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绒山羊胎儿期毛囊发育相关microRNA的筛选与鉴定

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 引言第11-19页
    1.1 研究背景第11页
    1.2 文献综述第11-19页
        1.2.1 毛囊发育相关microRNA第13-14页
        1.2.2 microRNA研究思路第14-15页
        1.2.3 microRNA生物学特性第15-17页
        1.2.4 技术路线第17页
        1.2.5 研究目的意义第17-19页
2 高通量测序筛选绒山羊胎儿期毛囊发生发育相关microRNA第19-36页
    2.1 试验材料第19页
    2.2 试验方法第19页
    2.3 结果与分析第19-35页
        2.3.1 高通量筛选数据建库第19-22页
            2.3.1.1 方法简介第19-20页
            2.3.1.2 建库部分结果展示第20页
            2.3.1.3 样本信息第20-21页
            2.3.1.4 测序数据第21-22页
        2.3.2 small RNA高通量测序结果-基础分析第22-33页
            2.3.2.1 sRNA-seq数据分析流程第22页
            2.3.2.2 Small RNA-seq Clean reads测序质量分析第22-27页
            2.3.2.3 全基因组定位分析第27-29页
            2.3.2.4 比对到到Rfam中第29-31页
            2.3.2.5 microRNA分析第31页
            2.3.2.6 microRNA比对分析第31-33页
        2.3.3 microRNA差异表达分析方案与结果第33-35页
            2.3.3.1 标准DEmicroRNA分析流程第33页
            2.3.3.2 样本相关性分析第33-34页
            2.3.3.3 DEmicroRNA(差异表达的microRNA)分析第34-35页
    2.4 讨论第35页
    2.5 小结第35-36页
3 生物信息学预测绒山羊胎儿期毛囊发生发育相关microRNA靶基因第36-42页
    3.1 试验材料第36页
    3.2 试验方法第36页
    3.3 结果与分析第36-41页
        3.3.1 DEmicroRNA靶基因预测第36页
        3.3.2 Co-DEmicroRNA分析第36-37页
        3.3.3 DEmiR靶基因和DEG之间的关联分析第37-38页
        3.3.4 DEmiR靶基因和DEG重叠的基因的功能分析第38-41页
            3.3.4.1 妊娠55天样本与妊娠45天样本相比第38-40页
            3.3.4.2 妊娠65天样本与妊娠55天样本相比第40页
            3.3.4.3 妊娠65天样本与妊娠45天样本相比第40-41页
    3.4 讨论第41页
    3.5 小结第41-42页
4 qPCR分析绒山羊胎儿期毛囊不同时期microRNA和mRNA表达数据第42-49页
    4.1 试验材料第42页
        4.1.1 试验样品第42页
        4.1.2 主要试剂和仪器第42页
    4.2 试验方法第42-44页
        4.2.1 总RNA的提取第42-43页
        4.2.2 cDNA合成第43页
        4.2.3 实时定量PCR第43-44页
    4.3 结果与分析第44-47页
        4.3.1 毛囊发生发育关键候选基因在不同时期胎儿皮肤中的表达谱分析第44-46页
        4.3.2 靶基因在不同时期胎儿皮肤中的表达谱分析第46-47页
    4.4 讨论第47页
    4.5 小结第47-49页
5 全文结论、创新点第49-50页
    5.1 结论第49页
    5.2 创新点第49-50页
致谢第50-51页
参考文献第51-57页
作者简介第57页

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