中文摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-11页 |
英文缩略表 | 第12-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-22页 |
1.1 中黑盲蝽简介 | 第13页 |
1.2 昆虫病毒的研究概况 | 第13-15页 |
1.3 高通量测序技术简介 | 第15-17页 |
1.3.1 测序技术的发展 | 第15-17页 |
1.3.2 高通量测序的应用 | 第17页 |
1.4 RNA-SEQ介绍 | 第17-19页 |
1.4.1 RNA-Seq技术流程 | 第18-19页 |
1.4.2 RNA-Seq的应用 | 第19页 |
1.5 研究内容 | 第19-20页 |
1.5.1 转录组分析 | 第19-20页 |
1.5.2 病毒基因组结构分析 | 第20页 |
1.5.3 检测病毒感染率 | 第20页 |
1.6 本研究目的和意义 | 第20页 |
1.7 研究的技术路线 | 第20-22页 |
第二章 中黑盲蝽体内三种新病毒的发现 | 第22-32页 |
2.1 前言 | 第22页 |
2.2 材料与方法 | 第22-25页 |
2.2.1 供试昆虫 | 第22页 |
2.2.2 仪器设备与主要试剂 | 第22-23页 |
2.2.3 实验方法 | 第23-25页 |
2.3 结果与分析 | 第25-31页 |
2.3.1 RNA提取与质量检测 | 第25-26页 |
2.3.2 Illumina测序和序列组装 | 第26-28页 |
2.3.3 功能注释 | 第28-31页 |
2.4 小结 | 第31-32页 |
第三章 ASV1的基因组结构与感染情况 | 第32-49页 |
3.1 前言 | 第32页 |
3.2 材料与方法 | 第32-42页 |
3.2.1 供试昆虫与供试植物 | 第32-33页 |
3.2.2 仪器设备与主要试剂 | 第33-35页 |
3.2.3 实验方法 | 第35-42页 |
3.3 结果与分析 | 第42-48页 |
3.3.1 ASV1阳性样本寻找及基因全长序列验证 | 第42-43页 |
3.3.2 系统发育树的构建 | 第43-45页 |
3.3.3 ASV1基因组结构分析 | 第45-46页 |
3.3.4 不同地区中黑盲蝽的ASV1携带率 | 第46-47页 |
3.3.5 中黑盲蝽水平传毒 | 第47-48页 |
3.4 小结 | 第48-49页 |
第四章 ASV2的基因组结构与感染情况 | 第49-58页 |
4.1 前言 | 第49页 |
4.2 材料与方法 | 第49-51页 |
4.2.1 供试昆虫 | 第49页 |
4.2.2 仪器设备与主要试剂 | 第49页 |
4.2.3 实验方法 | 第49-51页 |
4.3 结果与分析 | 第51-57页 |
4.3.1 ASV2阳性样本寻找及基因全长序列验证 | 第51-52页 |
4.3.2 系统发育树的构建 | 第52-55页 |
4.3.3 ASV2基因组结构分析 | 第55-56页 |
4.3.4 不同地区中黑盲蝽的ASV2携带率 | 第56-57页 |
4.4 小结 | 第57-58页 |
第五章 ASV3的基因组结构与感染情况 | 第58-65页 |
5.1 前言 | 第58页 |
5.2 材料与方法 | 第58-60页 |
5.2.1 供试昆虫 | 第58页 |
5.2.2 仪器设备与主要试剂 | 第58页 |
5.2.3 实验方法 | 第58-60页 |
5.3 结果与分析 | 第60-64页 |
5.3.1 ASV3阳性样本寻找及基因全长序列验证 | 第60页 |
5.3.2 系统发育树的构建 | 第60-61页 |
5.3.3 ASV3基因组结构分析 | 第61-63页 |
5.3.4 不同地区中黑盲蝽的ASV3携带率 | 第63-64页 |
5.4 小结 | 第64-65页 |
第六章 总结与展望 | 第65-67页 |
6.1 总结 | 第65-66页 |
6.2 展望 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-76页 |
附录 | 第76-77页 |
致谢 | 第77-78页 |