| Acknowledgment | 第9-11页 |
| List of figures | 第11-16页 |
| List of tables | 第16-18页 |
| Abstract | 第18-19页 |
| 摘要 | 第20-22页 |
| 1 Introduction | 第22-33页 |
| 1.1 Plant rhizosphere | 第22页 |
| 1.2 Plant root-colonizing bacteria | 第22-23页 |
| 1.3 Plant growth-promoting rhizobacteria | 第23-30页 |
| 1.3.1 Direct plant growth promotion | 第24-25页 |
| 1.3.2 Indirect plant growth promotion | 第25-30页 |
| 1.3.2.1 Biocontrol of soil born pathogens | 第25-26页 |
| 1.3.2.2 Antibiotic production | 第26页 |
| 1.3.2.3 Siderophores | 第26-27页 |
| 1.3.2.4 Parasitism | 第27页 |
| 1.3.2.5 Competition for nutrients and niches | 第27页 |
| 1.3.2.6 Biocontrol by inducing systemic resistance | 第27-28页 |
| 1.3.2.7 Signaling in plants | 第28-30页 |
| a.Microbial signals in ISR | 第29页 |
| b.Microbial signals in SAR | 第29-30页 |
| 1.4 Present investigations | 第30-32页 |
| 1.5 Aim of the study | 第32-33页 |
| 2 Isolation and Characterization of Antifungal Compounds | 第33-53页 |
| 2.1 Abstract | 第33页 |
| 2.2 Introduction | 第33-35页 |
| 2.3 Materials and Methods | 第35-40页 |
| 2.3.1 Bacteria and fungi cultures | 第35页 |
| 2.3.2 Identification of Paenibacillus polymyxa SQR-21 | 第35-36页 |
| 2.3.3 Antifungal activity assay | 第36页 |
| 2.3.4 Isolation and purification of antifungal compounds | 第36-37页 |
| 2.3.5 Mass spectrometry | 第37页 |
| 2.3.6 Sensitivity to temperature,pH and degradative enzymes | 第37-38页 |
| 2.3.7 Antifungal volatile compounds assay | 第38页 |
| 2.3.8 Hydrolytic,nitrogenase and phosphatase activity test | 第38-39页 |
| 2.3.9 Effect of antifungal compounds on fungal mycelium and spores | 第39页 |
| 2.3.10 Statistical analysis | 第39-40页 |
| 2.4 Results | 第40-49页 |
| 2.4.1 Identifiation of SQR-21 | 第40-42页 |
| 2.4.2 Characteristics of antifungal compounds | 第42-45页 |
| 2.4.3 Antifungal volatile compounds assay | 第45-46页 |
| 2.4.4 Hydrolytic and phosphatase activity test | 第46-48页 |
| 2.4.5 Effect of antifungal compounds on fungal mycelium and spores | 第48-49页 |
| 2.5 Discussion | 第49-53页 |
| 3 Factors Effecting Growth and Production of Antifungal Compounds by Paenibacillus polymyxa SQR21 | 第53-96页 |
| 3.1 Abstract | 第53页 |
| 3.2 Introduction | 第53-55页 |
| 3.3 Material and methods | 第55-60页 |
| 3.3.1 Bacterial and fungal cultures | 第55页 |
| 3.3.2 Antifungal activity | 第55页 |
| 3.3.3 Factors effecting production of antifungal compounds | 第55-57页 |
| 3.3.3.1 Best medium and extract selection | 第55-56页 |
| 3.3.3.2 Effect of different carbon and nitrogen sources | 第56页 |
| 3.3.3.3 Effect of temperature and pH | 第56页 |
| 3.3.3.4 Effect of incubation time | 第56页 |
| 3.3.3.5 Effect of metal ions | 第56-57页 |
| 3.3.4 Metal ion interactive study | 第57-59页 |
| 3.3.4.1 Methodology and design of experiment | 第57-59页 |
| 3.3.5 RNA extraction and primer design | 第59页 |
| 3.3.6 Reverse transcription and real time PCR assay | 第59-60页 |
| 3.4 Results and Discussion | 第60-96页 |
| 3.4.1 Best medium and extract selection | 第60-61页 |
| 3.4.2 Effect of different carbon and nitrogen sources | 第61页 |
| 3.4.3 Effect of temperature and pH | 第61-63页 |
| 3.4.4 Effect of incubation time | 第63-64页 |
| 3.4.5 Effect of metal ions | 第64-76页 |
| 3.4.5.1 Magnesium(Mg~(2+)) | 第64-66页 |
| 3.4.5.2 Iron(Fe~(3+)) | 第66-67页 |
| 3.4.5.3 Zinc(Zn~(2+)) | 第67-68页 |
| 3.4.5.4 Calcium(Ca~(2+)) | 第68-70页 |
| 3.4.5.5 Nickel(Ni~(2+)) | 第70-71页 |
| 3.4.5.6 Manganese(Mn~(2+)) | 第71-72页 |
| 3.4.5.7 Copper(Cu~(2+)) | 第72-76页 |
| 3.4.6 Metalion interactive study | 第76-96页 |
| 3.4.6.1 Effect of Ca~(2+),Ni~(2+),M1n~(2+) and Cn~(2+) on antifunga activity | 第76-86页 |
| 3.4.6.2 Effect of Zn~(2+),Fe~(3+) and Mg~(2+) on antifungal activity | 第86-96页 |
| 4 Response of Paenibacillus polymyxa SQR-21 to Iron Availability: Alternation in Growth,Fe~(3+) Reductase Activity And Siderophore Production | 第96-110页 |
| 4.1 Abstract | 第96页 |
| 4.2 Introduction | 第96-98页 |
| 4.3 Material and methods | 第98-100页 |
| 4.3.1 Glassware preparation | 第98页 |
| 4.3.2 Bacterial cultures | 第98页 |
| 4.3.3 Siderophore assay on solid medium | 第98页 |
| 4.3.4 Preparation of liquid culture medium | 第98-99页 |
| 4.3.5 Siderophore assays in liquid culture | 第99页 |
| 4.3.6 Extracellular Fe~(3+)-reducing activity(EC-FeR) | 第99页 |
| 4.3.7 Cell surface Fe~(3+)-reductase activity(CS-FeR) | 第99-100页 |
| 4.3.8 Cellular protein extraction and electrophoresis | 第100页 |
| 4.3.8 Statistical analysis | 第100页 |
| 4.4 Results and Discussion | 第100-110页 |
| 4.4.1 Effect of iron on growth in liquid culture and on production .of siderophores on solid medium | 第100-102页 |
| 4.4.2 Effect of iron on the pH of liquid medium | 第102-103页 |
| 4.4.3 Cell surface Fe~(3+)-reductase activity(CS-FR) | 第103-104页 |
| 4.4.4 Extracellular Fe~(3+)-reducing activity(EC-FR) | 第104-106页 |
| 4.4.5 Effect of iron on siderophore production in liquid medium | 第106-107页 |
| 4.4.6 Effect of iron on cellular proteins expression | 第107-110页 |
| Conclusions | 第110-112页 |
| References | 第112-131页 |
| List of media | 第131-134页 |
| List of publications | 第134-135页 |
