| 英汉缩略语名词对照 | 第1-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| 英文摘要 | 第9-12页 |
| 前言 | 第12-14页 |
| 第一部分 基因芯片及其数据分析概述 | 第14-17页 |
| 1 生物信息学与基因芯片简介 | 第14页 |
| 2 基因芯片原理简介 | 第14-15页 |
| 3 基因芯片实验结果的数据表达形式 | 第15页 |
| 4 数据预处理 | 第15-17页 |
| 第二部分 显著性分析(Significant Analysis of Microarray, SAM)方法 | 第17-22页 |
| 1 置换检验(Permutation Test)方法简介 | 第17-18页 |
| 2 显著性分析(Significance Analysis of Microarray, SAM)方法 | 第18-22页 |
| 第三部分 顶级评分基因对(Top-Scored Pair, TSP)方法 | 第22-26页 |
| 1 顶级评分基因对(Top-Scored Pair, TSP)方法简介 | 第22页 |
| 2 TSP 方法的计算过程 | 第22-23页 |
| 3 TSP 方法的编程实现 | 第23-26页 |
| 第四部分 关联规则(Association Rule)方法 | 第26-30页 |
| 1 关联规则分析简介 | 第26页 |
| 2 将关联规则分析应用于基因芯片数据分析 | 第26-27页 |
| 3 产生基因表达变化数据 | 第27页 |
| 4 关联规则的Apriori 算法 | 第27-30页 |
| 第五部分 协同过滤(Collaborative Filtering)方法 | 第30-35页 |
| 1 协同过滤方法简介 | 第30页 |
| 2 协同过滤计算步骤 | 第30-32页 |
| 3 将协同过滤方法应用于基因芯片数据分析 | 第32-33页 |
| 4 编程实现 | 第33-35页 |
| 第六部分 数据分析结果 | 第35-44页 |
| 1 NCBI 数据库简介 | 第35页 |
| 2 数据来源与处理过程 | 第35-36页 |
| 3 结果分析 | 第36-40页 |
| 4 讨论与展望 | 第40-44页 |
| 结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-47页 |
| 文献综述 基因芯片数据分析综述 | 第47-52页 |
| 参考文献 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第53-54页 |
