| 摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 第1章 引言 | 第9-21页 |
| 1.1 选题目的与意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第10-19页 |
| 1.2.1 网络生物学的诞生 | 第10-11页 |
| 1.2.2 生物网络重构和复杂网络 | 第11-14页 |
| 1.2.3 蛋白质相互作用网络 | 第14-17页 |
| 1.2.4 致病基因检测 | 第17-19页 |
| 1.3 论文研究的主要内容 | 第19-21页 |
| 第2章 复杂网络理论及蛋白互作网络建模 | 第21-37页 |
| 2.1 复杂网络常用拓扑性质 | 第21-27页 |
| 2.1.1 中心性 | 第21-24页 |
| 2.1.2 聚类系数 | 第24-25页 |
| 2.1.3 网络模体 | 第25-27页 |
| 2.2 复杂网络模型 | 第27-33页 |
| 2.2.1 经典网络模型 | 第28-31页 |
| 2.2.2 二分网络模型 | 第31-32页 |
| 2.2.3 层次网络模型 | 第32-33页 |
| 2.2.4 多子网复合复杂网络模型 | 第33页 |
| 2.3 蛋白互作网络模型及多因素网络模体 | 第33-36页 |
| 2.4 小结 | 第36-37页 |
| 第3章 蛋白互作网络模型性质分析 | 第37-53页 |
| 3.1 问题引出 | 第37-38页 |
| 3.2 分析策略 | 第38-41页 |
| 3.2.1 面向蛋白互作网络的分析指标 | 第38-40页 |
| 3.2.2 致病基因检测 | 第40-41页 |
| 3.3 基于蛋白质互作网络的人类蛋白拓扑分析 | 第41-47页 |
| 3.3.1 致病蛋白拓扑重要性分析 | 第41-43页 |
| 3.3.2 致病蛋白所处网络位置分析 | 第43-46页 |
| 3.3.3 致病蛋白与必需蛋白的拓扑关联分析 | 第46-47页 |
| 3.4 融合新拓扑特征的致病基因检测 | 第47-51页 |
| 3.4.1 用于致病基因检测的拓扑性质 | 第47-48页 |
| 3.4.2 新拓扑性质可有效提升致病基因的检测效果 | 第48-51页 |
| 3.5 小结 | 第51-53页 |
| 第4章 致病基因与必需基因关联关系分析 | 第53-69页 |
| 4.1 问题引出 | 第53-54页 |
| 4.2 分析策略 | 第54-58页 |
| 4.2.1 基于r_X_i~n哆分析拓扑关联 | 第54-56页 |
| 4.2.2 致病基因检测 | 第56-58页 |
| 4.3 基于r_v~n的拓扑关联分析 | 第58-61页 |
| 4.4 融合新拓扑特征的致病基因检测 | 第61-67页 |
| 4.5 小结 | 第67-69页 |
| 第5章 基于蛋白互作网络模型的致病基因检测 | 第69-83页 |
| 5.1 问题引出 | 第69-71页 |
| 5.2 数据与方法 | 第71-73页 |
| 5.2.1 人类基因列表、遗传疾病列表与人类蛋白交互作用数据 | 第71页 |
| 5.2.2 基因排序 | 第71-73页 |
| 5.3 实验结果与分析 | 第73-80页 |
| 5.4 小结 | 第80-83页 |
| 第6章 总结与展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-97页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第97-99页 |
| 致谢 | 第99-101页 |