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寡孢节丛孢SET-domain相关基因功能的初步研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
目录第8-11页
第一章 食线虫真菌研究概况及长链非编码RNA研究进展第11-19页
    1 食线虫真菌的研究概况第11-12页
    2 长非编码RNA的功能及研究进展第12-16页
    3 SET-domain蛋白的研究进展第16-18页
    4 本文研究研究思路及意义第18-19页
第二章 寡孢节丛孢SET-domain蛋白的序列分析及表达分析第19-31页
    1 前言第19页
    2 寡孢节丛孢SET-domain蛋白的序列分析第19-20页
        2.1 SET-domain蛋白序列来源第19-20页
        2.2 SET-domain功能结构域分析第20页
        2.3 SET-domain系统发育分析第20页
    3 寡孢节丛孢SET-domain蛋白的表达分析第20-23页
        3.1 线虫提取液制备第20-21页
        3.2 寡孢节丛孢野生菌株的诱导第21页
        3.3 RNA的提取及检测第21-22页
        3.4 RNA的反转录第22页
        3.5 Real-Time PCR反应体系第22-23页
    4 结果分析第23-30页
        4.1 SET-domain基因检索结果第23-24页
        4.2 SET-domain基因功能分析结果第24-25页
        4.3 SET-domain基因系统发育分析第25-26页
        4.4 SET-domain基因表达分析结果第26-30页
            4.4.1 RNA提取第26页
            4.4.2 RT-PCR分析第26-30页
    5 讨论第30-31页
第三章 寡孢节丛孢SET-domain蛋白基因敲除质粒构建第31-47页
    1 前言第31-32页
    2 材料与仪器第32-34页
        2.1 实验材料第32-33页
        2.2 主要试剂和培养基配方第33-34页
        2.3 实验用仪器设备第34页
        2.4 实验用酶和试剂盒第34页
    3 实验方法第34-43页
        3.1 基因上下游引物设计及扩增第34-36页
        3.2 寡孢节丛孢基因组DNA提取第36-37页
        3.3 质粒PSCN44的提取第37页
        3.4 质粒pRS426的酶切第37-38页
        3.5 酵母转化第38-40页
            3.5.1 化学转化第38-39页
            3.5.2 电转化第39-40页
        3.6 酵母转化子验证第40-41页
        3.7 大肠杆菌(DH5α)的转化第41-42页
        3.8 大肠杆菌转化子验证第42-43页
    4. 实验结果第43-46页
        4.1 寡孢节丛孢中五个set-domain基因5'端和3'端同源片段及hph扩增第43-44页
        4.2 酵母转化结果第44-45页
        4.3 大肠杆菌中全长片段的获得第45-46页
    5 讨论第46-47页
第四章 寡孢节丛孢原生质体的制备、转化及转化子的筛选和验证第47-64页
    1 前言第47页
    2 实验材料和仪器第47-49页
        2.1 实验菌株第47-48页
        2.2 实验所用载体第48页
        2.3 主要溶液及培养基第48-49页
    3 实验方法第49-57页
        3.1 敲除载体全长片段扩增及回收第49页
        3.2 寡孢节丛孢原生质体的制备第49-50页
        3.3 寡孢节丛孢原生质体的转化第50页
        3.4 寡孢节丛孢敲除转化子基因组提取第50-51页
        3.5 敲除转化子的PCR验证第51-52页
        3.6 敲除转化子的Southern blot验证第52-57页
    4 实验结果第57-61页
        4.1 全长片段的扩增第57-58页
        4.2 原生质体的制备第58页
        4.3 转化子PCR验证第58-59页
        4.4 转化子Southern blot验证第59-61页
    5 讨论第61-64页
        5.1 原生质体制备及转化第61-62页
        5.2 敲除转化子的PCR验证第62页
        5.3 敲除转化子的Southern blot验证第62-64页
第五章 寡孢节丛孢野生型菌株与敲除菌株的表型特征比较和分析第64-74页
    1 前言第64页
    2 实验材料及仪器第64-65页
        2.1 实验菌株第64页
        2.2 实验仪器第64页
        2.3 主要药品第64-65页
        2.4 实验培养基第65页
    3 实验方法第65-67页
        3.1 实验线虫的培养第65-66页
        3.2 寡孢节丛孢原始菌株和突变菌株的表型观察和捕食线虫能力比较第66-67页
    4 实验结果第67-72页
        4.1 潮霉素稳定性检测第67页
        4.2 生长速率的比较第67-68页
        4.3 产孢比较第68-69页
        4.4 产捕食器官形态数量的比较第69-71页
        4.5 杀线虫能力比较第71-72页
    5 小结第72-74页
第六章 寡孢节丛孢野生型菌株及△661、△197敲除菌株的产孢形成相关基因的Real-TimePCR分析第74-82页
    1 前言第74页
    2 实验材料及仪器第74页
    3 实验方法第74-75页
        3.1 菌丝样品的收集第74-75页
        3.2 寡孢节丛孢及敲除菌株样品总RNA的提取及反转录第75页
        3.3 Real-Time PCR(相对定量PCR)第75页
    4 实验结果第75-80页
        4.1 溶解曲线分析第75-76页
        4.2 定量结果分析第76-79页
        4.3 定量结果的跑胶第79-80页
    5 讨论第80-82页
第七章 全文小结与展望第82-84页
参考文献第84-89页
附录第89-95页
    附录1 论文中使用的缩写及中英文对照第89-90页
    附录2 Real-Time PCR引物第90-92页
    附录3 论文中使用的质粒图第92-93页
    附录4 常用的数据库和网上生物学资源第93-94页
    附录5 在读硕士期间(待)发表、撰写的学术论文第94-95页
致谢第95页

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