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云南省煤烟污染高暴露地区中肺癌相关基因的DNA甲基化研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略表第17-18页
第一章 前言第18-35页
    1.1 肺癌现状第18-19页
        1.1.1 国内外肺癌研究背景第18-19页
        1.1.2 云南当地肺癌研究背景第19页
    1.2 肺癌诊断标准第19-24页
        1.2.1 肺癌分类第19-22页
        1.2.2 肺癌分期第22-24页
    1.3 肺癌病因的高危因素第24-25页
    1.4 肺癌发生机制第25-28页
        1.4.1 DNA甲基化与肿瘤发生第26-27页
        1.4.2 DNA甲基化的重要性第27-28页
    1.5 DNA甲基化检测技术第28-32页
        1.5.1 特异位点的甲基化检测第28-31页
        1.5.2 全基因组的甲基化分析第31-32页
    1.6 基因DNA甲基化位点筛选第32-34页
        1.6.1 与肺癌相关基因的异常DNA甲基化第32-33页
        1.6.2 与环境暴露因素(吸烟)相关基因的异常DNA甲基化第33-34页
    1.7 研究目的与意义第34-35页
第二章 肺癌DNA甲基化测定第35-62页
    2.1 实验材料第35-38页
        2.1.1 实验样本第35页
        2.1.2 主要仪器第35-37页
        2.1.3 主要试剂第37-38页
    2.2 患者全血样本收集及预处理第38页
    2.3 DNA提取及核酸定量第38-44页
        2.3.1 A549细胞系DNA提取第38-42页
        2.3.2 全血白细胞DNA提取第42-43页
        2.3.3 核酸定量第43-44页
    2.4 引物设计及合成第44-46页
        2.4.1 普通PCR引物设计第44-45页
        2.4.2 qPCR引物设计第45-46页
    2.5 重亚硫酸盐转化第46-47页
    2.6 q-MSP实验(荧光定量PCR绝对定量法)第47-61页
        2.6.1 绝对定量标准品模板制备第47-52页
        2.6.2 荧光定量PCR绝对定量标准品制备第52-58页
        2.6.3 荧光定量PCR绝对定量第58-61页
    2.7 SPSS软件处理、分析数据第61-62页
第三章 实验结果与分析第62-80页
    3.1 临床信息整理第62-64页
        3.1.1 样本信息汇总第62-64页
    3.2 全血样本DNA提取第64页
    3.3 阳性克隆鉴定结果第64-68页
        3.3.1 普通PCR琼脂糖凝胶电泳鉴定第64-66页
        3.3.2 阳性克隆进一步测序结果第66-68页
    3.4 肺癌患者中APC、PCDH20、RUNX3基因的DNA甲基化变化第68-69页
    3.5 不同地区患者中APC、PCDH20、RUNX3三个基因的DNA甲基化变化第69-71页
        3.5.1 三个基因的DNA甲基化变化与地区分布的关系第69-70页
        3.5.2 肺癌患者中RUNX3基因的DNA甲基化变化与地区分布的关系第70-71页
    3.6 烟煤燃烧对APC、PCDH20、RUNX3甲基化变化的影响第71-74页
        3.6.1 烟煤燃烧对三个基因的DNA甲基化变化的影响第71-73页
        3.6.2 烧煤年限对三个基因的DNA甲基化变化的影响第73-74页
    3.7 吸烟对APC、PCDH20、RUNX3基因的DNA甲基化影响第74-77页
        3.7.1 三个基因在吸烟者与非吸烟者中的DNA甲基化比较第74-75页
        3.7.2 三个基因在不同地区中吸烟者与非吸烟者中的DNA甲基化变化第75-76页
        3.7.3 三个基因在宣威地区中烟煤燃烧实验组里吸烟者与不吸烟者的DNA甲基化比较第76-77页
    3.8 RUNX3基因与各临床信息联合分析第77-80页
        3.8.1 RUNX3基因在性别的DNA甲基化变化第77-78页
        3.8.2 RUNX3基因在肺癌分型的DNA甲基化情况第78页
        3.8.3 RUNX3基因在肺癌分期中的DNA甲基化情况第78-79页
        3.8.4 RUNX3在不同地区中男性、女性的DNA甲基化变化第79-80页
第四章 讨论第80-82页
第五章 总结与展望第82-84页
    5.1 总结第82页
    5.2 展望第82-84页
致谢第84-86页
参考文献第86-91页
附录A 攻读硕士期间发表论文第91页

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