| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1 绪论 | 第11-28页 |
| 1.1 禽流感病毒的生物学特性 | 第11-13页 |
| 1.2 禽流感病毒的宿主范围及传播机制 | 第13-14页 |
| 1.3 禽流感的历史、发生与分布 | 第14-21页 |
| 1.4 野鸟在禽流感病毒进化和传播中的作用 | 第21-24页 |
| 1.4.1 野鸟是禽流感病毒的天然基因库 | 第21-22页 |
| 1.4.2 野鸟迁徙促进禽流感病毒进化和传播 | 第22-24页 |
| 1.5 H6N2禽流感病毒 | 第24-25页 |
| 1.6 洞庭湖自然保护区禽流感研究 | 第25-27页 |
| 1.7 本课题的研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第28-31页 |
| 2.1.1 实验耗材 | 第28-29页 |
| 2.1.2 实验试剂和试剂盒 | 第29-30页 |
| 2.1.3 实验器具和设备 | 第30-31页 |
| 2.2 实验方法 | 第31-36页 |
| 2.2.1 样本采集 | 第31页 |
| 2.2.2 病毒RNA提取 | 第31-32页 |
| 2.2.3 Real-time RT-PCR检测阳性 | 第32-33页 |
| 2.2.4 一步法由病毒RNA获得P1扩增产物 | 第33-34页 |
| 2.2.5 PCR (Polymerase Chain Reaction)扩增序列 | 第34页 |
| 2.2.6 PCR产物鉴定 | 第34页 |
| 2.2.7 PCR产物胶回收 | 第34-35页 |
| 2.2.8 测定胶回收的DNA浓度 | 第35-36页 |
| 2.3 实验分析软件 | 第36页 |
| 2.4 引物设计 | 第36页 |
| 2.5 序列分析和系统进化树构建 | 第36-37页 |
| 3 结果 | 第37-59页 |
| 3.1 洞庭湖自然保护区野鸟禽流感感染与携带状况 | 第37-39页 |
| 3.2 H6N2毒株系统进化分析 | 第39-59页 |
| 3.2.1 氨基酸序列特异性位点分析 | 第39-41页 |
| 3.2.2 核苷酸序列最高同源性比较 | 第41-44页 |
| 3.2.3 系统进化树 | 第44-59页 |
| 4 讨论 | 第59-67页 |
| 4.1 湖南东洞庭湖自然保护区野生鸟类禽流感感染和传播 | 第59-60页 |
| 4.2 H6N2亚型毒株系统进化分析 | 第60-67页 |
| 4.2.1 核苷酸序列最高同源性比较 | 第60页 |
| 4.2.2 氨基酸特异性位点分析 | 第60-62页 |
| 4.2.3 系统进化树分析 | 第62-65页 |
| 4.2.4 致病力 | 第65-67页 |
| 5 结论 | 第67-68页 |
| 6 附录 | 第68-81页 |
| 6.1 系统进化树图中所使用的分支注释 | 第68页 |
| 6.2 Real-time RT-PCR检测阳性方法说明书 | 第68-73页 |
| 6.3 PrimeScript~(TM) One Step RT-PCR Kit Ver.2方法说明书 | 第73-78页 |
| 6.4 MightyAmp~(TM) DNA Polymerase Ver.2说明书 | 第78-81页 |
| 7 参考文献 | 第81-88页 |
| 8 致谢 | 第88页 |
