玉米穗部性状的联合连锁分析
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 缩写名词表 | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-20页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第9页 |
| 1.2 连锁分析 | 第9-10页 |
| 1.3 关联分析 | 第10-13页 |
| 1.3.1 关联分析的发展 | 第10-11页 |
| 1.3.2 植物关联分析的常用模型 | 第11-12页 |
| 1.3.3 植物关联分析的优化模型 | 第12-13页 |
| 1.4 混合线性模型 | 第13-15页 |
| 1.4.1 建模目的 | 第13页 |
| 1.4.2 方差分量的估计 | 第13-14页 |
| 1.4.3 显著性统计检验 | 第14页 |
| 1.4.4 固定效应值和随机效应值 | 第14-15页 |
| 1.5 多亲本群体定位分析 | 第15-17页 |
| 1.5.1 多亲本群体的遗传设计 | 第15-16页 |
| 1.5.2 多亲本群体的统计模型 | 第16-17页 |
| 1.6 重组BIN图谱 | 第17-18页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第18-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-31页 |
| 2.1 材料 | 第20-21页 |
| 2.2 表型数据与基因型数据的处理 | 第21-23页 |
| 2.2.1 表型数据的采集 | 第21-22页 |
| 2.2.2 基因型数据的整合 | 第22-23页 |
| 2.3 联合连锁分析模型 | 第23-28页 |
| 2.3.1 模型的建立 | 第23-24页 |
| 2.3.2 模型参数的求解 | 第24-27页 |
| 2.3.3 显著性检验 | 第27-28页 |
| 2.4 基于Z统计量的META分析 | 第28页 |
| 2.5 模拟数据分析 | 第28-29页 |
| 2.6 互作效应分析 | 第29-31页 |
| 2.6.1 QTL-环境互作分析 | 第29-30页 |
| 2.6.2 QTL-QTL互作分析 | 第30页 |
| 2.6.3 联合遗传效应分析 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-48页 |
| 3.1 整合群体遗传结构分析结果 | 第31-32页 |
| 3.2 整合群体表型数据分析结果 | 第32-33页 |
| 3.2.1 表型鉴定系统测试结果 | 第32-33页 |
| 3.2.2 穗部表型鉴定结果 | 第33页 |
| 3.3 整合群体基因型数据分析结果 | 第33-37页 |
| 3.3.1 重组自交系群体遗传图谱 | 第33-35页 |
| 3.3.2 物理图谱与遗传图谱的不一致性 | 第35-37页 |
| 3.3.3 整合群体重组Bin图谱 | 第37页 |
| 3.4 联合连锁分析结果 | 第37-42页 |
| 3.4.1 群体参数的求解 | 第37-38页 |
| 3.4.2 标记显著性检验 | 第38-40页 |
| 3.4.3 QTL效应值 | 第40-42页 |
| 3.5 不同模型定位结果的互补性 | 第42-45页 |
| 3.6 互作效应分析结果 | 第45-48页 |
| 3.6.1 QTL-环境互作分析结果 | 第45-46页 |
| 3.6.2 QTL-QTL互作分析结果 | 第46-48页 |
| 4 讨论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 附录 | 第55-58页 |
| 附录一 矩阵行列式推论的证明 | 第55-56页 |
| 附录二SHERMAN-MORRISON公式的证明 | 第56-57页 |
| 附录三 作者简介 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
