| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第15-25页 |
| 1.1 研究背景 | 第15-18页 |
| 1.1.1 适应景观重要性 | 第15-16页 |
| 1.1.2 非梯度和吸收现象的适应景观构造问题 | 第16-17页 |
| 1.1.3 适应景观理论工作进展 | 第17页 |
| 1.1.4 逃逸时间问题 | 第17-18页 |
| 1.2 研究内容 | 第18-21页 |
| 1.3 生物概念 | 第21-25页 |
| 第二章 非梯度系统适应景观的存在性 | 第25-35页 |
| 2.1 研究背景 | 第25-26页 |
| 2.2 模型 | 第26页 |
| 2.3 适应景观构造 | 第26-33页 |
| 2.3.1 选择优势作用的适应景观 | 第26-29页 |
| 2.3.2 重组，非对称选择优势共同作用的适应景观 | 第29-33页 |
| 2.4 与其他工作比较 | 第33页 |
| 2.5 结论 | 第33-35页 |
| 第三章 新的显式构造的适应景观及群体固定的量化定义 | 第35-79页 |
| 3.1 背景简述 | 第35-36页 |
| 3.2 问题的提出 | 第36-37页 |
| 3.3 Wright-Fisher模型的建立 | 第37-40页 |
| 3.3.1 模型的数值模拟 | 第38-40页 |
| 3.4 适应景观的争议 | 第40-43页 |
| 3.5 适应景观的构造 | 第43-59页 |
| 3.5.1 纯随机漂变过程 | 第46-48页 |
| 3.5.2 突变和随机漂变过程 | 第48-53页 |
| 3.5.3 选择和随机漂变过程 | 第53-55页 |
| 3.5.4 突变，选择和随机漂变过程 | 第55-59页 |
| 3.6 适应性动力学 | 第59-60页 |
| 3.7 逃逸时间 | 第60-68页 |
| 3.7.1 以突变和随机漂变过程为例 | 第61-66页 |
| 3.7.2 以选择和随机漂变过程为例 | 第66页 |
| 3.7.3 以突变，选择和随机漂变过程为例 | 第66-68页 |
| 3.8 新的中性演化 | 第68-70页 |
| 3.9 模型跟实验的联系 | 第70页 |
| 3.10 与其他工作的比较 | 第70-72页 |
| 3.11 结论 | 第72-79页 |
| 第四章 Muller ratchet的最适应类的灭亡估计 | 第79-111页 |
| 4.1 背景简述 | 第79页 |
| 4.2 问题的提出 | 第79-82页 |
| 4.3 模型的建立 | 第82-84页 |
| 4.4 适应景观角度的动力学分类 | 第84-97页 |
| 4.4.1 适应景观构造 | 第85-89页 |
| 4.4.2 动力学分类 | 第89-97页 |
| 4.5 最适应类灭亡时间 | 第97-106页 |
| 4.5.1 最适应类的离散和连续灭亡时间比较 | 第106页 |
| 4.6 吸收现象的刻画 | 第106-108页 |
| 4.7 与其他工作比较 | 第108-109页 |
| 4.8 结论 | 第109-111页 |
| 第五章 总结与展望 | 第111-115页 |
| 5.1 本论文的主要理论工作 | 第111-113页 |
| 5.2 未来展望 | 第113-115页 |
| 附录A 随机微分方程 | 第115-121页 |
| A.1 随机微分方程的解 | 第116-118页 |
| A.2 三种随机微分方程之间的关系 | 第118-119页 |
| A.3 随机微分方程跟Kolmogorov扩散方程关系 | 第119-121页 |
| 附录B 马尔科夫链 | 第121-123页 |
| B.1 马尔科夫链的稳态解 | 第121-123页 |
| 附录C Kolmogorov扩散方程 | 第123-129页 |
| C.1 Kolmogorov后向方程 | 第123-124页 |
| C.2 马尔科夫链与Kolmogorov前向方程关系 | 第124-126页 |
| C.3 边界条件 | 第126-127页 |
| C.4 Kolmogorov前向方程的解 | 第127-129页 |
| 附录D 适应景观构造理论 | 第129-131页 |
| 附录E 首次平均到达时间 | 第131-133页 |
| 附录F 关于级数收敛性的证明 | 第133-135页 |
| 参考文献 | 第135-145页 |
| 攻读博士学位期间发表和完成的主要学术论文目录 | 第145-147页 |
| 其他科研经历和荣誉 | 第147-149页 |
| 致谢 | 第149-152页 |
