| 缩略词 | 第7-9页 |
| 论文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 第一部分 空肠弯曲菌荚膜多糖遗传特异性分析及其PCR检测方法的建立 | 第13-46页 |
| 1 前言 | 第13-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-27页 |
| 2.1 材料 | 第15-18页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第15-16页 |
| 2.1.2 主要仪器耗材 | 第16-17页 |
| 2.1.3 主要试剂及溶液 | 第17-18页 |
| 2.2 方法 | 第18-27页 |
| 2.2.1 试剂盒提取弯曲菌基因组DNA | 第18-19页 |
| 2.2.2 试剂盒法血清型鉴定实验步骤 | 第19页 |
| 2.2.3 全基因组测序流程 | 第19-21页 |
| 2.2.4 基于核心基因组的SNP的NJ树构建 | 第21页 |
| 2.2.5 全基因组测序及CPS位点序列的获得 | 第21-24页 |
| 2.2.6 CPS合成相关基因簇聚类建 | 第24页 |
| 2.2.7 直系同源分配 | 第24页 |
| 2.2.8 CPS相关序列比对和PCR的开发 | 第24-26页 |
| 2.2.9 多重PCR检测验证 | 第26-27页 |
| 3 结果 | 第27-40页 |
| 3.1 全基因组NJ树 | 第27页 |
| 3.2 CPS的系统发育和遗传多样性 | 第27-33页 |
| 3.2.1 CPS合成相关基因簇的NJ树构建 | 第29-30页 |
| 3.2.2 CPS遗传多样性 | 第30-33页 |
| 3.3 CPS同源基因的多样性 | 第33-35页 |
| 3.4 GBS相关血清型CPS合成相关基因簇序列特征及特异序列 | 第35页 |
| 3.5 多重PCR方法验证血清型建立 | 第35-40页 |
| 4 讨论 | 第40-45页 |
| 5 小结 | 第45-46页 |
| 第二部分 弯曲菌多位点序列分型及宿主归因分析 | 第46-65页 |
| 1 前言 | 第46-48页 |
| 2 材料与方法 | 第48-55页 |
| 2.1. 材料 | 第48-51页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第48-50页 |
| 2.1.2 主要仪器、耗材 | 第50页 |
| 2.1.3 主要试剂及溶剂 | 第50-51页 |
| 2.2 方法 | 第51-55页 |
| 2.2.1 MLST PCR扩增基因以及引物序列 | 第51-52页 |
| 2.2.2 MLST分析用基因测序引物序列 | 第52-53页 |
| 2.2.3 PCR体系配制 | 第53-54页 |
| 2.2.4 PCR扩增程序 | 第54页 |
| 2.2.5 PCR产物电泳验证和纯化 | 第54页 |
| 2.2.6 ST(Sequence Type)型别确定 | 第54页 |
| 2.2.7 基于MLST结果的种群遗传距离分析和宿主归因分析 | 第54-55页 |
| 3 结果 | 第55-62页 |
| 3.1 中国菌株ST型分布频数 | 第55-56页 |
| 3.2 空肠弯曲菌归因分析结果 | 第56-59页 |
| 3.2.1 中国菌株分子方差分析结果 | 第56-57页 |
| 3.2.2 中国临床分离株宿主归因 | 第57页 |
| 3.2.3 不同国家地区C.jejuni临床株分子方差分析 | 第57-58页 |
| 3.2.4 中国临床分离株与国外来源菌株归因分析 | 第58-59页 |
| 3.3 结肠弯曲菌归因分析结果 | 第59-61页 |
| 3.3.1 中国菌株分子方差分析结果 | 第59页 |
| 3.3.2 中国临床分离株宿主归因 | 第59-60页 |
| 3.3.3 不同国家地区C.coli临床株分子方差分析 | 第60页 |
| 3.2.4 中国临床分离株与国外来源菌株归因分析 | 第60-61页 |
| 3.4 中国主要宿主菌株与国外菌株菌株种群遗传距离 | 第61-62页 |
| 4 讨论 | 第62-64页 |
| 5 小结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 综述 | 第70-76页 |
| 参考文献 | 第74-76页 |
| 附录 | 第76-95页 |
| 硕士研究生期间主要成果 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
