摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
1 引言 | 第11-19页 |
1.1 研究背景 | 第11页 |
1.2 文献综述 | 第11-19页 |
1.2.1 毛囊发育相关microRNA | 第13-14页 |
1.2.2 microRNA研究思路 | 第14-15页 |
1.2.3 microRNA生物学特性 | 第15-17页 |
1.2.4 技术路线 | 第17页 |
1.2.5 研究目的意义 | 第17-19页 |
2 高通量测序筛选绒山羊胎儿期毛囊发生发育相关microRNA | 第19-36页 |
2.1 试验材料 | 第19页 |
2.2 试验方法 | 第19页 |
2.3 结果与分析 | 第19-35页 |
2.3.1 高通量筛选数据建库 | 第19-22页 |
2.3.1.1 方法简介 | 第19-20页 |
2.3.1.2 建库部分结果展示 | 第20页 |
2.3.1.3 样本信息 | 第20-21页 |
2.3.1.4 测序数据 | 第21-22页 |
2.3.2 small RNA高通量测序结果-基础分析 | 第22-33页 |
2.3.2.1 sRNA-seq数据分析流程 | 第22页 |
2.3.2.2 Small RNA-seq Clean reads测序质量分析 | 第22-27页 |
2.3.2.3 全基因组定位分析 | 第27-29页 |
2.3.2.4 比对到到Rfam中 | 第29-31页 |
2.3.2.5 microRNA分析 | 第31页 |
2.3.2.6 microRNA比对分析 | 第31-33页 |
2.3.3 microRNA差异表达分析方案与结果 | 第33-35页 |
2.3.3.1 标准DEmicroRNA分析流程 | 第33页 |
2.3.3.2 样本相关性分析 | 第33-34页 |
2.3.3.3 DEmicroRNA(差异表达的microRNA)分析 | 第34-35页 |
2.4 讨论 | 第35页 |
2.5 小结 | 第35-36页 |
3 生物信息学预测绒山羊胎儿期毛囊发生发育相关microRNA靶基因 | 第36-42页 |
3.1 试验材料 | 第36页 |
3.2 试验方法 | 第36页 |
3.3 结果与分析 | 第36-41页 |
3.3.1 DEmicroRNA靶基因预测 | 第36页 |
3.3.2 Co-DEmicroRNA分析 | 第36-37页 |
3.3.3 DEmiR靶基因和DEG之间的关联分析 | 第37-38页 |
3.3.4 DEmiR靶基因和DEG重叠的基因的功能分析 | 第38-41页 |
3.3.4.1 妊娠55天样本与妊娠45天样本相比 | 第38-40页 |
3.3.4.2 妊娠65天样本与妊娠55天样本相比 | 第40页 |
3.3.4.3 妊娠65天样本与妊娠45天样本相比 | 第40-41页 |
3.4 讨论 | 第41页 |
3.5 小结 | 第41-42页 |
4 qPCR分析绒山羊胎儿期毛囊不同时期microRNA和mRNA表达数据 | 第42-49页 |
4.1 试验材料 | 第42页 |
4.1.1 试验样品 | 第42页 |
4.1.2 主要试剂和仪器 | 第42页 |
4.2 试验方法 | 第42-44页 |
4.2.1 总RNA的提取 | 第42-43页 |
4.2.2 cDNA合成 | 第43页 |
4.2.3 实时定量PCR | 第43-44页 |
4.3 结果与分析 | 第44-47页 |
4.3.1 毛囊发生发育关键候选基因在不同时期胎儿皮肤中的表达谱分析 | 第44-46页 |
4.3.2 靶基因在不同时期胎儿皮肤中的表达谱分析 | 第46-47页 |
4.4 讨论 | 第47页 |
4.5 小结 | 第47-49页 |
5 全文结论、创新点 | 第49-50页 |
5.1 结论 | 第49页 |
5.2 创新点 | 第49-50页 |
致谢 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
作者简介 | 第57页 |