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携线粒体DNA A1555G突变的聋病患者特异性iPS细胞系的建立与鉴定

致谢第5-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
英文缩略词第10-15页
第一章 文献综述第15-31页
    1 引言第15页
    2 线粒体疾病第15-16页
    3 线粒体聋病第16-20页
        3.1 聋病的致病因素第16-17页
        3.2 与非综合征性耳聋相关的线粒体12S rRNA基因突变第17-18页
        3.3 氨基糖苷类药物性耳聋与线粒体12S rRNA基因A1555G突变第18-19页
        3.4 线粒体单体型对mtDNA突变致聋的影响第19-20页
    4 患者特异性iPS细胞模型第20-30页
        4.1 iPS细胞第20-21页
        4.2 患者特异性iPS细胞第21-26页
        4.3 患者特异性iPS细胞作为疾病模型的优势第26-27页
        4.4 患者特异性iPS细胞在线粒体疾病研究中的应用第27-30页
    5 总结第30-31页
第二章 实验研究第31-84页
    1 引言第31-32页
    2 实验材料第32-38页
        2.1 组织标本和细胞第32页
        2.2 质粒第32页
        2.3 实验试剂及配置第32-37页
            2.3.1 细胞培养液配置第32-35页
            2.3.2 实验试剂配制第35-36页
            2.3.3 实验试剂第36-37页
        2.4 试剂盒第37页
        2.5 实验仪器第37-38页
    3 实验方法第38-63页
        3.1 尿液细胞的收集和分离第38-39页
            3.1.1 尿液样本的采集第38页
            3.1.2 尿液细胞的分离第38-39页
            3.1.3 尿液细胞的传代第39页
            3.1.4 尿液细胞的冻存第39页
        3.2 CF-1孕鼠胚胎成纤维细胞滋养层的制备第39-42页
            3.2.1 CF-1孕鼠胚胎成纤维细胞的分离第39-40页
            3.2.2 细胞的冻存第40-41页
            3.2.3 饲养层细胞的制备第41-42页
        3.3 逆转录病毒的包装和感染第42-44页
            3.3.1 pMX逆转录病毒载体质粒的转化和抽提第42页
            3.3.2 逆转录病毒的包装第42-43页
            3.3.3 病毒的收集和感染第43页
            3.3.4 感染后细胞的接种第43-44页
        3.4 iPS细胞克隆的挑取、维护与培养第44-47页
            3.4.1 iPS单克隆的挑取第44页
            3.4.2 iPS细胞的有饲养层培养第44-46页
                3.4.2.1 iPS细胞的传代第44-45页
                3.4.2.2 iPS细胞的维护第45页
                3.4.2.3 iPS细胞的冻存第45页
                3.4.2.4 iPS细胞的复苏第45-46页
            3.4.3 iPS细胞的无饲养层培养第46-47页
                3.4.3.1 iPS细胞的传代第46页
                3.4.3.2 iPS细胞的维护第46-47页
                3.4.3.3 iPS细胞的冻存第47页
                3.4.3.4 iPS细胞的复苏第47页
        3.5 iPS细胞的生物学鉴定第47-63页
            3.5.1 碱性磷酸酶检测(AP染色)第47-48页
            3.5.2 免疫荧光检测第48-49页
            3.5.3 内源多能性基因和外源编程基因相对表达量的检测第49-52页
                3.5.3.1 细胞收集第49页
                3.5.3.2 RNA提取第49-50页
                3.5.3.3 反转录第50页
                3.5.3.4 荧光定量PCR检测第50-52页
            3.5.4 外源编程基因的插入鉴定第52-53页
                3.5.4.1 DNA提取第52页
                3.5.4.2 PCR反应第52-53页
                3.5.4.3 1%琼脂糖凝胶电泳第53页
            3.5.5 iPS细胞的核型分析第53-54页
            3.5.6 多能性基因(Oct4、Nanog)启动子的甲基化水平检测第54-59页
                3.5.6.1 DNA提取第54页
                3.5.6.2 DNA样品处理第54页
                3.5.6.3 启动子区域的PCR扩增第54-56页
                3.5.6.4 PCR产物的胶回收第56-57页
                3.5.6.5 T载体的连接与转化第57-58页
                3.5.6.6 挑菌与菌落PCR第58页
                3.5.6.7 数据处理第58-59页
            3.5.7 体外分化拟胚体第59-60页
                3.5.7.1 拟胚体的培养第59页
                3.5.7.2 多能性基因的表达检测第59-60页
            3.5.8 体内分化畸胎瘤第60-61页
            3.5.9 线粒体DNA A1555G突变的鉴定第61-62页
                3.5.9.1 DNA提取(TaKaRa Universal Genomic DNA Extraction Kit)第61-62页
            3.5.10 线粒体结构的透射电子显微镜观察第62-63页
    4 实验结果与分析第63-80页
        4.1 临床资料第63-65页
        4.2 尿液细胞的收集、分离及培养第65-66页
        4.3 CF-1小鼠胚胎成纤维细胞滋养层的制备第66-67页
        4.4 病毒的包装、收集和滴度测定第67页
        4.5 尿液细胞的逆转录病毒感染第67-68页
        4.6 iPS克隆的形成第68-69页
        4.7 iPS细胞的培养第69-70页
        4.8 碱性磷酸酶染色(AP染色)第70页
        4.9 免疫荧光检测结果与分析第70-71页
        4.10 内源多能性基因的表达与分析第71-72页
        4.11 外源编程基因沉默的表达与分析第72-73页
        4.12 外源编程基因的插入鉴定第73页
        4.13 多能性基因(Oct-4,Nanog)启动子的甲基化水平检测第73-74页
        4.14 核型分析第74-75页
        4.15 体外分化拟胚体第75-76页
        4.16 拟胚体中三胚层标记基因的表达第76-77页
        4.17 体内分化畸胎瘤第77-78页
        4.18 畸胎瘤组织的切片观察第78-79页
        4.19 线粒体DNA A1555G突变的分析第79页
        4.20 线粒体结果的透射电子显微镜观察第79-80页
    5 讨论第80-84页
        5.1 建立mtDNA A1555G突变导致的耳聋患者特异性iPS细胞系的意义第80-81页
        5.2 利用尿液细胞作为原代细胞进行重编程的优势第81-82页
        5.3 患者特异性iPS细胞作为疾病模型面临的挑战第82-84页
参考文献第84-100页
作者简历第100页

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