| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-11页 |
| 第1章 引言 | 第11-27页 |
| 1.1 表观遗传学简介 | 第11-15页 |
| 1.1.1 DNA甲基化 | 第11-12页 |
| 1.1.2 染色质高级结构 | 第12-13页 |
| 1.1.3 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA) | 第13-14页 |
| 1.1.4 组蛋白翻译后修饰 | 第14-15页 |
| 1.2 组蛋白甲基化 | 第15-20页 |
| 1.2.1 组蛋白甲基化酶和去甲基化酶 | 第15-17页 |
| 1.2.2 组蛋白甲基化的生物学功能 | 第17-20页 |
| 1.3 表观遗传信息遗传 | 第20-23页 |
| 1.3.1 父母代谢改变引起的表观遗传信息的遗传 | 第20-21页 |
| 1.3.2 环境压力引起的表观遗传信息的遗传 | 第21页 |
| 1.3.3 RNA介导的表观遗传信息的遗传 | 第21-22页 |
| 1.3.4 组蛋白修饰的跨代遗传 | 第22-23页 |
| 1.4 ChIP-seq技术概述 | 第23-26页 |
| 1.5 研究目的与研究意义 | 第26-27页 |
| 第2章 材料与方法 | 第27-38页 |
| 2.1 实验材料 | 第27-32页 |
| 2.1.1 样品来源及基本信息 | 第27-28页 |
| 2.1.2 实验试剂与耗材 | 第28-29页 |
| 2.1.3 常用试剂配置 | 第29-31页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第31-32页 |
| 2.2 实验方法 | 第32-33页 |
| 2.2.1 人外周血淋巴细胞分离 | 第32页 |
| 2.2.2 ChIP-seq实验 | 第32-33页 |
| 2.3 数据分析 | 第33-38页 |
| 2.3.1 测序质量检测 | 第34-35页 |
| 2.3.2 数据过滤 | 第35页 |
| 2.3.3 将测序数据比对到参考基因组上 | 第35页 |
| 2.3.4 Peak Calling | 第35-36页 |
| 2.3.5 样品重复间处理及相关性计算 | 第36页 |
| 2.3.6 统计peak在功能元件以及TSS附近的富集情况 | 第36页 |
| 2.3.7 保守绑定位点分析 | 第36-37页 |
| 2.3.8 差异绑定位点分析 | 第37页 |
| 2.3.9 GO注释分析 | 第37-38页 |
| 第3章 结果与分析 | 第38-57页 |
| 3.1 ChIP-seq数据预处理 | 第38-46页 |
| 3.1.1 ChIP-seq数据比对信息统计 | 第38-42页 |
| 3.1.2 Peak信息统计 | 第42-46页 |
| 3.2 组蛋白甲基化绑定位点整体特征 | 第46-50页 |
| 3.2.1 同种修饰不同个体具有相似性 | 第46-47页 |
| 3.2.2 组蛋白甲基化有功能元件的共定位分析 | 第47-49页 |
| 3.2.3 Peak长度统计 | 第49-50页 |
| 3.3 组蛋白甲基化相对保守位点找寻 | 第50-52页 |
| 3.4 家庭特异的组蛋白甲基化绑定位点找寻 | 第52-54页 |
| 3.5 样品差异绑定位点聚类分析 | 第54-57页 |
| 第4章 结论与讨论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-70页 |
| 作者简历及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第70页 |