| 缩略词 | 第5-10页 |
| 中文摘要 | 第10-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-74页 |
| 一. 肠易激综合征 | 第16-36页 |
| 1.1 肠易激综合征概论 | 第16-18页 |
| 1.2 肠易激综合征的流行病学 | 第18-21页 |
| 1.2.1 不同地区人群的肠易激综合征患病率 | 第19-20页 |
| 1.2.2 不同性别的肠易激综合征患病率 | 第20页 |
| 1.2.3 不同年龄人群的肠易激综合征患病率 | 第20-21页 |
| 1.2.4 不同种族的肠易激综合征患病率 | 第21页 |
| 1.3 肠易激综合征的致病因素和发病机制 | 第21-36页 |
| 1.3.1 致病因素 | 第21-25页 |
| 1.3.2 肠易激综合征发病机制 | 第25-36页 |
| 二. 炎症性肠病 | 第36-54页 |
| 2.1 炎症性肠病(溃疡性结肠炎和克罗恩病)概论 | 第36-37页 |
| 2.2 炎症性肠病的致病因素和发病机制 | 第37-54页 |
| 2.2.1 遗传因素 | 第38-42页 |
| 2.2.2 环境因素 | 第42-46页 |
| 2.2.3 免疫病理机制 | 第46-54页 |
| 三. 肠道菌群与肠易激综合征、炎症性肠病 | 第54-68页 |
| 3.1 肠道菌群及其功能 | 第54页 |
| 3.2 肠道菌群与肠易激综合征 | 第54-57页 |
| 3.2.1 肠道菌群参与肠易激综合征发病的可能机制 | 第55-57页 |
| 3.3 肠道菌群与炎症性肠病 | 第57-68页 |
| 3.3.1 肠道细菌参与炎症性肠病发病的可能机制 | 第59-63页 |
| 3.3.2 致病微生物感染与炎症性肠病 | 第63-68页 |
| 四. 肠道微生物常用研究方法 | 第68-74页 |
| 4.1 荧光原位杂交技术 | 第68页 |
| 4.2 16SrDNA指纹技术 | 第68-70页 |
| 4.3 基因芯片技术 | 第70-71页 |
| 4.4 Real-time PCR技术 | 第71-72页 |
| 4.5 16SrDNA克隆文库 | 第72-74页 |
| 第二部分 实验研究 | 第74-150页 |
| 前言 | 第74-78页 |
| 一 肠易激综合征 | 第78-101页 |
| 1 肠易激综合征患者和健康人粪便样品中优势菌群的PCR-DGGE分析 | 第78-94页 |
| 1.1 材料与方法 | 第78-84页 |
| 1.1.1 参试者筛选及粪便样品采集 | 第78-79页 |
| 1.1.2 粪便样品预处理及细菌总DNA提取 | 第79-80页 |
| 1.1.3 微生物16S rDNA片段的PCR扩增 | 第80-81页 |
| 1.1.4 16S rDNA片段的DGGE | 第81-82页 |
| 1.1.5 DGGE切胶后PCR扩增及测序 | 第82-83页 |
| 1.1.5 数据统计与分析方法 | 第83-84页 |
| 1.2 结果与分析 | 第84-91页 |
| 1.2.1 DGGE图谱分析 | 第84页 |
| 1.2.2 粪便样品中优势菌群结构相似度分析 | 第84-87页 |
| 1.2.3 粪便样品中优势菌群多样性分析 | 第87-91页 |
| 1.3 讨论 | 第91-94页 |
| 2 粪便样品中特定菌种的相对定量Real-time PCR分析 | 第94-101页 |
| 2.1 材料与方法 | 第94-96页 |
| 2.1.1 模板稀释 | 第94页 |
| 2.1.2 细菌种属特异性引物筛选 | 第94-95页 |
| 2.1.3 Real-time PCR反应体系 | 第95页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第95-96页 |
| 2.2 结果与分析 | 第96-99页 |
| 2.2.1 Real-time PCR结果评价 | 第96页 |
| 2.2.2 肠易激综合征患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量 | 第96-99页 |
| 2.3 讨论 | 第99-101页 |
| 二. 溃疡性结肠炎 | 第101-118页 |
| 1 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中优势菌群的PCR-DGGE分析 | 第101-111页 |
| 1.1 材料与方法 | 第101-103页 |
| 1.1.1 参试者筛选及粪便样品采集 | 第101-102页 |
| 1.1.2 粪便样品预处理及细菌总DNA提取 | 第102页 |
| 1.1.3 微生物16S rDNA片段的PCR扩增 | 第102页 |
| 1.1.4 16S rDNA片段的变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第102页 |
| 1.1.5 数据处理与分析 | 第102-103页 |
| 1.2 结果与分析 | 第103-109页 |
| 1.2.1 DGGE图谱分析 | 第103页 |
| 1.2.2 粪便样品中优势菌群的结构相似度分析 | 第103-105页 |
| 1.2.3 粪便样品中优势菌群的多样性 | 第105-109页 |
| 1.3 讨论 | 第109-111页 |
| 2 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量Real-time PCR分析 | 第111-118页 |
| 2.1 材料与方法 | 第111-113页 |
| 2.1.1 模板稀释 | 第111页 |
| 2.1.2 细菌种属特异性引物筛选 | 第111-112页 |
| 2.1.3 Real-time PCR反应体系 | 第112页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第112-113页 |
| 2.2 结果与分析 | 第113-116页 |
| 2.2.1 Real-time PCR结果评价 | 第113页 |
| 2.2.2 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量 | 第113-116页 |
| 2.3 讨论 | 第116-118页 |
| 三. 克罗恩病 | 第118-136页 |
| 1 克罗恩患者和健康人粪便样品中优势菌群的PCR-DGGE分析 | 第118-130页 |
| 1.1 材料与方法 | 第118-120页 |
| 1.1.2 粪便样品预处理及细菌总DNA提取 | 第118-119页 |
| 1.1.3 微生物16S rDNA片段的PCR扩增 | 第119页 |
| 1.1.4 16S rDNA片段的DGGE | 第119页 |
| 1.1.5 数据处理与分析 | 第119-120页 |
| 1.2 结果与分析 | 第120-127页 |
| 1.2.1 DGGE图谱分析 | 第120页 |
| 1.2.2 粪便样品中优势菌群结构相似度分析 | 第120-122页 |
| 1.2.3 粪便样品中优势菌群的多样性 | 第122-127页 |
| 1.3 讨论 | 第127-130页 |
| 2 CD患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量Real-time PCR分析 | 第130-136页 |
| 2.1 材料与方法 | 第130-131页 |
| 2.1.1 模板稀释 | 第130页 |
| 2.1.2 细菌种属特异性引物筛选 | 第130页 |
| 2.1.3 Real-time PCR反应体系 | 第130页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第130-131页 |
| 2.2 结果与分析 | 第131-134页 |
| 2.2.1 Real-time PCR结果评价 | 第131页 |
| 2.2.2 克罗恩病患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量 | 第131-134页 |
| 2.3 讨论 | 第134-136页 |
| 四. 肠易激综合征、炎症性肠病和健康人患者粪便样品中短链脂肪酸测定 | 第136-150页 |
| 1 材料与方法 | 第136-138页 |
| 1.1 短链脂肪酸的萃取及气相色谱检测 | 第136页 |
| 1.2 数据分析 | 第136-138页 |
| 2 结果与分析 | 第138-147页 |
| 2.1 肠易激综合征患者和健康人粪便样品中短链脂肪酸含量 | 第138-140页 |
| 2.2 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中短链脂肪酸含量 | 第140-142页 |
| 2.3 克罗恩病患者和健康人粪便样品中短链脂肪酸含量 | 第142-144页 |
| 2.4 肠易激综合征、炎症性肠病患者和健康人粪便样品中总SCFAs含量 | 第144-147页 |
| 3 讨论 | 第147-150页 |
| 参考文献 | 第150-184页 |
| 全文结论 | 第184-186页 |
| 主要创新点 | 第186-187页 |
| 发表和待发表的SCI论文及专利申请 | 第187-188页 |
| 致谢 | 第188-189页 |
