| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 引言 | 第8页 |
| 1.2 研究背景 | 第8-10页 |
| 1.2.1 研究意义 | 第8-9页 |
| 1.2.2 研究现状 | 第9-10页 |
| 1.3 论文研究主要内容 | 第10页 |
| 1.4 论文结构安排 | 第10-12页 |
| 2 蛋白质数据处理概述 | 第12-23页 |
| 2.1 引言 | 第12页 |
| 2.2 蛋白质简介 | 第12-15页 |
| 2.2.1 数据来源 | 第14-15页 |
| 2.3 蛋白质的结构层次 | 第15-17页 |
| 2.4 蛋白质序列分析 | 第17-19页 |
| 2.4.1 位置特异性得分矩阵 | 第17-19页 |
| 2.5 蛋白质二级结构分析 | 第19-21页 |
| 2.5.1 蛋白质二级结构特征 | 第20-21页 |
| 2.6 提取特征向量 | 第21-22页 |
| 2.7 本章小结 | 第22-23页 |
| 3 基于支持向量回归集成的蛋白质-ATP绑定位点预测模型 | 第23-35页 |
| 3.1 引言 | 第23页 |
| 3.2 预测模型建立 | 第23-31页 |
| 3.2.1 支持向量机 | 第24-27页 |
| 3.2.2 支持向量回归 | 第27-28页 |
| 3.2.2.1 提出思想 | 第27-28页 |
| 3.2.2.2 方法原理 | 第28页 |
| 3.2.3 朴素贝叶斯 | 第28-30页 |
| 3.2.4 KNN | 第30页 |
| 3.2.5 随机森林 | 第30-31页 |
| 3.3 不平衡处理 | 第31-32页 |
| 3.3.1 随机下采样 | 第32页 |
| 3.4 集成方法 | 第32-34页 |
| 3.4.1 最大集成法 | 第34页 |
| 3.4.2 最小集成法 | 第34页 |
| 3.4.3 平均集成法 | 第34页 |
| 3.4.4 加权集成法 | 第34页 |
| 3.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 4 蛋白质-ATP绑定位点预测与实验 | 第35-49页 |
| 4.1 引言 | 第35页 |
| 4.2 性能评估 | 第35-37页 |
| 4.2.1 蛋白质绑定位点检测的评价标准 | 第35-36页 |
| 4.2.2 基于蛋白质水平的κ-重交叉验证 | 第36-37页 |
| 4.3 实验结果与分析讨论 | 第37-47页 |
| 4.3.1 特征提取比较实验 | 第37-39页 |
| 4.3.1.1 特征处理比较实验 | 第37-38页 |
| 4.3.1.2 特征选取类型比较实验 | 第38-39页 |
| 4.3.1.3 分析讨论 | 第39页 |
| 4.3.2 最优特征向量选取实验 | 第39-40页 |
| 4.3.3 预测模型比较实验 | 第40-45页 |
| 4.3.4 随机下采样实验 | 第45-46页 |
| 4.3.5 集成实验比较 | 第46-47页 |
| 4.4 本章小结 | 第47-49页 |
| 5 总结与展望 | 第49-51页 |
| 5.1 研究工作总结 | 第49页 |
| 5.2 未来的工作与展望 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 附录 | 第59页 |