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干旱胁迫对不同种(品种)泡桐基因表达的影响

致谢第4-5页
摘要第5-9页
1 文献综述第9-16页
    1.1 遗传标记第9-10页
    1.2 遗传标记在泡桐属中的应用第10-11页
    1.3 泡桐抗旱研究第11-12页
    1.4 转录组学对干旱胁迫的研究进展第12-13页
        1.4.1 转录组学的定义第12页
        1.4.2 转录组学在植物抗旱研究中的应用第12-13页
    1.5 miRNA在干旱胁迫中的研究进展第13-15页
        1.5.1 miRNAs的特点第14页
        1.5.2 miRNA在植物干旱胁迫中的作用第14-15页
    1.6 本研究的主要内容和研究意义第15-16页
2 引言第16-17页
3 材料和方法第17-23页
    3.1 材料第17-18页
        3.1.1 植物材料第17页
        3.1.2 主要试剂第17-18页
        3.1.3 主要仪器设备第18页
    3.2 试验方法第18-23页
        3.2.1 Total RNA的提取及检测第18页
        3.2.2 泡桐转录组建库测序第18页
        3.2.3 信息分析流程第18-19页
        3.2.4 数据过滤和质控第19页
        3.2.5 比对情况分析第19页
        3.2.6 基因和转录本定量分析第19-20页
        3.2.7 差异表达基因的筛选第20页
        3.2.8 基因GO和pathway显著富集分析第20-21页
        3.2.9 sRNA文库的构建和测序第21页
        3.2.10 小RNA测序的数据分析及miRNA的预测和鉴定第21-23页
4 结果与分析第23-56页
    4.1 Clean数据碱基组成和质量分布图第23页
    4.2 转录组比对统计第23-27页
    4.3 sRNA库构建及分类注释第27-30页
    4.4 保守和特异miRNA的鉴定第30页
    4.5 4个种泡桐二、四倍体干旱处理前后共同表达的转录本及其富集分析第30-53页
        4.5.1 4个种泡桐二倍体转录本富集分析及其亲缘关系分析第33-38页
        4.5.2 4个种泡桐二倍体干旱处理转录本富集分析及其亲缘关系分析第38-43页
        4.5.3 4个种泡桐四倍体转录本富集分析及其亲缘关系分析第43-48页
        4.5.4 4个种泡桐四倍体干旱处理转录本富集分析及其亲缘关系分析第48-53页
    4.6 泡桐四个种二、四倍体干旱胁迫转录本差异表达及其富集分析第53-56页
5 结论与讨论第56-60页
    5.1 干旱胁迫不同种泡桐种(品种)响应基因筛选第56页
    5.2 干旱胁迫下不同种泡桐基因表达相关性第56-58页
    5.3 不同种泡桐遗传分析第58-60页
6 参考文献第60-66页
ABSTRACT第66-67页
附录第68-76页

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