| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第1章 引言 | 第8-21页 |
| 1.1 流感的大流行 | 第8-12页 |
| 1.1.1 二十世纪流感大流行历史回顾 | 第8-9页 |
| 1.1.2 近二十年H5亚型高致病性禽流感回顾 | 第9-12页 |
| 1.2 宿主与H5亚型高致病性禽流感病毒的关系 | 第12-16页 |
| 1.2.1 候鸟与病毒的关系 | 第12-14页 |
| 1.2.2 家禽与病毒的关系 | 第14-16页 |
| 1.2.3 人类活动与病毒的关系 | 第16页 |
| 1.3 自然环境对H5亚型高致病性禽流感的影响 | 第16-18页 |
| 1.3.1 气候对病毒暴发的影响 | 第17页 |
| 1.3.2 地理环境对病毒的影响 | 第17-18页 |
| 1.4 学术思路与研究内容 | 第18-21页 |
| 1.4.1 学术思路 | 第18-19页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第19-21页 |
| 第2章 H5亚型高致病性禽流感病毒的全球传播与进化 | 第21-35页 |
| 2.1 研究背景 | 第21-22页 |
| 2.2 数据及方法 | 第22-23页 |
| 2.2.1 疾病暴发数据及研究区分区 | 第22页 |
| 2.2.2 病毒HA序列数据 | 第22-23页 |
| 2.2.3 H5亚型高致病性禽流感病毒的进化分析 | 第23页 |
| 2.3 结果 | 第23-30页 |
| 2.3.1 H5亚型高致病性禽流感暴发时空特征与传播规律 | 第23-25页 |
| 2.3.2 2011-2015 年H5亚型禽流感病毒进化规律 | 第25-30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-35页 |
| 2.4.1 H5亚型高致病性禽流感病毒的暴发与进化 | 第30-31页 |
| 2.4.2 影响病毒进化的因素 | 第31-33页 |
| 2.4.3 研究存在的不足 | 第33-35页 |
| 第3章 黑海—地中海迁徙带H5N1亚型高致病性禽流感病毒的迁徙模式 | 第35-48页 |
| 3.1 研究背景 | 第35页 |
| 3.2 数据及方法 | 第35-38页 |
| 3.2.1 疾病暴发数据及研究区分区 | 第35-36页 |
| 3.2.2 病毒数据 | 第36-37页 |
| 3.2.3 系统发育分析 | 第37页 |
| 3.2.4 贝叶斯发生地理学重建与分析 | 第37-38页 |
| 3.3 结果 | 第38-43页 |
| 3.3.1 H5N1亚型高致病性禽流感病毒时空传播模式 | 第38-39页 |
| 3.3.2 H5N1病毒进化 | 第39-40页 |
| 3.3.3 黑海—地中海迁徙带病毒间的遗传距离 | 第40-43页 |
| 3.3.4 黑海—地中海迁徙带病毒的迁徙网络 | 第43页 |
| 3.4 讨论 | 第43-48页 |
| 3.4.1 野鸟迁徙路径和病毒的迁徙网络 | 第44-45页 |
| 3.4.2 家禽和病毒的迁徙网络 | 第45-46页 |
| 3.4.3 家禽和病毒地方性迁徙 | 第46页 |
| 3.4.4 研究区和病毒迁徙网络 | 第46页 |
| 3.4.5 研究存在的不足 | 第46-48页 |
| 第4章 斑头雁和赤麻鸭迁徙过程中对环境的选择性差异 | 第48-63页 |
| 4.1 研究背景 | 第48-49页 |
| 4.2 数据与方法 | 第49-53页 |
| 4.2.1 中亚野鸟迁徙数据 | 第49-51页 |
| 4.2.2 地理数据 | 第51页 |
| 4.2.3 迁徙季节的计算 | 第51-52页 |
| 4.2.4 停歇地的NDVI | 第52页 |
| 4.2.5 广义线性混合模型 | 第52-53页 |
| 4.3 结果 | 第53-59页 |
| 4.3.1 赤麻鸭和斑头雁的分布及飞行能力 | 第53页 |
| 4.3.2 斑头雁赤麻鸭停歇地对NDVI的特异性选择 | 第53-54页 |
| 4.3.3 GLMM回归结果 | 第54-59页 |
| 4.4 讨论 | 第59-63页 |
| 4.4.1 斑头雁和赤麻鸭停歇地与NDVI关系 | 第59-60页 |
| 4.4.2 斑头雁和赤麻鸭停歇地与禽流感的关系 | 第60-61页 |
| 4.4.3 模型效果及预测 | 第61-62页 |
| 4.4.4 研究存在的不足 | 第62-63页 |
| 第5章 结论 | 第63-66页 |
| 5.1 研究总结 | 第63-64页 |
| 5.2 主要创新点 | 第64页 |
| 5.3 研究的局限 | 第64-65页 |
| 5.4 需进一步开展的工作 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-79页 |
| 致谢 | 第79-81页 |
| 附录A 研究中使用鸟类迁徙数据 | 第81-82页 |
| 附录B H5亚型高致病性禽流感病毒序列数据 | 第82-98页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第98-99页 |
