
| 1.1 巴鲵属简介 | 第10-13页 |
| 1.1.1 巴鲵属有效性讨论 | 第10-12页 |
| 1.1.2 巴鲵属相关研究 | 第12-13页 |
| 1.2 谱系地理学研究方法 | 第13-16页 |
| 1.2.1 谱系地理学概念 | 第13-14页 |
| 1.2.2 谱系地理学相关理论 | 第14-15页 |
| 1.2.3 谱系地理学发展趋势 | 第15-16页 |
| 1.3 秦巴山区的地质及环境特征 | 第16-18页 |
| 1.4 本研究的立题依据及意义 | 第18-20页 |
| 1.4.1 研究目标和研究内容 | 第18-19页 |
| 1.4.2 拟解决的主要问题 | 第19-20页 |
| 第2章 实验材料与实验方法 | 第20-34页 |
| 2.1 样品采集 | 第20-24页 |
| 2.2 线粒体基因分子实验 | 第24-28页 |
| 2.2.1 实验试剂 | 第24-25页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第25-26页 |
| 2.2.3 总DNA的提取方法 | 第26页 |
| 2.2.4 PCR扩增及测序 | 第26-28页 |
| 2.3 实验数据分析方法 | 第28-34页 |
| 2.3.1 序列拼接、比对及特征分析 | 第28-29页 |
| 2.3.2 种群遗传多样性分析 | 第29页 |
| 2.3.3 基因流和种群分化分析 | 第29-30页 |
| 2.3.4 系统发育分析 | 第30-31页 |
| 2.3.5 遗传分化分析和谱系地理结构 | 第31页 |
| 2.3.6 种群数量动态历史统计 | 第31-32页 |
| 2.3.7 种群溯祖时间估算 | 第32-34页 |
| 第3章 实验结果与分析 | 第34-66页 |
| 3.1 序列组成分析 | 第34-35页 |
| 3.2 巴鲵属遗传多样性分析 | 第35-43页 |
| 3.2.1 线粒体基因单倍型分布 | 第35-36页 |
| 3.2.2 种群间遗传距离分析 | 第36-43页 |
| 3.3 系统发育分析 | 第43-52页 |
| 3.3.1 单倍型构建系统发育树 | 第43-50页 |
| 3.3.2 单倍型中介邻接网络图 | 第50-52页 |
| 3.4 种群遗传结构和谱系地理分析 | 第52-58页 |
| 3.4.1 种群遗传结构 | 第52-55页 |
| 3.4.2 IBD模型检验 | 第55-58页 |
| 3.5 种群数量动态历史分析 | 第58-63页 |
| 3.6 种群溯祖时间估算 | 第63-66页 |
| 第4章 讨论 | 第66-72页 |
| 4.1 巴鲵属物种遗传多样性分析 | 第66页 |
| 4.2 种群遗传分化分析 | 第66-68页 |
| 4.3 种群数量动态研究 | 第68-69页 |
| 4.4 巴鲵属物种进化历史分析 | 第69-72页 |
| 4.4.1 巴鲵属系统发育学研究 | 第69-70页 |
| 4.4.2 巴鲵属种群分化研究 | 第70-72页 |
| 第5章 总结 | 第72-76页 |
| 参考文献 | 第76-84页 |
| 致谢 | 第84-86页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第86页 |
