| 中文摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 缩略语对照表 | 第8-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-23页 |
| 1.1 铜绿假单胞菌 | 第12-14页 |
| 1.1.1 铜绿假单胞菌介绍 | 第12-13页 |
| 1.1.2 铜绿假单胞菌的发病机制及耐药性 | 第13-14页 |
| 1.2 铜绿假单胞菌的群体感应系统 | 第14-18页 |
| 1.2.1 群体感应系统 | 第14-16页 |
| 1.2.2 群体感应系统的组成 | 第16-17页 |
| 1.2.3 群体感应系统的复杂性和重要性 | 第17-18页 |
| 1.3 铜绿假单胞菌的生物被膜(biofilm,BF) | 第18-19页 |
| 1.4 铜绿假单胞菌中绿脓菌素的重要性 | 第19-21页 |
| 1.5 RsaL在QS的调节系统中扮演着重要角色 | 第21-22页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第23-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-29页 |
| 2.1.1 菌株、质粒和引物 | 第23-27页 |
| 2.1.2 培养基、缓冲液和抗生素使用 | 第27-28页 |
| 2.1.3 试剂 | 第28页 |
| 2.1.4 仪器 | 第28-29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-37页 |
| 2.2.1 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)实验 | 第29-30页 |
| 2.2.2 RsaL蛋白的表达纯化 | 第30-31页 |
| 2.2.3 电泳迁移率实验(EMSA) | 第31-32页 |
| 2.2.4 质粒的构建 | 第32页 |
| 2.2.5 rsaL突变体的构建 | 第32-33页 |
| 2.2.6 基因表达水平的检测 | 第33页 |
| 2.2.7 PQS的提取 | 第33-34页 |
| 2.2.8 定点突变 | 第34页 |
| 2.2.9 生物被膜检测 | 第34-35页 |
| 2.2.10 绿脓菌素检测 | 第35页 |
| 2.2.11 蛋白RsaL的晶体结构测定 | 第35页 |
| 2.2.12 蛋白RsaL的晶体结构的解析 | 第35-37页 |
| 第三章 结果 | 第37-53页 |
| 3.1 RsaL蛋白的ChIP-seq结果分析及验证 | 第37-39页 |
| 3.1.1 ChIP-seq结果的分析 | 第37-38页 |
| 3.1.2 EMSA实验对ChIP-seq结果的验证 | 第38-39页 |
| 3.2 RsaL蛋白调节pqsH基因的表达和PQS的合成 | 第39-43页 |
| 3.2.1 RsaL蛋白识别特殊的DNA序列 | 第39-40页 |
| 3.2.2 RsaL蛋白调节PQS系统 | 第40-42页 |
| 3.2.3 rsaL突变体中生物被膜的降低是由pqsH基因引起的 | 第42-43页 |
| 3.3 rsaL突变体影响cdpR基因的表达 | 第43-45页 |
| 3.3.1 RsaL调节cdpR基因的表达 | 第43页 |
| 3.3.2 rsaL突变体中绿脓菌素的升高是由cdpR基因引起的 | 第43-44页 |
| 3.3.3 RsaL和CdpR竞争性的结合cdpR启动子 | 第44-45页 |
| 3.4 RsaL的蛋白晶体结构 | 第45-48页 |
| 3.4.1 蛋白质Rsal晶体的衍射数据的收集 | 第45-46页 |
| 3.4.2 蛋白质Rsal晶体的衍射数据的分析 | 第46页 |
| 3.4.3 蛋白质Rsal晶体结构 | 第46-48页 |
| 3.5 Rsal特异识别DNA序列 | 第48-50页 |
| 3.6 RsaL蛋白中起关键作用的氨基酸 | 第50-53页 |
| 3.6.1 EMSA证明了RsaL蛋白中重要的氨基酸 | 第50-51页 |
| 3.6.2 体内验证RsaL蛋白中某些氨基酸的重要性 | 第51-53页 |
| 第四章 讨论 | 第53-57页 |
| 参考文献 | 第57-65页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
