致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-9页 |
1 文献综述 | 第9-16页 |
1.1 遗传标记 | 第9-10页 |
1.2 遗传标记在泡桐属中的应用 | 第10-11页 |
1.3 泡桐抗旱研究 | 第11-12页 |
1.4 转录组学对干旱胁迫的研究进展 | 第12-13页 |
1.4.1 转录组学的定义 | 第12页 |
1.4.2 转录组学在植物抗旱研究中的应用 | 第12-13页 |
1.5 miRNA在干旱胁迫中的研究进展 | 第13-15页 |
1.5.1 miRNAs的特点 | 第14页 |
1.5.2 miRNA在植物干旱胁迫中的作用 | 第14-15页 |
1.6 本研究的主要内容和研究意义 | 第15-16页 |
2 引言 | 第16-17页 |
3 材料和方法 | 第17-23页 |
3.1 材料 | 第17-18页 |
3.1.1 植物材料 | 第17页 |
3.1.2 主要试剂 | 第17-18页 |
3.1.3 主要仪器设备 | 第18页 |
3.2 试验方法 | 第18-23页 |
3.2.1 Total RNA的提取及检测 | 第18页 |
3.2.2 泡桐转录组建库测序 | 第18页 |
3.2.3 信息分析流程 | 第18-19页 |
3.2.4 数据过滤和质控 | 第19页 |
3.2.5 比对情况分析 | 第19页 |
3.2.6 基因和转录本定量分析 | 第19-20页 |
3.2.7 差异表达基因的筛选 | 第20页 |
3.2.8 基因GO和pathway显著富集分析 | 第20-21页 |
3.2.9 sRNA文库的构建和测序 | 第21页 |
3.2.10 小RNA测序的数据分析及miRNA的预测和鉴定 | 第21-23页 |
4 结果与分析 | 第23-56页 |
4.1 Clean数据碱基组成和质量分布图 | 第23页 |
4.2 转录组比对统计 | 第23-27页 |
4.3 sRNA库构建及分类注释 | 第27-30页 |
4.4 保守和特异miRNA的鉴定 | 第30页 |
4.5 4个种泡桐二、四倍体干旱处理前后共同表达的转录本及其富集分析 | 第30-53页 |
4.5.1 4个种泡桐二倍体转录本富集分析及其亲缘关系分析 | 第33-38页 |
4.5.2 4个种泡桐二倍体干旱处理转录本富集分析及其亲缘关系分析 | 第38-43页 |
4.5.3 4个种泡桐四倍体转录本富集分析及其亲缘关系分析 | 第43-48页 |
4.5.4 4个种泡桐四倍体干旱处理转录本富集分析及其亲缘关系分析 | 第48-53页 |
4.6 泡桐四个种二、四倍体干旱胁迫转录本差异表达及其富集分析 | 第53-56页 |
5 结论与讨论 | 第56-60页 |
5.1 干旱胁迫不同种泡桐种(品种)响应基因筛选 | 第56页 |
5.2 干旱胁迫下不同种泡桐基因表达相关性 | 第56-58页 |
5.3 不同种泡桐遗传分析 | 第58-60页 |
6 参考文献 | 第60-66页 |
ABSTRACT | 第66-67页 |
附录 | 第68-76页 |