基于化学信息学的B-Raf激酶抑制剂计算研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-22页 |
| 1.1 ERK通路 | 第9-10页 |
| 1.2 B-Raf激酶 | 第10-13页 |
| 1.3 B-Raf激酶抑制剂研究进展 | 第13-16页 |
| 1.4 化学信息学 | 第16-22页 |
| 1.4.1 概述 | 第16-18页 |
| 1.4.2 三维定量构效关系 | 第18-19页 |
| 1.4.3 分子对接 | 第19-20页 |
| 1.4.4 分子动力学 | 第20-22页 |
| 2 数据和方法 | 第22-29页 |
| 2.1 分子数据集的建立 | 第22-24页 |
| 2.2 建模方法 | 第24-29页 |
| 2.2.1 分子叠合 | 第24-25页 |
| 2.2.2 分子力场计算 | 第25-26页 |
| 2.2.3 偏最小二乘法 | 第26-27页 |
| 2.2.4 分子对接模拟 | 第27-28页 |
| 2.2.5 分子动力学模拟 | 第28-29页 |
| 3 结果和讨论 | 第29-43页 |
| 3.1 CoMFA和CoMSIA模型统计结果分析 | 第29-31页 |
| 3.2 3D-QSAR等势图结果分析 | 第31-35页 |
| 3.3 分子对接结果分析 | 第35-40页 |
| 3.4 分子动力学结果 | 第40-42页 |
| 3.5 对接模式分析 | 第42-43页 |
| 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-50页 |
| 附录A 数据集中骨架为A的分子结构 | 第50-53页 |
| 附录B 数据集中骨架为B的分子结构 | 第53-54页 |
| 附录C 数据集中骨架为C的分子结构 | 第54-55页 |
| 附录D 数据集中骨架为D的分子结构 | 第55-56页 |
| 附录E 数据集中107号分子的结构 | 第56-57页 |
| 附录F 每个分子的最佳对接打分值 | 第57-58页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
