三角涡虫β微管蛋白和Rab蛋白cDNA文库的克隆及生物信息学分析
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第1章 文献综述 | 第8-18页 |
| 1. 涡虫 | 第8-9页 |
| ·涡虫的形态与分类学 | 第8页 |
| ·涡虫的生态习性 | 第8-9页 |
| 2. 微管蛋白 | 第9-11页 |
| ·微管蛋白的研究进展 | 第9页 |
| ·微管蛋白的多样性 | 第9-10页 |
| ·微管蛋白的结构 | 第10页 |
| ·β微管蛋白的研究进展 | 第10-11页 |
| 3. Ras超家族 | 第11-12页 |
| ·Rab蛋白的研究进展 | 第11-12页 |
| ·Rab蛋白的结构 | 第12页 |
| ·Rab蛋白的功能 | 第12页 |
| ·Rab蛋白GTP循环调节因子 | 第12页 |
| 4. cDNA文库构建 | 第12-18页 |
| ·cDNA文库的类型 | 第13页 |
| ·全长cDNA文库的构建 | 第13-14页 |
| ·SMART技术原理 | 第14页 |
| ·DSN均一化技术 | 第14-15页 |
| ·cDNA文库构建的基本步骤 | 第15-18页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第18-30页 |
| 1 实验材料 | 第18-19页 |
| ·三角涡虫的采集 | 第18页 |
| ·三角涡虫的培养 | 第18-19页 |
| 2 实验主要仪器 | 第19-20页 |
| 3 实验试剂 | 第20-21页 |
| 4 实验方法 | 第21-28页 |
| ·三角涡虫总RNA的制备 | 第21-22页 |
| ·cDNA的合成与文库的构建 | 第22-27页 |
| ·目的片段的回收 | 第27页 |
| ·连接产物的转化 | 第27-28页 |
| 5 生物信息学分析工具 | 第28-30页 |
| ·核酸序列分析 | 第28页 |
| ·蛋白质序列分析 | 第28-30页 |
| 第3章 实验结果 | 第30-35页 |
| 1 总RNA质量检测 | 第30-31页 |
| ·吸光度的检测 | 第30页 |
| ·凝胶电泳检测 | 第30-31页 |
| 2 cDNA合成 | 第31-32页 |
| 3 均一化结果 | 第32-33页 |
| 4 cDNA文库的质量 | 第33-35页 |
| ·cDNA文库的库容量 | 第33-34页 |
| ·cDNA文库的滴度 | 第34页 |
| ·连接产物的菌落鉴定 | 第34-35页 |
| 第4章 β微管蛋白和Rab蛋白的生物信息学分析 | 第35-54页 |
| 1 开放性阅读框分析 | 第35-39页 |
| ·β微管蛋白 | 第35页 |
| ·Rab蛋白 | 第35-39页 |
| 2 CDD分析 | 第39-40页 |
| 3 氨基酸序列同源性分析 | 第40-44页 |
| ·β微管蛋白 | 第40页 |
| ·Rab蛋白氨基酸序列同源性分析 | 第40-44页 |
| 4 蛋白质理化性质分析 | 第44-46页 |
| ·β理化性质分析 | 第44-46页 |
| 5 疏水性分析 | 第46-48页 |
| 6 信号肽预测 | 第48页 |
| 7 亚细胞定位预测 | 第48页 |
| 8 蛋白质跨膜结构域分析 | 第48-50页 |
| 9 蛋白质二级结构预测 | 第50页 |
| 10 磷酸化位点预测 | 第50-51页 |
| 11 系统发育分析 | 第51-54页 |
| 第5章 讨论 | 第54-57页 |
| 第6章 结论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第68-69页 |
