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甜瓜株型和抗白粉病性状的遗传与全基因组关联分析

致谢第8-13页
缩略词表第13-15页
摘要第15-17页
Abstract第17-18页
1 前言第19-20页
    1.1 甜瓜生物学特征第19页
    1.2 研究背景第19-20页
2 文献综述第20-32页
    2.1 甜瓜的起源与分类第20-21页
    2.2 甜瓜重要农艺性状的研究进展第21-26页
        2.2.1 甜瓜株型性状第21-24页
        2.2.2 甜瓜抗白粉病性状第24-26页
        2.2.3 甜瓜耐裂果性状第26页
    2.3 甜瓜遗传图谱与分子标记的研究进展第26-27页
    2.4 SNP标记的高通量开发与分型第27-29页
    2.5 全基因组关联分析研究进展第29页
    2.6 本研究的目的与意义第29-32页
3 甜瓜株型性状的遗传分析第32-42页
    3.1 引言第32页
    3.2 材料与方法第32-35页
        3.2.1 试验材料第32-33页
        3.2.2 试验方法第33-34页
        3.2.3 统计分析第34-35页
    3.3 结果与分析第35-40页
        3.3.1 四世代株型相关性状值分布第35-37页
        3.3.2 遗传模型的选择和检测第37-39页
        3.3.3 遗传参数的估计第39-40页
    3.4 讨论第40-42页
4 甜瓜株型性状全基因组关联分析第42-53页
    4.1 引言第42页
    4.2 材料与方法第42-44页
        4.2.1 试验材料第42页
        4.2.2 试验方法第42页
        4.2.3 性状调查第42页
        4.2.4 甜瓜基因组DNA提取第42-43页
        4.2.5 RAD文库构建与测序第43页
        4.2.6 SNP基因型分型第43页
        4.2.7 全基因组关联分析第43-44页
    4.3 结果与分析第44-50页
        4.3.1 表型数据分析第44-45页
        4.3.2 限制性内切酶与测序深度的选择第45-46页
        4.3.3 测序数据的统计第46-48页
        4.3.4 甜瓜五个性状的全基因组关联分析第48-50页
    4.4 讨论第50-53页
5 甜瓜耐裂果性状的遗传分析第53-63页
    5.1 引言第53页
    5.2 材料与方法第53-55页
        5.2.1 试验材料第53-54页
        5.2.2 试验方法第54页
        5.2.3 性状调查第54页
        5.2.4 统计分析第54-55页
    5.3 结果与分析第55-61页
        5.3.1 甜瓜耐裂果性状鉴定方法和评价标准第55-56页
        5.3.2 六世代耐裂果性状值分布第56-58页
        5.3.3 遗传模型的选择和检测第58-59页
        5.3.4 遗传参数的估计第59-61页
    5.4 讨论第61-63页
6 甜瓜抗白粉病性状的全基因组关联分析第63-72页
    6.1 引言第63页
    6.2 材料与方法第63-66页
        6.2.1 试验材料第63页
        6.2.2 试验方法第63页
        6.2.3 甜瓜基因组DNA提取第63-64页
        6.2.4 白粉病接种、症状及病原菌形态观察第64页
        6.2.5 抗病性调查与混池构建第64页
        6.2.6 2b-RAD文库构建与测序第64页
        6.2.7 SNP calling与Genotyping第64-65页
        6.2.8 全基因组关联分析第65-66页
    6.3 结果与分析第66-68页
        6.3.1 白粉病病原与免疫叶片镜检第66-67页
        6.3.2 甜瓜大棚内接种白粉病抗性遗传规律分析第67页
        6.3.3 测序数据的统计与SNP基因型分型第67-68页
        6.3.4 甜瓜抗白粉病性状的全基因组关联分析第68页
    6.4 讨论第68-72页
7 总结、展望与创新性第72-74页
    7.1 全文总结第72-73页
    7.2 本研究创新性第73页
    7.3 后续展望第73-74页
参考文献第74-89页
附录一第89-90页
附录二第90-98页
附录三第98-102页
攻读博士学位期间主要的研究成果第102页

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